| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 论文创新点 | 第11-12页 |
| 缩略词 | 第12-16页 |
| 第一章 绪论 | 第16-39页 |
| 1.1 研究意义及方法 | 第16-17页 |
| 1.1.1 研究意义 | 第16页 |
| 1.1.2 研究方法 | 第16-17页 |
| 1.2 分子对接 | 第17-34页 |
| 1.2.1 分子对接的理论基础 | 第17-18页 |
| 1.2.2 分子对接打分函数 | 第18-34页 |
| 1.3 量子化学方法在基于结构的药物设计中的应用 | 第34-36页 |
| 1.3.1 应用于药物设计的量子化学计算方法 | 第34-35页 |
| 1.3.2 量子化学计算方法在药物设计中的应用 | 第35-36页 |
| 1.4 论文目标及意义 | 第36-37页 |
| 1.5 本论文主要研究工作 | 第37-39页 |
| 第二章 BC-SAMP策略及DOX方法概述 | 第39-44页 |
| 2.1 BC-SAMP策略概述 | 第39-40页 |
| 2.2 DOX方法概述 | 第40-44页 |
| 2.2.1 计算方法 | 第40-42页 |
| 2.2.2 结合构象评价标准 | 第42-44页 |
| 第三章 DOX方法在人体3-羟基-3甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)体系上的测试研究 | 第44-84页 |
| 3.1 人体HMGR简介 | 第44-48页 |
| 3.2 基于原位对接DOX方法在HMGR体系上的测试研究 | 第48-60页 |
| 3.2.1 计算模型与方法 | 第48-52页 |
| 3.2.2 结果与讨论 | 第52-59页 |
| 3.2.3 小结 | 第59-60页 |
| 3.3 基于自对接DOX方法在HMGR体系上的测试研究 | 第60-76页 |
| 3.3.1 分子对接程序(Surflex)构造HMGR-他汀类分子结合构象空间 | 第60-63页 |
| 3.3.2 ONIOM3单点计算与PM7几何构型优化计算性能比较 | 第63-65页 |
| 3.3.3 基于自对接改进的DOX方法在HMGR体系上的测试研究 | 第65-72页 |
| 3.3.4 改进的DOX方法计算流程总结 | 第72-73页 |
| 3.3.5 基于自对接DOX2.0方法在其他生物体系上的测试研究 | 第73-76页 |
| 3.3.6 小结 | 第76页 |
| 3.4 基于交叉对接DOX2.0方法在HMGR体系上的测试研究 | 第76-83页 |
| 3.4.1 计算模型与方法 | 第77-78页 |
| 3.4.2 结果与讨论 | 第78-82页 |
| 3.4.3 小结 | 第82-83页 |
| 3.5 DOX方法的适用性分析 | 第83-84页 |
| 第四章 DOX方法在共价结合体系蓝藻藻蓝蛋白上测试研究的初步探索 | 第84-97页 |
| 4.1 蓝藻藻蓝蛋白简介 | 第84-87页 |
| 4.2 SAMP策略搜索游离的藻蓝素的构象 | 第87-90页 |
| 4.2.1 计算模型与方法 | 第87页 |
| 4.2.2 结果与讨论 | 第87-90页 |
| 4.3 DOX方法预测藻蓝蛋白与藻蓝素结合构象的初步探索 | 第90-96页 |
| 4.3.1 计算模型与方法 | 第90-93页 |
| 4.3.2 结果与讨论 | 第93-96页 |
| 4.4 本章小结 | 第96-97页 |
| 第五章 靶向人体肝脏FBPase小分子抑制剂的发现与研究 | 第97-114页 |
| 5.1 人体肝脏FPBase简介 | 第97-103页 |
| 5.1.1 Hu-FBPase的结构 | 第97-99页 |
| 5.1.2 AMP及AMP变构位点抑制剂与Hu-FBPase作用方式分析 | 第99-103页 |
| 5.2 基于Hu-FBPase AMP变构位点的虚拟筛选 | 第103-106页 |
| 5.2.1 虚拟筛选流程 | 第103-105页 |
| 5.2.2 虚拟筛选化合物生物活性测试结果 | 第105-106页 |
| 5.3 DOX方法预测先导结构与Hu-FBPase的结合模式 | 第106-112页 |
| 5.3.1 计算模型与方法 | 第107-109页 |
| 5.3.2 结果与讨论 | 第109-111页 |
| 5.3.3 H12与Hu-FBPase结合模式验证 | 第111-112页 |
| 5.4 先导结构的优化设计 | 第112-113页 |
| 5.5 本章小结 | 第113-114页 |
| 第六章 全文总结与展望 | 第114-116页 |
| 6.1 全文总结 | 第114-115页 |
| 6.2 展望 | 第115-116页 |
| 参考文献 | 第116-131页 |
| 附录1 | 第131-137页 |
| 附录2 | 第137-138页 |
| 附录3 | 第138-139页 |
| 附录4 | 第139-146页 |
| 附录5 | 第146-153页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第153-154页 |
| 致谢 | 第154页 |
