摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-18页 |
1.1 研究课题的背景 | 第10-13页 |
1.2 国内外研究现状 | 第13-16页 |
1.3 论文研究内容及安排 | 第16-18页 |
第二章 分子动力学模拟 | 第18-23页 |
2.1 分子动力学模拟的简介 | 第18页 |
2.2 分子动力学模拟的原理和方法 | 第18-21页 |
2.2.1 力场 | 第18-19页 |
2.2.2 分子动力学模拟的基本原理及其特点 | 第19-21页 |
2.2.3 分子动力学模拟的方法 | 第21页 |
2.3 分子动力学模拟的常用软件 | 第21-23页 |
第三章 抗冻蛋白在低温水中的分子动力学模拟 | 第23-33页 |
3.1 抗冻蛋白的选取 | 第23-26页 |
3.1.1 雪蚤抗冻蛋白 | 第23-25页 |
3.1.2 冬鲽抗冻蛋白 | 第25页 |
3.1.3 溶菌酶 | 第25-26页 |
3.2 水模型的结构 | 第26-27页 |
3.3 动力学模拟过程 | 第27-28页 |
3.3.1 初始建模 | 第27-28页 |
3.3.2 NPT平衡 | 第28页 |
3.3.3 成品模拟 | 第28页 |
3.4 计算结果 | 第28-32页 |
3.5 结果讨论 | 第32-33页 |
第四章 云杉蚜虫抗冻蛋白与冰晶棱面结合的分子动力学模拟 | 第33-43页 |
4.1 材料选择 | 第33页 |
4.2 初始建模 | 第33-37页 |
4.3 蛋白与冰晶结合的分子动力学模拟过程 | 第37页 |
4.4 结果分析与讨论 | 第37-43页 |
4.4.1 结果分析 | 第37-42页 |
4.4.2 讨论 | 第42-43页 |
第五章 总结与展望 | 第43-45页 |
5.1 全文总结 | 第43-44页 |
5.2 工作展望 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-52页 |
致谢 | 第52页 |