| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第一章 前言 | 第14-31页 |
| 1 水稻稻瘟病及稻瘟病菌研究概况 | 第14-20页 |
| 1.1 水稻稻瘟病危害及稻瘟病菌概况 | 第14-15页 |
| 1.2 水稻稻瘟病病菌生活史 | 第15-16页 |
| 1.3 水稻稻瘟病病菌遗传多样性研究概况 | 第16-17页 |
| 1.4 水稻稻瘟病病菌的侵染机制 | 第17-18页 |
| 1.5 稻瘟病病菌无毒基因研究进展 | 第18-20页 |
| 2 植物抗病的先天免疫系统 | 第20-22页 |
| 2.1 PAMPs/MAMP激发的基础抗性 | 第20页 |
| 2.2 效应子激发的植物抗性 | 第20-21页 |
| 2.3 植物抗病基因的结构 | 第21-22页 |
| 3 水稻抗稻瘟病基因研究现状 | 第22-26页 |
| 3.1 抗稻瘟病基因定位方法 | 第22-23页 |
| 3.2 抗稻瘟病基因定位及相关基因的分布 | 第23-24页 |
| 3.3 抗稻瘟病基因的克隆 | 第24-26页 |
| 4 MAS在水稻抗病育种中的应用 | 第26-29页 |
| 4.1 分子标记在育种中的应用 | 第26-27页 |
| 4.2 抗病基因在水稻抗病育种中的应用 | 第27-29页 |
| 5 自然选择对抗病基因遗传多样性的影响 | 第29-30页 |
| 6 本研究的目的与意义 | 第30-31页 |
| 第二章 水稻抗稻瘟病基因Pie6(t)的定位 | 第31-48页 |
| 1 前言 | 第31页 |
| 2 材料方法 | 第31-39页 |
| 2.1 水稻材料 | 第31-32页 |
| 2.2 定位群体构建及种植 | 第32页 |
| 2.3 稻瘟病菌单孢培养及接种鉴定 | 第32-33页 |
| 2.4 水稻基因组DNA提取 | 第33-34页 |
| 2.5 多态性分子标记筛选及BSA分析 | 第34-36页 |
| 2.6 分子标记设计及连锁分析 | 第36-39页 |
| 2.7 Pie6(t)的定位群体构建 | 第39页 |
| 2.8 候选基因预测 | 第39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-45页 |
| 3.1 水稻材料及接种稻瘟病菌单孢选择 | 第39-40页 |
| 3.2 分子标记与基因连锁分析 | 第40-41页 |
| 3.3 抗性基因定位区间确认 | 第41-43页 |
| 3.4 抗病基因定位结果 | 第43-44页 |
| 3.5 候选基因分析 | 第44-45页 |
| 4 讨论 | 第45-48页 |
| 4.1 定位群体的构建对基因定位的影响 | 第45-46页 |
| 4.2 分子标记对基因定位的影响 | 第46页 |
| 4.3 重组抑制区对精细定位的影响 | 第46-47页 |
| 4.4 Pie6(t)定位区间内已经定位克隆的抗稻瘟病基因 | 第47-48页 |
| 第三章 水稻抗稻瘟病基因Pike特异性标记开发及其应用 | 第48-65页 |
| 1 前言 | 第48-50页 |
| 2 材料与方法 | 第50-53页 |
| 2.1 实验材料选取及种植 | 第50页 |
| 2.2 育种株系抗性鉴定 | 第50-51页 |
| 2.3 Pike特异性分子标记开发 | 第51-52页 |
| 2.4 DNA提取及PCR扩增 | 第52-53页 |
| 2.5 分子标记效用验证 | 第53页 |
| 3 结果与分析 | 第53-61页 |
| 3.1 Pike特异性SNP位点分析 | 第53-55页 |
| 3.2 共显性分子标记开发结果 | 第55-57页 |
| 3.3 Pike在主要育种骨干亲本中的分布 | 第57-59页 |
| 3.4 共显性分子标记在抗病育种中的应用 | 第59-61页 |
| 4 讨论 | 第61-65页 |
| 4.1 NBS-LRR类基因不同结构域对基因功能的影响 | 第61-62页 |
| 4.2 功能性的分子标记的开发及其在育种中的应用 | 第62-63页 |
| 4.3 MAS在水稻抗病育种中的应用 | 第63-65页 |
| 第四章 水稻抗稻瘟病基因Pike的遗传变异分析 | 第65-81页 |
| 1 前言 | 第65-66页 |
| 2 材料及方法 | 第66-70页 |
| 2.1 材料及DNA提取 | 第66页 |
| 2.2 PCR扩增、克隆及测序 | 第66-69页 |
| 2.3 序列整理、比对及进化树分析 | 第69页 |
| 2.4 等位基因变异分析 | 第69-70页 |
| 2.5 功能性分子标记设计 | 第70页 |
| 3 结果与分析 | 第70-79页 |
| 3.1 Pike-1等位基因系统进化树分析 | 第70-72页 |
| 3.2 Pike-1等位基因部分NBS区域遗传变异分析 | 第72页 |
| 3.3 K-type等位基因的系统进化树分析 | 第72-73页 |
| 3.4 K-type等位基因的遗传变异分析 | 第73-75页 |
| 3.5 K-type等位基因正选择位点分析 | 第75-76页 |
| 3.6 K-type等位基因单倍型分析 | 第76-77页 |
| 3.7 功能性分子标记开发及其应用 | 第77-79页 |
| 4 讨论 | 第79-81页 |
| 4.1 平衡选择在Pike遗传进化中的作用 | 第79页 |
| 4.2 正选择位点在Pike-1等位基因的分布 | 第79页 |
| 4.3 序列变异对抗病基因功能的影响 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-93页 |
| 附录 | 第93-95页 |
| 博士在读期间发表的论文 | 第95-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
