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拟南芥(Arabidopsis thaliana)VSP1硒代蛋白衍生物的制备与晶体生长及结构分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 引言第9-24页
    1.1 植物营养贮存蛋白第9-13页
        1.1.1 植物营养贮存蛋白简介第9-11页
        1.1.2 拟南芥营养贮存蛋白第11-13页
    1.2 HAD (haloacid dehalogenase)超家族第13-17页
        1.2.1 HAD (haloacid dehalogenase)超家族酶活性质第13-14页
        1.2.2 HAD超家族的分类及结构第14-17页
    1.3 结构生物学第17-24页
        1.3.1 蛋白质晶体学第17-22页
        1.3.2 蛋白质结构测定的步骤第22-24页
第二章 材料与方法第24-38页
    2.1 实验材料第24-27页
        2.1.1 菌株及质粒第24页
        2.1.2 主要实验试剂第24-25页
        2.1.3 实验主要试剂配方第25-26页
        2.1.4 实验主要仪器第26-27页
    2.2 试验方法第27-38页
        2.2.1 拟南芥VSP1甲硫氨酸突变体的构建第27-30页
        2.2.2 拟南芥VSP1硒代蛋白衍生物的制备第30-33页
        2.2.3 拟南芥VSP1硒代蛋白衍生物的性质分析第33-34页
        2.2.4 拟南芥VSP1硒代蛋白衍生物的晶体生长第34页
        2.2.5 拟南芥VSP1硒代蛋白晶体的数据收集及结构解析第34-35页
        2.2.6 拟南芥VSP1与二价金属离子Mg~(2+)Cu~(2+)的共晶生长第35页
        2.2.7 拟南芥VSP1的活性测定第35-38页
第三章 实验结果第38-53页
    3.1 拟南芥VSP1甲硫氨酸突变体的构建第38页
    3.2 拟南芥VSP1硒代蛋白衍生物的制备第38-40页
        3.2.1 拟南芥VSP1甲硫氨酸突变体的试表达第38-39页
        3.2.2 拟南芥VSP1硒代蛋白的表达纯化第39-40页
    3.3 拟南芥VSP1硒代蛋白衍生物的性质分析第40-43页
        3.3.1 拟南芥VSP1硒代蛋白衍生物聚集状态分析第40-41页
        3.3.2 拟南芥VSP1硒代蛋白衍生物均一性分析第41-42页
        3.3.3 拟南芥VSP1硒代蛋白的圆二色谱分析第42-43页
    3.4 拟南芥VSP1硒代蛋白衍生物的晶体生长第43-44页
        3.4.1 拟南芥VSP1硒代蛋白晶体的初筛第43-44页
        3.4.2 拟南芥VSP1硒代蛋白晶体的优化第44页
    3.5 拟南芥VSP1硒代蛋白晶体的数据收集第44-45页
    3.6 拟南芥VSP1与二价金属离子Mg~(2+)Cu~(2+)的共晶生长第45-47页
        3.6.1 拟南芥VSP1与二价金属离子Mg~(2+)的共晶生长第45-46页
        3.6.2 拟南芥VSP1与二价金属离子Cu~(2+)的共晶生长第46-47页
    3.7 拟南芥VSP1的晶体结构分析第47-49页
        3.7.1 拟南芥VSP1的晶体结构第47-48页
        3.7.2 拟南芥VSP1的晶体结构的活性位点第48-49页
    3.8 拟南芥VSP蛋白的活性测定第49-53页
        3.8.1 拟南芥VSP蛋白底物特异性的测定第49-50页
        3.8.2 拟南芥vspi抑制剂的测定第50页
        3.8.3 拟南芥VSP1蛋白抑制剂的动力学常数测定第50-53页
第四章 讨论第53-60页
    4.1 拟南芥VSP1硒代蛋白衍生物的制备第53页
    4.2 VSP1与二价金属离子Mg~(2+) Cu~(2+)的共晶生长第53-54页
    4.3 拟南芥VSP1晶体结构分析第54-58页
        4.3.1 拟南芥VSP1是植物酸性磷酸酶中解析出的第一个晶体结构第54-55页
        4.3.2 拟南芥VSP1结构在DDDD超家族真核生物成员中具有代表性第55-57页
        4.3.3 VSP1蛋白与P4蛋白的活性位点比较第57-58页
    4.4 VSP酶活性质分析第58-60页
第五章 结论第60-61页
参考文献第61-66页
缩略词表第66-67页
附录第67-73页
    附录Ⅰ: 拟南芥VSP1 mRNA与蛋白序列第67-69页
        1.1 拟南芥VSP1 mRNA序列第67页
        1.2 拟南芥VSP1蛋白序列第67-69页
    附录Ⅱ: Crystal Screen and Crystal Screen 2晶体生长条件第69-71页
        2.1 Crystal Screen晶体生长条件第69-70页
        2.2 Crystal Screen2晶体生长条件第70-71页
    附录Ⅲ: 相关抑制剂结构式第71-73页
致谢第73-74页
攻读学位期间发表的论文第74页

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