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花生各组织混合全长cDNA文库的构建和RGA片段的克隆

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
第一章 引言第12-27页
 1 植物功能基因组学概述第12-14页
   ·植物功能基因组学研究现状与发展趋势第13-14页
   ·植物功能基因组学研究技术与方法第14页
 2 植物抗病性研究进展第14-18页
   ·植物抗病的分子机制第14-15页
   ·植物抗病基因第15-18页
     ·已克隆的抗病基因的类型及特点第15-17页
     ·抗病基因的起源与进化第17-18页
   ·植物抗病基因克隆的方法及策略第18页
 3 全长cDNA 文库的构建第18-25页
   ·全长cDNA 文库的特点第19-20页
   ·构建全长cDNA 文库的方法及原理第20-23页
   ·全长差减/均一化cDNA 文库第23-25页
 本研究的内容、目的和意义第25-27页
第二章 花生各组织混合全长cDNA 文库的构建第27-38页
 1 材料与方法第27-31页
   ·试验材料第27-28页
     ·花生材料第27-28页
     ·试剂第28页
     ·引物第28页
   ·试验方法第28-31页
     ·总RNA 提取第28页
     ·mRNA 分离纯化第28页
     ·双链cDNA 合成第28-29页
     ·蛋白酶K 消化,Sfi I 酶切和cDNA 分级分离第29页
     ·连接第29页
     ·电击转化第29-30页
     ·文库的PCR 检测第30页
     ·文库的酶切检测第30页
     ·全长cDNA 文库初步测序第30页
     ·全长cDNA 判别第30-31页
 2 结果分析第31-36页
   ·总RNA 提取及mRNA 的分离纯化第31-32页
   ·双链cDNA 合成第32-33页
   ·Sfi I 酶切及分级分离第33页
   ·cDNA 文库构建第33-34页
   ·插入片段检测第34-35页
   ·扩增文库的滴度检测第35页
   ·测序结果初步分析第35-36页
 3 讨论第36-38页
   ·关于RNA 的提取第36页
   ·改良后的SMART 技术构建全长文库的优缺点第36-38页
第三章 花生全长cDNA 小量测序与生物信息学初步分析第38-56页
 1 材料和方法第38页
   ·实验材料第38页
   ·方法第38页
 2 结果与分析第38-54页
   ·碱基组成及相关分析第39页
   ·序列 Blast 结果及相关分析第39-44页
     ·B1astn 的分析结果第39-40页
     ·Blastx 的分析结果第40-44页
   ·KEGG 注释第44-50页
     ·KO 目录(KO List)第45-46页
     ·组成及途径(BRITE hierarchies)第46-50页
   ·GO 功能注释第50-54页
 3 讨论第54-56页
   ·关于花生全长cDNA 克隆测序项目研究进展第54页
   ·关于全长cDNA 序列的批量注释与功能分类第54-55页
   ·关于基因功能的划分第55页
   ·文库测序获取目标序列的可行性第55-56页
第四章 RGA 片段的克隆第56-69页
 1 材料与方法第58-61页
   ·材料第58-59页
     ·植物材料第58页
     ·试剂和仪器第58-59页
     ·根据RGA 片段的多元比对所设计的引物序列第59页
   ·方法第59-61页
     ·DNA 的提取第59-60页
     ·RGA 片段的扩增第60-61页
     ·RGA 片段的检测和回收第61页
     ·PCR 产物的连接与转化第61页
     ·菌落PCR 鉴定第61页
     ·重组克隆的提取验证及 DNA 序列分析第61页
 2 结果与分析第61-67页
   ·花生叶 DNA 的提取第61-62页
   ·RGA 片段的同源扩增第62页
   ·目的片段回收后检测第62-63页
   ·RGA 片段转化后的质粒提取检测第63页
   ·RGA 片段的测序结果第63-67页
 3 讨论第67-69页
   ·同源克隆策略的探讨及需要注意的几个问题第67页
   ·RGA 的应用和展望第67-69页
参考文献(Reference)第69-74页
附录第74-83页
致谢第83页

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