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谷氨酸棒杆菌高产琥珀酸的代谢工程改造

中文摘要第1-4页
ABSTRACT第4-11页
第一章 文献综述第11-29页
   ·琥珀酸的理化性质、功能、用途及市场需求第11-12页
     ·琥珀酸的理化性质第11页
     ·琥珀酸的功能、用途及市场需求第11-12页
   ·琥珀酸的合成第12-14页
     ·化学法合成琥珀酸第12页
     ·生物法合成琥珀酸第12-14页
   ·产琥珀酸菌株构建的国内外现状第14-22页
     ·琥珀酸曼氏杆菌和琥珀酸放线杆菌第14页
     ·大肠杆菌第14-16页
     ·谷氨酸棒杆菌第16-21页
     ·钝齿棒杆菌第21页
     ·廉价原料的利用第21-22页
   ·生物合成琥珀酸的最大理论得率第22-23页
   ·代谢工程、系统代谢工程与合成生物学第23-27页
     ·代谢工程、系统代谢工程与合成生物学第23-25页
     ·代谢通量分析第25-26页
     ·基元模式分析第26页
     ·基元模式指导代谢工程改造第26-27页
   ·选题背景第27页
   ·研究思路第27-29页
第二章 谷氨酸棒杆菌厌氧合成琥珀酸的途径鉴定第29-59页
   ·实验材料第29-34页
     ·菌株和质粒第29-30页
     ·主要仪器第30-31页
     ·主要实验试剂第31-32页
     ·培养基第32-33页
     ·主要溶液第33-34页
   ·实验方法第34-44页
     ·菌株培养与发酵第34页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备与转化第34-35页
     ·大肠杆菌基因组的提取第35-36页
     ·大肠杆菌碱裂法提取质粒第36页
     ·谷氨酸棒杆菌基因组的提取第36-37页
     ·谷氨酸棒杆菌质粒提取第37页
     ·谷氨酸棒杆菌电转感受态细胞的制备与转化第37-38页
     ·PCR 扩增第38-39页
     ·琼脂糖凝胶电泳第39-40页
     ·PCR 产物以及 DNA 片段切胶回收第40-41页
     ·DNA 的酶切、去磷酸化和连接第41-42页
     ·谷氨酸棒杆菌基因敲除原理第42页
     ·菌体浓度的测定第42页
     ·发酵液中有机酸的测定第42-44页
     ·葡萄糖浓度测定第44页
   ·结果与讨论第44-56页
     ·琥珀酸合成途径中关键基因的选择第44-47页
     ·ldhA 基因敲除第47-48页
     ·pDsacB 敲除载体构建第48-51页
     ·mdh 基因敲除第51-52页
     ·pyc 基因敲除第52-53页
     ·ppc 基因敲除第53-54页
     ·pckA 基因敲除第54-55页
     ·aceA 基因敲除第55-56页
   ·单基因敲除对琥珀酸合成的影响第56-57页
   ·小结第57-59页
第三章 失活乙酸生成途径对琥珀酸合成的影响第59-70页
   ·实验材料第60-61页
     ·质粒和菌株第60-61页
     ·实验仪器第61页
     ·主要实验试剂第61页
     ·主要培养基第61页
     ·主要溶液第61页
   ·实验方法第61-62页
   ·结果与讨论第62-69页
     ·pta-ackA 操纵子的敲除第62-63页
     ·pqo 基因的敲除第63-65页
     ·cat 基因的敲除第65-66页
     ·aceE 基因的敲除第66-67页
     ·敲除乙酸途径对乙酸和琥珀酸合成的影响第67-69页
   ·小结第69-70页
第四章 基元模式分析与最佳琥珀酸合成途径的鉴定第70-78页
   ·实验材料和方法第70-71页
   ·结果与讨论第71-77页
     ·代谢网络的构建第71-75页
     ·最佳琥珀酸合成途径的鉴定第75-77页
   ·小结第77-78页
第五章 通量分析比较指导代谢工程改造第78-112页
   ·实验材料第78-80页
     ·菌株和质粒第78-79页
     ·主要仪器第79页
     ·主要实验试剂第79-80页
     ·主要培养基第80页
     ·主要溶液第80页
   ·实验方法第80-86页
     ·实际代谢通量分析第80-83页
     ·发酵条件第83-84页
     ·谷氨酸棒杆菌总 RNA 的抽提以及分析第84页
     ·定量 PCR 分析第84-85页
     ·酶活力测定第85-86页
     ·胞内代谢物测定第86页
   ·结果与讨论第86-111页
     ·靶点鉴定第86-89页
     ·过表达回补途径对琥珀酸的影响第89-95页
     ·乙醛酸循环重构对琥珀酸合成的影响第95-97页
     ·gltA 基因过表达对琥珀酸合成的影响第97-101页
     ·sucE 基因过表达对琥珀酸的影响第101-106页
     ·高密度厌氧发酵生产琥珀酸第106-110页
     ·同一发酵罐两阶段生产琥珀酸第110-111页
   ·小结第111-112页
第六章 好氧条件下琥珀酸生产菌株的构建第112-132页
   ·实验材料第114-115页
     ·菌株和质粒第114页
     ·主要实验仪器第114-115页
     ·主要实验试剂第115页
     ·主要培养基第115页
     ·主要溶液第115页
   ·实验方法第115-117页
     ·摇瓶培养第115页
     ·发酵罐培养第115-116页
     ·乙酰辅酶 A 合成酶活力测定第116页
     ·胞内乙酰辅酶 A 的测定第116-117页
   ·实验结果与讨论第117-131页
     ·琥珀酸好氧生产菌株 C. glutamicum △sdhCAB 的构建及表征第117-119页
     ·琥珀酸好氧生产菌株 C. glutamicum ZX1 的构建及表征第119-120页
     ·副产物乙酸的再利用第120-123页
     ·柠檬酸合酶过表达对琥珀酸合成的影响第123-125页
     ·琥珀酸输出蛋白过表达对好氧琥珀酸合成的影响第125-129页
     ·分批补料培养第129页
     ·好氧条件下利用阿拉伯糖生产琥珀酸第129-131页
   ·小结第131-132页
第七章 结论与展望第132-137页
   ·结论和创新点第132-135页
     ·结论第132-134页
     ·创新点第134-135页
   ·展望第135-137页
参考文献第137-148页
发表论文和参加科研情况第148-149页
致谢第149页

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