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类泛素蛋白NEDD8赖氨酸功能研究和修饰底物鉴定

中文摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 前言第11-13页
第二章 NEDD8 突变体通过阻断neddylation酶促反应抑制CRL E3 泛素连接酶的活性第13-42页
    2.1 实验材料第13-16页
        2.1.1 细胞系第13页
        2.1.2 主要试剂第13-14页
        2.1.3 主要仪器第14-15页
        2.1.4 主要抗体第15-16页
    2.2 实验方法第16-27页
        2.2.1 主要试剂的配制第16-19页
        2.2.2 细胞培养第19-20页
        2.2.3 RNA提取第20页
        2.2.4 第一链cDNA合成第20-21页
        2.2.5 3XHA-NEDD8 质粒的构建第21-23页
        2.2.6 3XHA-NEDD8 突变体的构建第23-24页
        2.2.7 E1、E2、E3 和底物质粒的构建第24-26页
        2.2.8 PEI质粒转染第26页
        2.2.9 蛋白免疫印迹第26页
        2.2.10 免疫共沉淀第26-27页
        2.2.11 Strep-Tactin树脂纯化蛋白第27页
    2.3 实验结果第27-41页
        2.3.1 NEDD8 结构序列分析第27-29页
        2.3.2 K27R NEDD8 突变体抑制蛋白质neddylation修饰第29-30页
        2.3.3 K27R NEDD8 突变体未影响NEDD8 的激活过程第30-32页
        2.3.4 K27R NEDD8 突变体影响了NEDD8 的结合过程第32-34页
        2.3.5 验证UBE2M与K27R NEDD8 突变体的结合第34-35页
        2.3.6 验证Cul1、Cul4A与NEDD8 的表达第35-36页
        2.3.7 验证Cul1 和Cul4A蛋白纯化效果第36页
        2.3.8 K27R NEDD8 突变体抑制cullins的neddylation第36-37页
        2.3.9 K27R NEDD8 突变体抑制cullins的泛素化修饰第37-38页
        2.3.10 K27R NEDD8 突变体影响了Cullin RING E3 泛素连接酶底物IkBa 的泛素化修饰第38-39页
        2.3.11 K27R NEDD8 突变体抑制NEDD8 酶促级联反应的可能机制第39-41页
    2.4 讨论第41-42页
第三章 类泛素蛋白NEDD8 修饰底物鉴定第42-56页
    3.1 实验材料第42-43页
        3.1.1 细胞系第42页
        3.1.2 主要试剂第42页
        3.1.3 主要仪器第42-43页
        3.1.4 主要抗体第43页
    3.2 实验方法第43-47页
        3.2.1 主要试剂的配制第43-45页
        3.2.2 目的基因His6-NEDD8 质粒的构建第45页
        3.2.3 磷酸钙转染第45页
        3.2.4 变性条件下用TALON树脂纯化His6标签蛋白第45页
        3.2.5 银染第45-46页
        3.2.6 溶液内酶解第46页
        3.2.7 C18 除盐纯化第46页
        3.2.8 LC-MS/MS检测第46-47页
        3.2.9 数据分析第47页
    3.3 实验结果第47-53页
        3.3.1 验证目标蛋白纯化效率第47-48页
        3.3.2 验证酶解效率第48页
        3.3.3 质谱鉴定NEDD8 修饰蛋白的分布第48-49页
        3.3.4 NEDD8 修饰底物蛋白的鉴定第49-51页
        3.3.5 NEDD8 修饰蛋白的生物信息学分析第51-53页
    3.4 讨论第53-56页
参考文献第56-60页
综述 类泛素化修饰neddylation的功能研究进展第60-69页
    参考文献第65-69页
攻读硕士学位期间发表论文第69-70页
中英语缩略词对照表第70-71页
致谢第71-72页

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