摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6页 |
插图索引 | 第9-10页 |
附表索引 | 第10-11页 |
第1章 绪论 | 第11-17页 |
1.1 研究背景和意义 | 第11-13页 |
1.2 挑战及研究现状 | 第13-16页 |
1.2.1 基因芯片数据分析面临的挑战 | 第13-14页 |
1.2.2 现状分析 | 第14-16页 |
1.3 本文主要工作 | 第16页 |
1.4 本文章节安排 | 第16-17页 |
第2章 基因芯片表达数据的基础知识及整合方法 | 第17-35页 |
2.1 基因芯片表达数据的基础知识 | 第17-24页 |
2.1.1 基因芯片数据简介及原理 | 第17-18页 |
2.1.2 基因表达数据处理流程 | 第18-22页 |
2.1.3 基因表达数据的应用 | 第22-23页 |
2.1.4 基因芯片的网络资源 | 第23-24页 |
2.2 多平台基因芯片表达数据整合流程 | 第24-26页 |
2.3 芯片数据整合方法介绍 | 第26-33页 |
2.3.1 中位值整合法(Median Rank Score, MRS) | 第26-29页 |
2.3.2 分位数离散法(Quantile Discretization, QD) | 第29-30页 |
2.3.3 基于排序整合方法 (Rank-based, RB) | 第30-33页 |
2.4 小结 | 第33-35页 |
第3章 基于倍数的多平台基因芯片表达数据整合方法 | 第35-48页 |
3.1 引言 | 第35页 |
3.2 基于倍数的整合方法 | 第35-38页 |
3.2.1 方法基本思想 | 第35-36页 |
3.2.2 方法步骤 | 第36-37页 |
3.2.3 方法举例 | 第37-38页 |
3.2.4 部分代码实现 | 第38页 |
3.3 测试与结果分析 | 第38-46页 |
3.3.1 实验数据集及预处理 | 第38-40页 |
3.3.2 数据整合 | 第40页 |
3.3.3 特征选择 | 第40-42页 |
3.3.4 基于支持向量机的分类 | 第42页 |
3.3.5 结果分析 | 第42-46页 |
3.4 小结 | 第46-48页 |
第4章 基于倍数归一化的两级整合方法 | 第48-55页 |
4.1 引言 | 第48页 |
4.2 基于倍数归一化的两级整合方法 | 第48-50页 |
4.2.1 方法基本思想 | 第48-49页 |
4.2.2 方法设计 | 第49-50页 |
4.3 测试与结果分析 | 第50-54页 |
4.3.1 实验数据集与分析方法 | 第50页 |
4.3.2 实验步骤 | 第50页 |
4.3.3 结果分析 | 第50-54页 |
4.4 小结 | 第54-55页 |
结论 | 第55-57页 |
参考文献 | 第57-62页 |
附录A 攻读硕士期间完成的学术论文 | 第62-63页 |
附录B 攻读硕士期间参加的科研项目 | 第63-64页 |
致谢 | 第64页 |