| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第11-17页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-15页 |
| 1.3 本文主要工作 | 第15-16页 |
| 1.4 本文组织结构 | 第16-17页 |
| 第2章 蛋白质复合物识别算法综述 | 第17-23页 |
| 2.1 引言 | 第17-18页 |
| 2.2 传统的蛋白质复合物识别算法研究 | 第18-20页 |
| 2.2.1 基于图划分的聚类算法 | 第18页 |
| 2.2.2 基于密度的局部搜索聚类算法 | 第18-19页 |
| 2.2.3 基于层次聚类的算法 | 第19-20页 |
| 2.3 利用多元生物信息的蛋白质复合物识别算法研究 | 第20-22页 |
| 2.3.1 基因表达数据识别蛋白质复合物 | 第20页 |
| 2.3.2 核心-外围结构识别蛋白质复合物 | 第20-22页 |
| 2.4 小结 | 第22-23页 |
| 第3章 基于基因本体的蛋白质复合物识别算法 | 第23-39页 |
| 3.1 引言 | 第23页 |
| 3.2 基因本体介绍 | 第23-24页 |
| 3.3 相关定义 | 第24-26页 |
| 3.3.1 蛋白质之间的功能相似性 | 第24-25页 |
| 3.3.2 二级邻居图 | 第25页 |
| 3.3.3 度数 | 第25页 |
| 3.3.4 密度 | 第25-26页 |
| 3.4 MCGO 算法描述 | 第26-28页 |
| 3.5 实验结果与分析 | 第28-38页 |
| 3.5.1 实验数据 | 第28-29页 |
| 3.5.2 衡量指标 | 第29-31页 |
| 3.5.3 性能评估 | 第31-37页 |
| 3.5.4 参数对 MCGO 算法性能的影响 | 第37-38页 |
| 3.6 小结 | 第38-39页 |
| 第4章 基因本体和拓扑特性相结合的蛋白质复合物识别算法 | 第39-51页 |
| 4.1 引言 | 第39页 |
| 4.2 相关定义 | 第39-40页 |
| 4.2.1 边聚集系数 | 第39-40页 |
| 4.2.2 图的相似性 | 第40页 |
| 4.3 MGOTC 算法描述 | 第40-43页 |
| 4.4 实验结果与分析 | 第43-50页 |
| 4.4.1 实验数据 | 第43页 |
| 4.4.2 性能评估 | 第43-48页 |
| 4.4.3 参数对 MGOTC 算法性能的影响 | 第48-50页 |
| 4.6 小结 | 第50-51页 |
| 结论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 附录 A 攻读学位期间所发表的学术论文 | 第59-60页 |
| 附录 B 攻读学位期间参加的科研项目 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |