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精子发生功能基因的提取、预测及数据库构建

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
第一章 绪论第11-18页
   ·精子发生概述第12-16页
     ·精原细胞第13-14页
     ·精母细胞第14-15页
     ·其他细胞第15-16页
   ·研究内容第16-18页
第二章 基于文本挖掘的精子发生功能基因名称提取第18-32页
   ·相关背景第18-24页
     ·文本分类第18-19页
     ·文本分类算法第19-23页
     ·生物实体识别第23-24页
   ·方法第24-27页
     ·文本获取与类标注第25页
     ·文本向量表示第25-26页
     ·分类器训练第26页
     ·基因提取第26-27页
   ·实验结果第27-31页
     ·不同维数下分类效果比较及评价第27-28页
     ·分类器参数优化及分类结果第28-29页
     ·基因提取结果及评价第29-31页
   ·小结第31-32页
第三章 精子发生功能基因的预测第32-45页
   ·相关背景第32-34页
     ·基因芯片第32-34页
     ·Logistic 回归模型第34页
   ·方法第34-44页
     ·芯片数据收集第34-35页
     ·阳性和阴性训练数据整理第35页
     ·算法描述第35-38页
     ·性能评价第38-41页
     ·预测结果评价第41-44页
   ·小结第44-45页
第四章 精子发生功能基因数据库构建第45-57页
   ·相关背景第45-48页
     ·LAMP 架构简述第45-47页
     ·生殖领域数据库说明第47-48页
   ·方法第48-51页
     ·数据来源第48-50页
     ·功能基因注释第50-51页
     ·服务器信息第51页
   ·数据库的使用第51-56页
     ·简单搜索和高级搜索功能第51-54页
     ·预测结果和反馈第54-56页
   ·小结第56-57页
第五章 结束语第57-59页
   ·总结第57-58页
   ·展望第58-59页
参考文献第59-66页
致谢第66-67页
作者在学期间取得的学术成果第67-68页
附录 A 芯片数据信息第68-71页
附录 B 预测基因的 GO 分析结果第71-77页
附录 C SpermatogenesisOnline 数据库基因数量统计第77-78页

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