| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 英文缩写表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1 不定芽器官发生研究进展 | 第11-16页 |
| 1.1 不定芽器官发生调控机制 | 第11-12页 |
| 1.2 不定芽器官发生转录组学研究 | 第12-13页 |
| 1.3 不定芽器官发生过程中的关键基因 | 第13-16页 |
| 2 苎麻不定芽器官发生研究进展 | 第16-17页 |
| 2.1 基因型对苎麻不定芽器官发生的影响 | 第16-17页 |
| 2.2 激素对不定芽器官发生的影响 | 第17页 |
| 3 苎麻转录组学研究进展 | 第17-18页 |
| 4 生长素信号通路相关基因研究进展 | 第18-22页 |
| 4.1 生长素信号通路研究进展 | 第18-19页 |
| 4.2 Aux/IAA、ARF和LBD基因家族对植物发育的调控 | 第19-20页 |
| 4.3 SAUR基因家族对植物发育的调控 | 第20-21页 |
| 4.4 AUX/LAX和PIN家族对植物发育的调控 | 第21-22页 |
| 5 课题的提出 | 第22-23页 |
| 第二章 苎麻不定芽器官发生转录组学研究 | 第23-45页 |
| 1 引言 | 第23页 |
| 2 材料和方法 | 第23-28页 |
| 2.1 外植体制备 | 第23-25页 |
| 2.2 RNA提取及质量评估 | 第25页 |
| 2.3 转录组测序文库构建及测序 | 第25页 |
| 2.4 测序数据质量评估 | 第25-26页 |
| 2.5 转录本拼接和基因功能注释 | 第26页 |
| 2.6 数字基因表达谱分析 | 第26页 |
| 2.7 实时定量PCR分析 | 第26-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-41页 |
| 3.1 实验材料和取样时期的选择 | 第28页 |
| 3.2 RNA提取及质量检测 | 第28-29页 |
| 3.3 苎麻不定芽器官发生参考转录组数据库的构建 | 第29-32页 |
| 3.4 苎麻不定芽器官发生差异表达基因分析 | 第32-37页 |
| 3.5 苎麻不定芽器官发生差异表达转录因子分析 | 第37页 |
| 3.6 苎麻不定芽器官发生中生长素和细胞分裂素信号通路 | 第37-38页 |
| 3.7 实时定量PCR验证 | 第38-40页 |
| 3.8 实时定量PCR分析与数字基因表达谱数据的比较 | 第40页 |
| 3.9 苎麻生长素和细胞分裂素相关基因与拟南芥同源基因表达模式的比较 | 第40-41页 |
| 4 讨论 | 第41-45页 |
| 4.1 转录组参考数据库质量评估 | 第41页 |
| 4.2 差异表达基因分析 | 第41-42页 |
| 4.3 苎麻不定芽器官发生过程中的转录调控 | 第42-43页 |
| 4.4 苎麻不定芽器官发生过程中的生长素和细胞分裂素信号通路 | 第43-45页 |
| 第三章 苎麻生长素信号通路相关基因的鉴定 | 第45-68页 |
| 1 引言 | 第45-46页 |
| 2 材料和方法 | 第46-48页 |
| 2.1 基因序列检索及编码序列预测及亚细胞定位分析 | 第46页 |
| 2.2 蛋白质序列遗传进化和保守功能域分析 | 第46-47页 |
| 2.3 转录组表达分析 | 第47页 |
| 2.4 植物材料和处理 | 第47页 |
| 2.5 实时定量PCR分析 | 第47-48页 |
| 3 结果与分析 | 第48-66页 |
| 3.1 苎麻和桑树中生长素相关基因的鉴定 | 第48页 |
| 3.2 拟南芥、苎麻和桑树生长素相关基因的遗传进化分析 | 第48-54页 |
| 3.3 苎麻生长素相关基因的保守功能域分析 | 第54-56页 |
| 3.4 苎麻生长素相关基因的转录组测序表达分析 | 第56-59页 |
| 3.5 苎麻生长素相关基因的实时定量PCR分析 | 第59-66页 |
| 4 讨论 | 第66-68页 |
| 4.1 苎麻生长素相关基因的鉴定 | 第66页 |
| 4.2 SAUR基因家族的物种特异性扩张 | 第66页 |
| 4.3 IAA响应的苎麻生长素相关基因 | 第66-67页 |
| 4.4 非生物逆境胁迫响应的苎麻生长素相关基因 | 第67-68页 |
| 第四章 主要结论及展望 | 第68-71页 |
| 1 主要结论 | 第68-69页 |
| 1.1 苎麻不定芽器官发生转录组学研究 | 第68页 |
| 1.2 苎麻生长素信号通路相关基因的鉴定 | 第68-69页 |
| 2 展望 | 第69-71页 |
| 2.1 转录组学方法发掘苎麻不定芽器官发生关键基因 | 第69页 |
| 2.2 苎麻不定芽器官发生转录调控网络构建 | 第69-70页 |
| 2.3 生长素信号通路在植物中的进化 | 第70页 |
| 2.4 生长素信号通路相关基因在苎麻纤维发育中的研究前景 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-90页 |
| 附录I | 第90-107页 |
| 附表 1：第二章实时定量PCR所用引物 | 第90-91页 |
| 附表 2：5760条差异表达基因在不同发育时期表达水平和注释信息 | 第91-92页 |
| 附表 3：差异表达转录因子注释信息 | 第92-97页 |
| 附表 4：生长素和细胞分裂素信号通路相关基因注释情况及其对应拟南芥同源序列 | 第97-99页 |
| 附表 5：第三章实时定量PCR所用引物 | 第99-101页 |
| 附表 6：桑树生长素相关基因 | 第101-104页 |
| 附表 7：3 个数据库中苎麻生长素相关基因序列 | 第104-107页 |
| 附录II 攻读博士期间发表文章 | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
