过氧化物酶体增殖物激活受体天然泛激动剂的虚拟筛选
| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 前言 | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-23页 |
| ·药物研发的历史与现状 | 第8-9页 |
| ·计算机辅助药物分子设计 | 第9-13页 |
| ·概述 | 第9页 |
| ·计算机辅助药物设计方法的分类 | 第9-13页 |
| ·Ⅱ型糖尿病 | 第13-22页 |
| ·Ⅱ型糖尿病简介 | 第13-15页 |
| ·过氧化物酶体增殖物激活受体 | 第15-22页 |
| ·本课题研究内容及选题意义 | 第22-23页 |
| 第二章 PPARα/δ/γ天然泛激动剂的虚拟筛选 | 第23-43页 |
| ·计算平台 | 第23-24页 |
| ·硬件平台 | 第23页 |
| ·软件平台 | 第23-24页 |
| ·实验过程中所涉及到的相关技术 | 第24-28页 |
| ·模拟退火法 | 第24-25页 |
| ·分子对接方法 | 第25-28页 |
| ·实验过程 | 第28-38页 |
| ·对接方法的验证 | 第28-33页 |
| ·配体库的筛选 | 第33-38页 |
| ·实验结果与讨论 | 第38-42页 |
| ·PPARs 活性腔的特点 | 第38页 |
| ·配体化合物与PPARs 对接结果 | 第38-42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第三章 黄酮类分子与PPARs 的分子动力学研究 | 第43-60页 |
| ·实验材料 | 第43页 |
| ·计算平台 | 第43-44页 |
| ·硬件平台 | 第43页 |
| ·软件平台 | 第43-44页 |
| ·实验过程中所涉及到的相关技术 | 第44-46页 |
| ·实验过程 | 第46-51页 |
| ·初始化模型的预处理 | 第46-47页 |
| ·模型的优化 | 第47-48页 |
| ·模型的分子动力学模拟 | 第48-51页 |
| ·讨论与分析 | 第51-58页 |
| ·汉黄芩素与PPARs 的动力学结果 | 第51-54页 |
| ·汉黄芩素与PPARs 的疏水分析 | 第54-56页 |
| ·汉黄芩素与PPARs 的静电分析 | 第56-58页 |
| ·本章小结 | 第58-60页 |
| 第四章结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| 附录 | 第67-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
