摘要 | 第1-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
第一章 绪论 | 第11-18页 |
·精子发生概述 | 第12-16页 |
·精原细胞 | 第13-14页 |
·精母细胞 | 第14-15页 |
·其他细胞 | 第15-16页 |
·研究内容 | 第16-18页 |
第二章 基于文本挖掘的精子发生功能基因名称提取 | 第18-32页 |
·相关背景 | 第18-24页 |
·文本分类 | 第18-19页 |
·文本分类算法 | 第19-23页 |
·生物实体识别 | 第23-24页 |
·方法 | 第24-27页 |
·文本获取与类标注 | 第25页 |
·文本向量表示 | 第25-26页 |
·分类器训练 | 第26页 |
·基因提取 | 第26-27页 |
·实验结果 | 第27-31页 |
·不同维数下分类效果比较及评价 | 第27-28页 |
·分类器参数优化及分类结果 | 第28-29页 |
·基因提取结果及评价 | 第29-31页 |
·小结 | 第31-32页 |
第三章 精子发生功能基因的预测 | 第32-45页 |
·相关背景 | 第32-34页 |
·基因芯片 | 第32-34页 |
·Logistic 回归模型 | 第34页 |
·方法 | 第34-44页 |
·芯片数据收集 | 第34-35页 |
·阳性和阴性训练数据整理 | 第35页 |
·算法描述 | 第35-38页 |
·性能评价 | 第38-41页 |
·预测结果评价 | 第41-44页 |
·小结 | 第44-45页 |
第四章 精子发生功能基因数据库构建 | 第45-57页 |
·相关背景 | 第45-48页 |
·LAMP 架构简述 | 第45-47页 |
·生殖领域数据库说明 | 第47-48页 |
·方法 | 第48-51页 |
·数据来源 | 第48-50页 |
·功能基因注释 | 第50-51页 |
·服务器信息 | 第51页 |
·数据库的使用 | 第51-56页 |
·简单搜索和高级搜索功能 | 第51-54页 |
·预测结果和反馈 | 第54-56页 |
·小结 | 第56-57页 |
第五章 结束语 | 第57-59页 |
·总结 | 第57-58页 |
·展望 | 第58-59页 |
参考文献 | 第59-66页 |
致谢 | 第66-67页 |
作者在学期间取得的学术成果 | 第67-68页 |
附录 A 芯片数据信息 | 第68-71页 |
附录 B 预测基因的 GO 分析结果 | 第71-77页 |
附录 C SpermatogenesisOnline 数据库基因数量统计 | 第77-78页 |