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猪肌肉组织差异蛋白质组学研究

摘要第1-12页
ABSTRACT第12-15页
缩略语表第15-17页
第一章 文献综述第17-38页
   ·前言第17-18页
   ·蛋白质组学概念及其分类第18-19页
     ·蛋白质组学概念第18-19页
     ·蛋白质组学分类第19页
   ·蛋白质组学研究技术第19-30页
     ·双向电泳技术第20-24页
     ·高效液相色谱(HPLC)第24页
     ·毛细管电泳(CE)第24-25页
     ·同位素编码亲和标签(ICAT)第25页
     ·蛋白质芯片(Protein chip)第25-26页
     ·生物质谱技术(MS)第26-28页
     ·生物信息学第28-30页
   ·蛋白质组学在肉质科学研究中的应用第30-36页
     ·骨骼肌蛋白质表达谱第31-33页
     ·遗传因素引起的蛋白质组变化第33-34页
     ·屠宰后的代谢变化第34-35页
     ·宰前条件变化引起的蛋白质组改变第35页
     ·与肉质性状有关的蛋白质组变化第35-36页
     ·肽的质谱分析(MS)第36页
   ·展望第36-38页
第二章 猪肌肉组织双向电泳分离技术的建立及优化第38-52页
   ·前言第38页
   ·材料与方法第38-43页
     ·实验材料第38页
     ·主要实验仪器第38页
     ·主要化学药品及试剂第38-39页
     ·主要溶液配方第39-40页
     ·肌肉组织蛋白样品的制备第40-41页
     ·蛋白质定量第41页
     ·双向电泳分析(2-DE)第41-43页
     ·图像扫描及分析第43页
   ·结果与分析第43-50页
     ·不同提取方法对双向电泳结果的影响第43-45页
     ·不同上样量的双向电泳结果比较第45-46页
     ·不同pH值胶条的双向电泳结果比较第46页
     ·不同二向胶浓度的双向电泳结果比较第46-47页
     ·不同染色方法的双向电泳结果比较第47-48页
     ·三块胶的重复性比较第48-49页
     ·双向电泳中常见问题分析第49-50页
   ·讨论第50-52页
     ·关于肌肉组织蛋白的提取第50-51页
     ·影响猪肌肉组织样品双向电泳分离效果的关键因素第51-52页
第三章 梅山猪与大白猪肌肉组织差异蛋白质组学研究第52-73页
   ·前言第52页
   ·材料与方法第52-58页
     ·实验材料第52-53页
     ·主要实验仪器第53页
     ·主要化学药品及试剂第53页
     ·主要溶液配方第53页
       ·双向电泳相关溶液第53页
       ·琼脂糖凝胶电泳相关缓冲液第53页
     ·肌肉组织蛋白样品的制备第53-54页
     ·蛋白质定量第54页
     ·双向电泳分析第54-55页
     ·图像扫描及分析第55页
     ·蛋白质鉴定第55-56页
     ·实时荧光定量PCR第56-58页
   ·结果与分析第58-67页
     ·蛋白质定量第58-59页
     ·梅山猪与大白猪背最长肌差异蛋白质组学分析第59-66页
     ·部分差异蛋白点在mRNA水平表达情况第66页
     ·肌球蛋白重链分布分析第66-67页
   ·讨论第67-71页
     ·关于银染第67-68页
     ·关于不同品种猪肌纤维类型的分布第68页
     ·关于代谢相关差异表达蛋白第68-70页
     ·关于肌纤维结构相关差异表达蛋白第70-71页
     ·关于防御与应激相关差异表达蛋白第71页
     ·关于其他未分类差异表达蛋白第71页
   ·小结第71-73页
第四章 梅山猪不同发育时期肌肉组织差异蛋白质组学研究第73-101页
   ·前言第73-75页
   ·材料与方法第75-77页
     ·实验材料第75页
     ·主要实验仪器第75页
     ·主要化学药品及试剂第75页
     ·主要溶液配方第75-76页
     ·肌肉组织蛋白样品的制备第76页
     ·蛋白定量第76页
     ·双向电泳分析(2-DE)第76页
     ·图像扫描及分析第76页
     ·蛋白质鉴定第76页
     ·实时荧光定量PCR第76页
     ·Western Blotting分析第76-77页
   ·结果与分析第77-94页
     ·蛋白质定量第77-78页
     ·梅山猪不同发育时期背最长肌肌球蛋白重链分布分析第78-79页
     ·梅山猪不同发育时期背最长肌差异蛋白质组学分析第79-91页
     ·部分差异蛋白点的Western Blotting验证分析第91-92页
     ·差异表达蛋白翻译水平与转录水平比较分析第92-94页
   ·讨论第94-101页
第五章 部分差异蛋白基因水平的进一步研究分析第101-124页
   ·前言第101页
   ·材料与方法第101-107页
     ·实验材料与性状测定第101-102页
     ·主要药品及试剂第102页
     ·缓冲液和常用试剂的配制第102-103页
     ·总RNA的提取及cDNA第一链合成第103页
     ·猪基因组DNA的提取及检测第103页
     ·猪ATP5B、ATP5A、14-3-3ζ基因的分离第103-105页
     ·猪ATP5B、ATP5A、14-3-3ζ基因时空表达分析第105页
     ·DNA序列的生物信息学分析第105页
     ·ATP5B和14-3-3ζ基因的多态性检测第105-106页
     ·多态标记与性状的关联分析方法第106-107页
   ·结果与分析第107-119页
     ·总RNA的提取和检测结果第107页
     ·猪ATP5B、ATP5A和14-3-3ζ基因的克隆和序列分析第107-112页
     ·猪ATP5B、ATP5A和14-3-3ζ基因的时空表达分析第112-116页
     ·猪ATP5B和14-3-3ζ基因多态性检测与性状关联分析第116-119页
   ·讨论第119-124页
     ·关于猪ATP5B和ATP5A基因第119-121页
     ·关于猪14-3-3ζ基因第121-124页
第六章 结论第124-127页
   ·主要研究结果第124-125页
   ·主要创新点第125-126页
   ·本研究的不足之处第126页
   ·值得进一步研究的相关问题第126-127页
参考文献第127-144页
附录第144-152页
在读期间发表文章情况第152-153页
致谢第153-154页

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