| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 一 引言 | 第10-22页 |
| 1.1 胡麻及胡麻枯萎病简介 | 第10-12页 |
| 1.1.1 胡麻及胡麻枯萎病 | 第10页 |
| 1.1.2 胡麻枯萎病致病菌及其作用机制 | 第10-11页 |
| 1.1.3 胡麻枯萎病防治现状 | 第11-12页 |
| 1.2 生物防治 | 第12-14页 |
| 1.2.1 生物防治 | 第12-13页 |
| 1.2.2 微生物生物防治的主要作用机制 | 第13-14页 |
| 1.3 转录组学研究概况 | 第14-18页 |
| 1.3.1 转录组简介 | 第14-15页 |
| 1.3.2 主流转录组测序平台 | 第15-17页 |
| 1.3.3 新一代转录组测序技术的应用 | 第17-18页 |
| 1.4 GO数据库概述 | 第18-19页 |
| 1.5 KEGG数据库概述 | 第19-20页 |
| 1.6 研究意义 | 第20-22页 |
| 二 材料方法 | 第22-29页 |
| 2.1 材料 | 第22-24页 |
| 2.1.1 培养基及配制 | 第22页 |
| 2.1.2 菌种 | 第22页 |
| 2.1.3 溶液配制 | 第22-23页 |
| 2.1.4 仪器设备 | 第23页 |
| 2.1.5 试剂、试剂盒 | 第23-24页 |
| 2.2 方法 | 第24-29页 |
| 2.2.1 尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株G56培养方法 | 第24页 |
| 2.2.2 生防菌SF1的培养 | 第24页 |
| 2.2.3 生防菌SF1发酵液无细胞滤液的制备 | 第24-25页 |
| 2.2.4 尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株G56与生防菌SF1的共培养 | 第25页 |
| 2.2.5 生防菌SF1抑菌率的测定 | 第25页 |
| 2.2.6 尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株G56的RNA样本制备 | 第25-26页 |
| 2.2.7 RNA样品质量检测 | 第26页 |
| 2.2.8 转录组测序文库的制备及库检 | 第26-27页 |
| 2.2.9 测序质量评估 | 第27-28页 |
| 2.2.10 生物信息分析流程 | 第28-29页 |
| 三 结果与分析 | 第29-47页 |
| 3.1 生防菌SF1对尖孢镰刀菌G56抑制作用的测定 | 第29-30页 |
| 3.2 RNA样品质检结果分析 | 第30-34页 |
| 3.2.1 RNA样品琼脂糖凝胶电泳分析 | 第30-31页 |
| 3.2.2 Nanodrop超微量分光光度计及Qubit检测 | 第31-32页 |
| 3.2.3 安捷伦2100 (Agilent2100)生物芯片分析系统检测 | 第32-34页 |
| 3.3 转录组测序质量评估 | 第34-35页 |
| 3.4 转录组学研究 | 第35-45页 |
| 3.4.1 可变剪切分析 | 第35-36页 |
| 3.4.2 基因表达水平分析 | 第36-38页 |
| 3.4.3 基因差异表达分析 | 第38-40页 |
| 3.4.4 差异基因GO富集分析 | 第40-42页 |
| 3.4.5 差异基因KEGG富集分析 | 第42-45页 |
| 3.5 讨论 | 第45-47页 |
| 四 结论与展望 | 第47-48页 |
| 4.1 结论 | 第47页 |
| 4.2 工作展望 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 附录 | 第53-55页 |
| 附录一 部分差异基因BLAST比对结果 | 第53-55页 |
| 致谢 | 第55页 |
