| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 1.文献综述 | 第15-33页 |
| ·哺乳动物的胎盘结构、功能及转录组研究进展 | 第15-20页 |
| ·胎盘的分类 | 第15-16页 |
| ·胎盘的结构 | 第16-17页 |
| ·胎盘的功能 | 第17-18页 |
| ·胎盘对胎儿存活的影响 | 第18-19页 |
| ·胎盘对胎儿发育及其出生后生长的影响 | 第19-20页 |
| ·胎盘组织转录组的研究现状 | 第20页 |
| ·猪胚胎效率的研究进展 | 第20-23页 |
| ·胎盘效率的概念 | 第20页 |
| ·猪胎盘效率的影响因素 | 第20-22页 |
| ·通过选择猪胎盘效率提高产仔数 | 第22-23页 |
| ·印记基因的研究进展 | 第23-33页 |
| ·印记基因的概念及其发现 | 第23页 |
| ·印记基因的特征 | 第23-24页 |
| ·个体发育过程中印记基因的建立和维持 | 第24-26页 |
| ·基因印记与甲基化 | 第26-27页 |
| ·印记基因对胎儿胎盘生长发育的影响 | 第27-28页 |
| ·猪中印记基因的研究现状 | 第28页 |
| ·拟研究的候选印记基因研究现状 | 第28-33页 |
| 2 研究的目的和意义 | 第33-34页 |
| 3 材料与方法 | 第34-52页 |
| ·材料 | 第34-38页 |
| ·样品 | 第34-35页 |
| ·Affymetrix基因芯片 | 第35页 |
| ·菌株和载体 | 第35-36页 |
| ·主要培养基 | 第36页 |
| ·主要仪器设备 | 第36-37页 |
| ·主要试剂 | 第37页 |
| ·主要试剂的配制 | 第37-38页 |
| ·主要分子生物学软件和网站 | 第38-39页 |
| ·主要分子生物学软件 | 第38-39页 |
| ·主要生物学网站和数据库 | 第39页 |
| ·试验方法 | 第39-52页 |
| ·RNA提取与芯片杂交 | 第39页 |
| ·转录谱数据处理 | 第39-41页 |
| ·数据的前处理 | 第39-40页 |
| ·方差分析法筛选差异表达基因 | 第40页 |
| ·聚类分析方法 | 第40页 |
| ·Gene Ontology分析方法 | 第40-41页 |
| ·基因片段的的分离 | 第41-45页 |
| ·PCR产物的纯化、克隆与测序 | 第45-46页 |
| ·IMpRH辐射杂种板定位 | 第46-47页 |
| ·定位引物设计 | 第46-47页 |
| ·定位引物扩增及其分型方法与数据分析 | 第47页 |
| ·基因的表达 | 第47-50页 |
| ·组织总RNA提取 | 第47-48页 |
| ·总RNA完整性检测 | 第48页 |
| ·总RNA的DNase-Ⅰ处理 | 第48-49页 |
| ·总RNA的反转录 | 第49页 |
| ·引物设计 | 第49页 |
| ·扩增反应条件 | 第49页 |
| ·数据分析 | 第49-50页 |
| ·猪候选印记基因SNP检测 | 第50-51页 |
| ·错配引入酶切位点 | 第50页 |
| ·PCR扩增反应 | 第50页 |
| ·酶切条件 | 第50页 |
| ·基因分型 | 第50-51页 |
| ·多态标记分析方法 | 第51页 |
| ·PEG5基因启动子片段的克隆、分析 | 第51页 |
| ·基因印记情况分析 | 第51-52页 |
| ·猪候选印记基因的确定 | 第51页 |
| ·候选印记基因在猪胎盘组织的印记情况鉴定 | 第51-52页 |
| 4 结果 | 第52-81页 |
| ·转录谱比较结果 | 第52-58页 |
| ·胎盘组织转录组分析 | 第52页 |
| ·同时期不同品种猪胎盘组织中差异表达基因筛选结果 | 第52-54页 |
| ·Real-time PCR验证差异表达基因结果 | 第54页 |
| ·胎盘表达基因聚类分析结果 | 第54-55页 |
| ·GO分析结果 | 第55-57页 |
| ·差异表达基因的QTL区域分布 | 第57页 |
| ·Real-time PCR检测VEGF通路相关基因表达结果 | 第57-58页 |
| ·芯片上差异表达候选印记基因的筛选 | 第58页 |
| ·印记基因的分离、定位及印记表达分析结果 | 第58-81页 |
| ·猪PEG1基因 | 第58-62页 |
| ·PEG1基因cDNA分离及序列分析 | 第58-60页 |
| ·PEG1基因的定位结果 | 第60页 |
| ·PEG1基因在胎盘组织中的印记情况分析 | 第60-61页 |
| ·PCR-RFLP-RsaⅠ多态性在不同猪品种中等位基因分布情况 | 第61-62页 |
| ·猪PEG3基因 | 第62-64页 |
| ·PEG3基因的定位结果 | 第62页 |
| ·PEG3基因在胎盘组织中的印记情况分析 | 第62-63页 |
| ·PCR-RFLP-TaiⅠ多态性在不同猪品种中等位基因分布情况 | 第63-64页 |
| ·猪PEG5基因 | 第64-68页 |
| ·PEG5基因在胎盘组织中的印记情况分析 | 第64页 |
| ·PEG5基因在胎盘组织的表达研究 | 第64-65页 |
| ·猪PEG5基因启动子分析 | 第65-68页 |
| ·猪PEG10基因 | 第68-71页 |
| ·PEG10基因的定位结果 | 第68-69页 |
| ·PEG10基因在胎盘组织中的印记情况分析 | 第69-70页 |
| ·PEG10基因PCR-RFLP-TaqⅠ多态分析 | 第70-71页 |
| ·猪GATM基因 | 第71-74页 |
| ·GATM基因cDNA序列分离及序列分析 | 第71页 |
| ·GATM基因的定位结果 | 第71页 |
| ·GATM基因在胎盘组织中的印记情况分析 | 第71-73页 |
| ·GATM基因PCR-RFLP-BseLⅠ多态分析 | 第73-74页 |
| ·猪INPP5F基因 | 第74-77页 |
| ·INPP5F基因部分cDNA序列分离及序列分析 | 第74页 |
| ·INPP5F基因的定位结果 | 第74-75页 |
| ·INPP5F基因在胎盘组织中的印记情况分析 | 第75-76页 |
| ·PCR-RFLP-HincⅡ多态性在不同猪品种中的等位基因分布情况 | 第76页 |
| ·INPP5F基因HincⅡ多态位点与部分性状关联分析 | 第76-77页 |
| ·猪PON2和DCN基因在胎盘组织中的印记检测 | 第77-79页 |
| ·基因DIRAS3、PLAGL1和SLC38A4在胎盘组织中的印记情况分析 | 第79页 |
| ·猪ASCL2基因外显子SNP寻找结果 | 第79-81页 |
| 5 讨论 | 第81-90页 |
| ·猪胎盘组织转录谱比较结果的讨论 | 第81-85页 |
| ·应用基因芯片检测不同胎盘效率猪胎盘组织基因表达的重要意义 | 第81页 |
| ·关于本实验芯片结果的可靠性 | 第81-82页 |
| ·关于本研究检测到的可能影响胎盘效率的差异表达基因 | 第82-85页 |
| ·关于印记基因鉴定结果的讨论 | 第85-90页 |
| ·基因印记状态检测的重要性 | 第85页 |
| ·关于印记基因的保守性 | 第85-87页 |
| ·关于印记基因的甲基化分析 | 第87-88页 |
| ·关于猪印记基因在遗传育种中的应用 | 第88-90页 |
| 6 小结 | 第90-92页 |
| ·本研究的主要结果和结论 | 第90-91页 |
| ·本研究的特色和创新点 | 第91页 |
| ·本研究不足之处和进一步的工作 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-105页 |
| 致谢 | 第105-107页 |
| 在读期间发表和待发表的论文 | 第107-108页 |
| 附录 | 第108-111页 |
