摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-10页 |
第1章 文献综述 | 第10-16页 |
·T.reesei QM9414及其纤维素酶体系 | 第10-12页 |
·T.reesei的表达系统 | 第12-13页 |
·T.reesei纤维素酶的表达调控 | 第13-14页 |
·RNA干扰在T.reesei中的应用 | 第14页 |
·micro RNA的简介 | 第14-16页 |
第2章 T.reesei中小分子RNA对纤维素酶表达调控作用 | 第16-31页 |
引言 | 第16页 |
·材料与方法 | 第16-25页 |
·菌株与质粒 | 第16-17页 |
·培养基 | 第17页 |
·使用仪器 | 第17页 |
·菌株的培养 | 第17-18页 |
·小分子RNA过表达盒和抑制表达盒的构建 | 第18-21页 |
·T.reesei原生质体的制备及转化 | 第21-22页 |
·滤纸酶活测定 | 第22页 |
·小分子RNA的提取以及加poly A尾和反转录 | 第22-23页 |
·RT-PCR检测小分子RNA表达量 | 第23-25页 |
·结果 | 第25-29页 |
·小分子RNA过表达和抑制表达盒的构建与转化 | 第25-26页 |
·小分子RNA的过表达和抑制效果 | 第26-27页 |
·小分子RNA对纤维素酶表达效率的影响 | 第27-29页 |
·讨论 | 第29-30页 |
·小结 | 第30-31页 |
第3章 转录组分析T.reesei QM9414产纤维素酶情况 | 第31-52页 |
引言 | 第31页 |
·材料与方法 | 第31-38页 |
·菌株 | 第31页 |
·培养基 | 第31页 |
·仪器 | 第31-32页 |
·T.reesei的培养 | 第32页 |
·RNA的提取 | 第32页 |
·RNA样品质量检测 | 第32-33页 |
·建立测序文库 | 第33页 |
·测序及数据处理 | 第33-38页 |
·原始序列数据 | 第34页 |
·数据质量控制 | 第34-35页 |
·转录本的拼接 | 第35-36页 |
·基因功能注释 | 第36-37页 |
·基因差异表达分析 | 第37页 |
·差异基因GO富集分析 | 第37页 |
·差异基因KEGG富集分析 | 第37-38页 |
·结果 | 第38-50页 |
·RNA的质量检测 | 第38页 |
·转录组测序和组装 | 第38-39页 |
·功能注释和分类 | 第39-44页 |
·差异基因的分析 | 第44-45页 |
·纤维素酶基因表达情况分析 | 第45-46页 |
·参与纤维素酶调控的候选基因 | 第46页 |
·聚类分析结果 | 第46-50页 |
·GO聚类分析 | 第46-47页 |
·KEGG代谢通路聚类分析 | 第47-48页 |
·淀粉和蔗糖代谢通路分析 | 第48-50页 |
·讨论 | 第50-51页 |
·小结 | 第51-52页 |
结论 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-60页 |
致谢 | 第60-61页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第61-62页 |