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里氏木霉中小RNA对纤维素酶表达调控作用的研究及转录组分析

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第1章 文献综述第10-16页
   ·T.reesei QM9414及其纤维素酶体系第10-12页
   ·T.reesei的表达系统第12-13页
   ·T.reesei纤维素酶的表达调控第13-14页
   ·RNA干扰在T.reesei中的应用第14页
   ·micro RNA的简介第14-16页
第2章 T.reesei中小分子RNA对纤维素酶表达调控作用第16-31页
 引言第16页
   ·材料与方法第16-25页
     ·菌株与质粒第16-17页
     ·培养基第17页
     ·使用仪器第17页
     ·菌株的培养第17-18页
     ·小分子RNA过表达盒和抑制表达盒的构建第18-21页
     ·T.reesei原生质体的制备及转化第21-22页
     ·滤纸酶活测定第22页
     ·小分子RNA的提取以及加poly A尾和反转录第22-23页
     ·RT-PCR检测小分子RNA表达量第23-25页
   ·结果第25-29页
     ·小分子RNA过表达和抑制表达盒的构建与转化第25-26页
     ·小分子RNA的过表达和抑制效果第26-27页
     ·小分子RNA对纤维素酶表达效率的影响第27-29页
   ·讨论第29-30页
   ·小结第30-31页
第3章 转录组分析T.reesei QM9414产纤维素酶情况第31-52页
 引言第31页
   ·材料与方法第31-38页
     ·菌株第31页
     ·培养基第31页
     ·仪器第31-32页
     ·T.reesei的培养第32页
     ·RNA的提取第32页
     ·RNA样品质量检测第32-33页
     ·建立测序文库第33页
     ·测序及数据处理第33-38页
       ·原始序列数据第34页
       ·数据质量控制第34-35页
       ·转录本的拼接第35-36页
       ·基因功能注释第36-37页
       ·基因差异表达分析第37页
       ·差异基因GO富集分析第37页
       ·差异基因KEGG富集分析第37-38页
   ·结果第38-50页
     ·RNA的质量检测第38页
     ·转录组测序和组装第38-39页
     ·功能注释和分类第39-44页
     ·差异基因的分析第44-45页
     ·纤维素酶基因表达情况分析第45-46页
     ·参与纤维素酶调控的候选基因第46页
     ·聚类分析结果第46-50页
       ·GO聚类分析第46-47页
       ·KEGG代谢通路聚类分析第47-48页
       ·淀粉和蔗糖代谢通路分析第48-50页
   ·讨论第50-51页
   ·小结第51-52页
结论第52-53页
参考文献第53-60页
致谢第60-61页
攻读硕士学位期间的研究成果第61-62页

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