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猪博卡病毒多重PCR检测和分型研究

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
第一章 绪论第13-21页
    1.1 PBoV的发现第13页
    1.2 PBoV的分类第13-15页
    1.3 PBoV的分子生物学特性第15-16页
    1.4 PBoV的流行病学调查和疾病相关性第16-18页
        1.4.1 国内PBoV的流行情况第16-17页
        1.4.2 国外PBoV的流行情况第17-18页
    1.5 PBoV的检测技术第18-21页
        1.5.1 环介导等温扩增技术第18页
        1.5.2 间接免疫荧光法第18-19页
        1.5.3 聚合酶链式反应第19页
        1.5.4 实时荧光定量聚合酶链式反应第19-21页
第二章 PBoV多重PCR检测和基因分型研究的实验方案设计第21-24页
    2.1 本研究的目的、意义第21页
    2.2 实验主要内容第21-23页
        2.2.1 引物设计第21-22页
        2.2.2 标准品构建及普通多重PCR构建第22页
        2.2.3 三个PBoV基因群组单重实时荧光PCR体系的优化和建立第22页
        2.2.4 多重实时荧光PCR体系同时检测三个PBoV基因群组的优化和建立第22-23页
    2.3 实验流程第23-24页
第三章 PBoV多重PCR检测方法的建立和应用第24-36页
    3.1 实验材料第24-25页
        3.1.1 病毒和临床样品第24-25页
        3.1.2 主要试剂第25页
        3.1.3 主要仪器设备第25页
    3.2 引物设计第25-26页
    3.3 病毒核酸提取和质粒标准品制备第26-27页
        3.3.1 PBoV DNA提取第26页
        3.3.2 PCR反应第26页
        3.3.3 PCR产物割胶回收第26页
        3.3.4 PCR目的片段连接第26页
        3.3.5 连接产物转化第26页
        3.3.6 重组质粒提取第26-27页
        3.3.7 重组质粒鉴定第27页
        3.3.8 重组质粒标准品制备第27页
    3.4 PBoV多重PCR体系建立第27-28页
        3.4.1 PBoV多重PCR体系优化第27页
        3.4.2 PBoV多重PCR灵敏度和特异性第27-28页
    3.5 PBoV临床样品多重PCR检测第28页
        3.5.1 样品核酸提取第28页
        3.5.2 临床样品检测第28页
    3.6 结果第28-33页
        3.6.1 PBoV序列系统发育树分析图第28-30页
        3.6.2 标准品构建第30页
        3.6.3 PBoV多重PCR体系优化第30-31页
        3.6.4 PBoV G1, PboV G2和G3 Pbo V多重PCR特异性和灵敏度第31-33页
        3.6.5 临床样品单重和多重普通PCR检测第33页
    3.7 讨论第33-36页
第四章 EvaGreen多重实时荧光PCR检测PBoV三个基因群组方法的建立和应用第36-56页
    4.1 实验材料第36-37页
        4.1.1 毒源第36-37页
        4.1.2 主要试剂第37页
        4.1.3 主要仪器设备第37页
    4.2 引物设计第37-38页
    4.3 PBoV EvaGreen单重实时荧光PCR第38-39页
        4.3.1 PBoV单重荧光PCR特异性及产物Tm值第38页
        4.3.2 PBoV单重荧光PCR灵敏度及重复性第38-39页
    4.4 PBoVEvaGreen多重实时荧光PCR第39-40页
        4.4.1 PBoV多重荧光PCR特异性及产物Tm值第39页
        4.4.2 PBoV多重荧光PCR灵敏度及重复性第39-40页
    4.5 PBoVEvaGreen多重实时荧光PCR方法检测临床样品第40页
        4.5.1 临床样品及样品核酸提取第40页
        4.5.2 临床样品检测第40页
    4.6 结果第40-52页
        4.6.1 PBoV单重实时荧光PCR的扩增产物Tm值第40-41页
        4.6.2 PBoV单重实时荧光PCR特异性第41-42页
        4.6.3 PBoV单重实时荧光PCR灵敏度及标准曲线第42-43页
        4.6.4 PBoV单重实时荧光PCR重复性第43-45页
        4.6.5 PBoV多重实时荧光PCR的扩增产物Tm值第45页
        4.6.6 PBoV多重实时荧光PCR特异性第45-46页
        4.6.7 单个PBoV模板多重实时荧光PCR灵敏度及标准曲线第46-48页
        4.6.8 多个PBoV模板多重实时荧光PCR灵敏度第48-49页
        4.6.9 PBoV多重实时荧光PCR重复性第49-50页
        4.6.10 PBoV临床样品实时荧光PCR检测第50-52页
    4.7 讨论第52-56页
第五章 PBoV遗传多样性分析第56-63页
    5.1 材料和方法第56页
    5.2 结果第56-61页
    5.3 讨论第61-63页
结论与展望第63-64页
参考文献第64-68页
研究生学习期间主要成果第68-69页
致谢第69页

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