摘要 | 第1-10页 |
ABSTRACT | 第10-12页 |
第一章 引言 | 第12-27页 |
1 植物功能基因组学概述 | 第12-14页 |
·植物功能基因组学研究现状与发展趋势 | 第13-14页 |
·植物功能基因组学研究技术与方法 | 第14页 |
2 植物抗病性研究进展 | 第14-18页 |
·植物抗病的分子机制 | 第14-15页 |
·植物抗病基因 | 第15-18页 |
·已克隆的抗病基因的类型及特点 | 第15-17页 |
·抗病基因的起源与进化 | 第17-18页 |
·植物抗病基因克隆的方法及策略 | 第18页 |
3 全长cDNA 文库的构建 | 第18-25页 |
·全长cDNA 文库的特点 | 第19-20页 |
·构建全长cDNA 文库的方法及原理 | 第20-23页 |
·全长差减/均一化cDNA 文库 | 第23-25页 |
本研究的内容、目的和意义 | 第25-27页 |
第二章 花生各组织混合全长cDNA 文库的构建 | 第27-38页 |
1 材料与方法 | 第27-31页 |
·试验材料 | 第27-28页 |
·花生材料 | 第27-28页 |
·试剂 | 第28页 |
·引物 | 第28页 |
·试验方法 | 第28-31页 |
·总RNA 提取 | 第28页 |
·mRNA 分离纯化 | 第28页 |
·双链cDNA 合成 | 第28-29页 |
·蛋白酶K 消化,Sfi I 酶切和cDNA 分级分离 | 第29页 |
·连接 | 第29页 |
·电击转化 | 第29-30页 |
·文库的PCR 检测 | 第30页 |
·文库的酶切检测 | 第30页 |
·全长cDNA 文库初步测序 | 第30页 |
·全长cDNA 判别 | 第30-31页 |
2 结果分析 | 第31-36页 |
·总RNA 提取及mRNA 的分离纯化 | 第31-32页 |
·双链cDNA 合成 | 第32-33页 |
·Sfi I 酶切及分级分离 | 第33页 |
·cDNA 文库构建 | 第33-34页 |
·插入片段检测 | 第34-35页 |
·扩增文库的滴度检测 | 第35页 |
·测序结果初步分析 | 第35-36页 |
3 讨论 | 第36-38页 |
·关于RNA 的提取 | 第36页 |
·改良后的SMART 技术构建全长文库的优缺点 | 第36-38页 |
第三章 花生全长cDNA 小量测序与生物信息学初步分析 | 第38-56页 |
1 材料和方法 | 第38页 |
·实验材料 | 第38页 |
·方法 | 第38页 |
2 结果与分析 | 第38-54页 |
·碱基组成及相关分析 | 第39页 |
·序列 Blast 结果及相关分析 | 第39-44页 |
·B1astn 的分析结果 | 第39-40页 |
·Blastx 的分析结果 | 第40-44页 |
·KEGG 注释 | 第44-50页 |
·KO 目录(KO List) | 第45-46页 |
·组成及途径(BRITE hierarchies) | 第46-50页 |
·GO 功能注释 | 第50-54页 |
3 讨论 | 第54-56页 |
·关于花生全长cDNA 克隆测序项目研究进展 | 第54页 |
·关于全长cDNA 序列的批量注释与功能分类 | 第54-55页 |
·关于基因功能的划分 | 第55页 |
·文库测序获取目标序列的可行性 | 第55-56页 |
第四章 RGA 片段的克隆 | 第56-69页 |
1 材料与方法 | 第58-61页 |
·材料 | 第58-59页 |
·植物材料 | 第58页 |
·试剂和仪器 | 第58-59页 |
·根据RGA 片段的多元比对所设计的引物序列 | 第59页 |
·方法 | 第59-61页 |
·DNA 的提取 | 第59-60页 |
·RGA 片段的扩增 | 第60-61页 |
·RGA 片段的检测和回收 | 第61页 |
·PCR 产物的连接与转化 | 第61页 |
·菌落PCR 鉴定 | 第61页 |
·重组克隆的提取验证及 DNA 序列分析 | 第61页 |
2 结果与分析 | 第61-67页 |
·花生叶 DNA 的提取 | 第61-62页 |
·RGA 片段的同源扩增 | 第62页 |
·目的片段回收后检测 | 第62-63页 |
·RGA 片段转化后的质粒提取检测 | 第63页 |
·RGA 片段的测序结果 | 第63-67页 |
3 讨论 | 第67-69页 |
·同源克隆策略的探讨及需要注意的几个问题 | 第67页 |
·RGA 的应用和展望 | 第67-69页 |
参考文献(Reference) | 第69-74页 |
附录 | 第74-83页 |
致谢 | 第83页 |