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运用实时荧光PCR和DNA芯片技术检测和鉴定食源性致病菌方法的研究

中文摘要第1-8页
文献综述第8-33页
 1 食品中常见致病菌及常规的检测技术第8-12页
   ·食源性致病菌危害的严重性第8-9页
   ·常见的食源性致病菌第9-11页
   ·食源性致病菌检测技术应用的现状第11-12页
   ·上述的检测技术应用的不足第12页
 2 实时荧光PCR技术简介第12-20页
   ·实时荧光PCR及其定量检测技术的原理第13-19页
     ·荧光探针的技术原理第13-14页
     ·实时荧光PCR所用探针第14-18页
     ·实时荧光PCR的特点第18-19页
   ·实时荧光PCR技术应用的现状第19-20页
     ·实时荧光PCR技术在致病菌方面的应用现状第19-20页
     ·实时荧光PCR技术在其他方面的应用现状第20页
 3 实时荧光RT-PCR技术在食源性致病菌检测方面的应用第20-21页
   ·RT-PCR技术的原理第20-21页
   ·实时荧光RT-PCR技术鉴别食源性致病菌死活状态的原理第21页
 4 DNA芯片技术简介第21-33页
   ·DNA芯片技术的原理第21-22页
   ·DNA芯片技术的种类第22-26页
     ·按载体材料分类#第22页
     ·按点样方式分类第22-24页
     ·按探针种类分类第24页
     ·按用途分类第24-26页
   ·DNA芯片的应用范围及现状第26-31页
     ·DNA芯片在微生物方面的应用第27-30页
     ·DNA芯片在其他方面的应用第30-31页
   ·DNA芯片的发展前景第31-33页
实验材料和基本方法第33-39页
 1 实验材料第33-36页
   ·实验菌株第33-34页
   ·实验试剂第34-35页
     ·细菌培养基第35页
     ·细菌基因组DNA提取试剂第35页
     ·PCR试剂第35页
     ·RT-PCR试剂第35页
     ·供试载体、宿主细菌及培养基第35页
     ·DNA芯片试剂第35页
   ·实验仪器第35-36页
     ·PCR仪第35-36页
     ·DNA芯片相关仪器第36页
     ·其他仪器第36页
 2 基本实验方法第36-39页
   ·细菌培养第36页
   ·细菌基因组DNA提取第36-37页
     ·革兰氏阳性细菌基因组DNA的提取第37页
     ·革兰氏阴性细菌基因组DNA的提取第37页
   ·细菌基因组DNA提取结果检测第37-39页
     ·细菌基因组DNA的电泳检测第37-38页
     ·细菌基因组DNA的浓度和纯度测定第38-39页
实验方法第39-110页
 1 运用实时荧光PCR技术检测食源性致病菌的研究第39-62页
   ·运用实时荧光PCR技术定性检测八种食源性致病菌的研究第39-45页
     ·实时荧光PCR检测的八种食源性致病菌第39页
     ·实时荧光PCR检测用的引物和探针序列第39-40页
     ·待检菌株的培养第40页
     ·细菌基因组DNA的提取第40-41页
     ·实时荧光PCR检测八种食源性致病菌第41页
     ·八种食源性致病菌的实时荧光PCR检测结果第41-45页
   ·运用实时荧光PCR技术定量检测食源性致病菌的研究第45-58页
     ·模拟污染样品的制备第45页
     ·单增李氏菌的计数第45页
     ·单增李氏菌模板DNA的提取第45页
     ·单增李氏菌DNA检测的引物和探针第45-46页
     ·实时荧光PCR定量检测食品中的单增李氏菌第46-49页
     ·运用实时荧光PCR技术定量检测单增李氏菌的结果第49-58页
   ·运用实时荧光RT-PCR检测食品中活性单增李氏菌的研究第58-62页
     ·单增李氏菌的计数第58页
     ·单增李氏菌模板RNA的提取第58-59页
     ·单增李氏菌RNA检测用引物和探针第59页
     ·RNA模板的处理第59页
     ·定性RT-PCR检测食品中的活体单增李氏菌第59-60页
     ·实时荧光RT-PCR检测食品中的活体单增李氏菌第60页
     ·实时荧光RT-PCR检测食品中活体单增李氏菌的结果第60-62页
 2 运用DNA芯片技术检测食源性致病菌的研究第62-110页
   ·运用DNA芯片技术检测的八种食源性致病菌第62页
   ·DNA芯片检测用的引物和探针第62页
   ·DNA芯片的制备第62-64页
     ·引物和氨基化探针的制备第63-64页
     ·芯片探针点样液的配制第64页
     ·芯片点样及后处理第64页
   ·细菌基因组DNA的提取第64-65页
   ·PCR扩增第65页
   ·DNA芯片的杂交第65-66页
     ·杂交过程第65-66页
     ·杂交结果的检测第66页
   ·DNA芯片的敏感度实验第66-67页
   ·DNA芯片的重复性和稳定性实验第67页
   ·结果第67-110页
     ·DNA芯片检测用引物和探针的研究设计第67-70页
     ·十五种细菌的PCR检测第70-72页
     ·DNA芯片检测结果第72-88页
     ·探针的BLAST比对结果第88页
     ·探针的敏感度实验结果第88-100页
     ·重复性与稳定性实验第100-110页
讨论第110-120页
 1 关于运用实时荧光PCR技术检测食源性致病菌方法第110-115页
   ·关于运用实时荧光PCR技术定性检测食源性致病菌的方法第110-112页
     ·关于扩增的片段和探针的特异性第110页
     ·实时荧光PCR定性检测方法与常规检测和其他分子生物学方法的比较第110-112页
   ·关于运用实时荧光PCR技术定量检测食源性致病菌的方法第112-114页
     ·关于实时荧光PCR方法定量检测食源性致病菌的优越性第112-113页
     ·关于实时荧光PCR定量检测的标准曲线的重复性和稳定性第113-114页
     ·关于三种标准曲线的灵敏度第114页
   ·关于运用实时荧光RT-PCR技术检测食源性致病菌方法第114-115页
     ·关于提取RNA和RNA提取后处理第114页
     ·关于实时荧光RT-PCR技术检测食源性致病菌方法的优越性第114-115页
 2 关于运用DNA芯片技术检测食源性致病菌方法第115-120页
   ·关于革兰氏阳性细菌破壁第115页
   ·选取的引物的通用性和探针的特异性第115-117页
   ·关于杂交图像的信号交叉第117页
   ·关于DNA芯片的灵敏度第117-118页
   ·关于DNA芯片的重复性和稳定性第118-119页
   ·关于DNA芯片检测食源性致病菌方法的优越性第119-120页
结论与展望第120-126页
 1 主要结论第120-121页
   ·实时荧光PCR技术是快速鉴定检测食源性致病菌的新技术第120页
   ·实时荧光PCR技术可以快速准确地对食源性致病菌进行定量检测第120页
   ·实时荧光RT-PCR技术是活性检测食源性致病菌的可靠技术第120页
   ·DNA芯片是高通量快速鉴定检测八种食源性致病菌的最新技术第120-121页
 2 解决的关键技术问题和创新点第121-123页
   ·本论文解决的关键技术问题第121-122页
   ·本论文的创新点第122-123页
 3 本论文存在的不足之处第123-124页
 4 有待于进一步开展的工作第124-126页
英文摘要第126-128页
参考文献第128-136页
致谢第136-138页

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