| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1 miRNA简介 | 第12-13页 |
| ·miRNA的发现和发展 | 第12页 |
| ·植物miRNA的生物合成和特点 | 第12-13页 |
| 2 植物miRNA的作用机制 | 第13页 |
| 3 植物miRNA的鉴定和检测方法 | 第13-15页 |
| ·遗传学的筛选法 | 第13-14页 |
| ·小分子RNA的克隆 | 第14页 |
| ·生物信息学的预测 | 第14-15页 |
| ·高通量的测序 | 第15页 |
| ·Northern杂交 | 第15页 |
| ·实时定量反转录聚合酶链式反应(RT-qPCR) | 第15页 |
| 4 miRNA靶基因的鉴定 | 第15-16页 |
| ·生物信息学的预测 | 第16页 |
| ·靶基因的验证方法 | 第16页 |
| ·降解组测序 | 第16页 |
| 5 miRNA在植物体生长发育中的作用 | 第16-17页 |
| 6 果树miRNA的研究进展 | 第17-19页 |
| ·葡萄miRNA的研究 | 第17-18页 |
| ·柑橘miRNA的研究 | 第18-19页 |
| ·苹果miRNA的研究 | 第19页 |
| ·桃miRNA的研究 | 第19页 |
| 7 研究的目的及意义 | 第19-20页 |
| 参考文献 | 第20-26页 |
| 第二章 桃保守miRNA及其靶基因的生物信息学预测和验证 | 第26-48页 |
| 摘要 | 第26页 |
| 1 材料与方法 | 第26-29页 |
| ·植物材料的准备 | 第26-27页 |
| ·相关数据库的获得 | 第27页 |
| ·应用的软件 | 第27页 |
| ·用生物信息学的方法预测桃的miRNA及其靶基因 | 第27页 |
| ·小分子(Low molecular weight,LMW)RNA的提取与检测 | 第27-28页 |
| ·用RT-qPCR的方法验证和分析miRNA | 第28-29页 |
| ·用RLM-RACE的方法验证miRNA的靶基因 | 第29页 |
| ·miRNA革E基因的表达分析 | 第29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-43页 |
| ·桃基因组中潜在的miRNA的分析 | 第29-39页 |
| ·预测的miRNA的靶基因 | 第39-41页 |
| ·miRNA在桃幼叶、幼茎和花中的差异表达 | 第41页 |
| ·miRNA靶基因的验证和靶基因在桃不同组织中的表达 | 第41-43页 |
| 3 讨论 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-48页 |
| 第三章 用高通量测序和降解组测序的方法发掘桃中的miRNA和靶基因 | 第48-62页 |
| 摘要 | 第48页 |
| 1 材料与方法 | 第48-52页 |
| ·植物材料的准备 | 第48-49页 |
| ·小分子RNA与降解组文库的构建 | 第49页 |
| ·用生物信息学的方法分析高通量测得的数据 | 第49-50页 |
| ·用荧光定量PCR的方法检测桃的miRNA | 第50-52页 |
| 2 实验结果与分析 | 第52-59页 |
| ·小分子RNA测序后的分析 | 第52-53页 |
| ·鉴定桃中保守的miRNA和进化保守性分析 | 第53-56页 |
| ·桃中潜在的新的miRNA的鉴定 | 第56页 |
| ·miRNA的验证与表达分析 | 第56-58页 |
| ·桃降解组测序数据分析 | 第58页 |
| ·桃保守miRNA和新miRNA靶基因的鉴定 | 第58-59页 |
| 3 讨论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-62页 |
| 第四章 桃在非生物逆境下miRNA最适内参基因的筛选 | 第62-74页 |
| 摘要 | 第62页 |
| 1 材料和方法 | 第62-65页 |
| ·材料的准备 | 第62-63页 |
| ·选择合适的内参基因与内参引物的设计 | 第63-64页 |
| ·小分子RNA的提取和cDNA的合成 | 第64页 |
| ·荧光定量PCR | 第64页 |
| ·数据分析 | 第64-65页 |
| 2 结果与分析 | 第65-70页 |
| ·PCR扩增效率及扩增特异性 | 第65页 |
| ·内参基因的表达分析 | 第65-66页 |
| ·GeNorm分析 | 第66-68页 |
| ·GeNorm软件分析最佳的内参基因的数目 | 第68页 |
| ·NormFinder软件分析 | 第68-70页 |
| 3 讨论 | 第70-72页 |
| 参考文献 | 第72-74页 |
| 全文结论 | 第74-76页 |
| 主要创新点 | 第76-78页 |
| 发表论文情况 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80页 |
