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IncRNA-M1ANCR在鸡原始生殖细胞形成过程中作用机制探究

摘要第3-7页
ABSTRACT第7-11页
缩略词表第18-19页
第一章 文献综述第19-38页
    1 原始生殖细胞第19-24页
        1.1 PGCs的生物学特性第19页
        1.2 PGCs的起源与迁移第19-20页
        1.3 PGCs的分离培养与体外诱导第20-21页
        1.4 PGCs形成的调控机制第21-24页
            1.4.1 细胞因子调控PGCs形成第21-22页
                1.4.1.1 视黄酸(RA)第21页
                1.4.1.2 干细胞生长因子(SCF)第21-22页
                1.4.1.3 白血病抑制因子(LIF)第22页
                1.4.1.4 碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)第22页
            1.4.2 关键基因介导信号通路调控PGCs形成第22-23页
                1.4.2.1 SCF/c-kit信号通路第22-23页
                1.4.2.2 gp130信号通路第23页
                1.4.2.3 TGF-β/Smads信号通路第23页
            1.4.3 表观遗传对PGCs形成的调控第23-24页
    2 长链非编码RNA研究进展第24-27页
        2.1 长链非编码RNA概述第24页
        2.2 lncRNA的调控机制第24-26页
            2.2.1 转录调控第24-25页
            2.2.2 转录后调控第25页
            2.2.3 表观遗传学调控第25-26页
                2.2.3.1 lncRNA与DNA甲基化/去甲基化第25-26页
                2.2.3.2 lncRNA与组蛋白修饰第26页
        2.3 lncRNA与细胞分化第26-27页
            2.3.1 lncRNA与胚胎干细胞分化第26页
            2.3.2 lncRNA与生殖细胞分化第26-27页
            2.3.3 lncRNA与其他细胞分化第27页
    3 本研究的目的与意义第27-28页
    4 参考文献第28-38页
第二章 lncRNA-M1ANCR的鉴定与理化性质分析第38-51页
    1 实验材料与方法第38-44页
        1.1 实验材料与试剂第38页
        1.2 实验方法第38-44页
            1.2.1 Trizol法提取如皋黄鸡生殖嵴总RNA第38-39页
            1.2.2 如皋黄鸡生殖嵴组织cDNA库的建立第39页
            1.2.3 lncRNA 3'RACE实验第39-40页
            1.2.4 lncRNA 5'RACE实验第40-41页
            1.2.5 鸡PGCs细胞分离与纯化第41页
            1.2.6 细胞定位检测第41-43页
                1.2.6.1 细胞核质分离第42页
                1.2.6.2 细胞核质RNA提取第42-43页
            1.2.7 lncRNA编码蛋白能力检测第43-44页
                1.2.7.1 原核融合表达载体的构建第43页
                1.2.7.2 菌液蛋白提取第43页
                1.2.7.3 Western Blot检测蛋白表达第43-44页
    2 实验结果第44-49页
        2.1 lncRNA-M1ANCR的筛选第44-45页
        2.2 RACE实验获得lncRNA-M1ANCR全长第45-46页
        2.3 lncRNA-M1ANCR序列生物信息学分析第46页
            2.3.1 lncRNA-M1ANCR ORF预测第46页
            2.3.2 lncRNA-M1ANCR同源性分析第46页
        2.4 lncRNA-MANCR在组织与细胞中的表达检测第46-48页
        2.5 lncRNA-M1ANCR蛋白编码能力的鉴定第48-49页
    3 讨论第49页
    4 本章小结第49-50页
    5 参考文献第50-51页
第三章 lncRNA-M1ANCR在鸡PGCs生成过程中生物学功能探究第51-74页
    1 材料与方法第51-57页
        1.1 实验材料与试剂第51页
        1.2 实验方法第51-57页
            1.2.1 lncRNA干扰载体构建及慢病毒包裹第52页
            1.2.2 慢病毒干扰载体活性检测第52-53页
            1.2.3 lncRNA过表达载体构建与活性检测第53-54页
            1.2.4 ESCs的分离培养第54页
            1.2.5 体外研究lncRNA-M1ANCR在PGCs形成过程中的功能第54-55页
                1.2.5.1 鸡ESCs体外诱导分化试验第54页
                1.2.5.2 实时荧光定量PCR检测生殖相关基因的表达第54-55页
                1.2.5.3 免疫细胞化学检测相关抗原第55页
                1.2.5.4 流式细胞分析检测类PGCs细胞比例第55页
            1.2.6 体内研究lncRNA-M1ANCR在PGCs形成过程中的功能第55-57页
                1.2.6.1 鸡胚血管注射与活体荧光观察第56页
                1.2.6.2 实时荧光定量PCRs检测生殖相关基因的表达第56页
                1.2.6.3 鸡胚石蜡切片第56-57页
                1.2.6.4 PAS染色法检测PGCs第57页
                1.2.6.5 流式细胞分析检测PGCs细胞比例第57页
    2 实验结果第57-70页
        2.1 lncRNA-M1ANCR慢病毒干扰载体的构建与活性检测第57-60页
            2.1.1 干扰载体构建第57-58页
            2.1.2 干扰载体活性检测第58-60页
        2.2 lncRNA-M1ANCR过表达载体的构建与活性检测第60-62页
            2.2.1 lncRNA-M1ANCR过表达载体的构建第60-61页
            2.2.2 lncRNA-M1ANCR过表达载体活性检测第61-62页
        2.3 体外研究lncRNA-M1ANCR在PGCs形成过程中的功能第62-67页
            2.3.1 不同lncRNA-M1ANCR表达水平下PGCs形成过程中细胞形态变化第62-63页
            2.3.2 不同lncRNA-M1ANCR表达水平下生殖标记基因的表达变化第63-64页
            2.3.3 细胞免疫化学检测相关抗原第64-66页
            2.3.4 流式细胞分析检测类PGCs样细胞比例第66-67页
        2.4 体内研究lncRNA-M1ANCR在PGCs形成过程中的功能第67-70页
            2.4.1 鸡胚石蜡切片观察及PAS染色第67-68页
            2.4.2 实时荧光定量PCR检测相关基因表达第68-69页
            2.4.3 流式细胞分析检测PGCs细胞比例第69-70页
    3 讨论第70-71页
    4 本章小结第71页
    5 参考文献第71-74页
第四章 启动子对lncRNA-M1ANCR表达的影响第74-88页
    1 实验材料与方法第74-79页
        1.1 实验材料与试剂第74页
        1.2 实验方法第74-79页
            1.2.1 lncRNA启动子区域的生物信息学分析第74-75页
            1.2.2 鸡胚全基因组的提取第75页
            1.2.3 真核表达载体pM1ANCR-EGFP与启动子各缺失片段载体的构建第75-77页
                1.2.3.1 lncRNA-M1ANCR启动子区域真核表达载体构建第75-76页
                1.2.3.2 启动子各缺失片段载体的构建第76-77页
            1.2.4 lncRNA启动子活性定性分析第77页
                1.2.4.1 pM1ANCR-EGFP质粒的提取第77页
                1.2.4.2 pM1ANCR-EGFP质粒转染第77页
            1.2.5 lncRNA启动子核心区域的鉴定第77-78页
            1.2.6 lncRNA启动子核心区域转录因子分析第78页
            1.2.7 转录因子p53干扰载体与过表达载体的构建第78页
            1.2.8 转录因子反式调控的启动子活性检测第78-79页
    2 实验结果第79-85页
        2.1 真核表达载体pM1ANCR-EGFP与启动子各缺失片段载体的构建第79-80页
        2.2 lncRNA启动子活性定性分析第80页
        2.3 lncRNA启动子核心区域分析第80-81页
        2.4 p53基因干扰载体与过表达载体的构建与活性检测第81-84页
        2.5 转录因子p53对启动子活性的影响第84-85页
    3 讨论第85-86页
    4 本章小结第86页
    5 参考文献第86-88页
第五章 lncRNA-M1ANCR影响PGCs形成的分子机制初探第88-115页
    1 实验材料与方法第88-97页
        1.1 实验材料与试剂第88-89页
        1.2 实验方法第89-97页
            1.2.1 RNA pull down筛选鉴定互作蛋白第89-92页
                1.2.1.1 RNA pulldown筛选lncRNA互作蛋白第89-91页
                1.2.1.2 RIP实验第91-92页
            1.2.2 lncRNA互作miRNA分析第92页
            1.2.3 miRNA抑制物的构建第92-93页
                1.2.3.1 miRNA-lnhibitor引物的设计第92页
                1.2.3.2 miRNA-lnhibitor慢病毒重组质粒的构建第92-93页
            1.2.4 miRNA模拟物的构建第93-95页
                1.2.4.1 pri- miR引物的设计第93-94页
                1.2.4.2 pri-miR病毒重组质粒的构建第94-95页
                    1.2.4.2.1 载体的双酶切第94页
                    1.2.4.2.2 目的片段的扩增及酶切第94页
                    1.2.4.2.3 过表达载体与目的片段的连接第94-95页
                    1.2.4.2.4 转化第95页
                    1.2.4.2.5 测序第95页
            1.2.5 鸡ESCs体外诱导实验第95页
            1.2.6 microRNA的提取第95-96页
                1.2.6.1 组织裂解第95页
                1.2.6.2 分离小RNA第95-96页
                1.2.6.3 miRNA的分离纯化第96页
            1.2.7 miRNA qRT-PCR引物合成与SYBR GREEN I实时荧光定量PCR第96页
            1.2.8 实时荧光定量检测MAPK/ERK和Wnt信号通路关键基因表达第96-97页
            1.2.9 流式细胞分析检测类PGCs细胞比例第97页
    2 实验结果第97-111页
        2.1 基于RNA pull down技术筛选lncRNA-M1ANCR互作蛋白第97-100页
            2.1.1 RNA pull down结果分析筛选互作蛋白第97-99页
            2.1.2 Western Blot检测与RIP实验确定lncRNA-M1ANCR与ILF3存在互作第99-100页
        2.2 lncRNA-M1ANCR与miRNA竞争性结合抑制机制初探第100-110页
            2.2.1 分析预测与lncRNA及靶基因存在互作关系的microRNA第100页
            2.2.2 microRNA模拟物与抑制物的构建与活性检测第100-103页
                2.2.2.1 microRNA模拟物与抑制物的构建第100-101页
                2.2.2.2 microRNA模拟物与抑制物的活性检测第101-103页
            2.2.3 体外研究miRNA在PGCs形成过程中的功能第103-105页
                2.2.3.1 不同miRNA表达水平下PGCs形成过程中细胞形态变化第103-104页
                2.2.3.2 不同miRNA表达水平下下MAPK1、lncRNA-M1ANCR和生殖标记基因动态变化第104-105页
            2.2.4 流式细胞分析检测类PGCs样细胞数量第105-109页
            2.2.5 拯救实验第109-110页
        2.3 实时荧光定量检测MAPK信号通路关键基因表达变化第110-111页
    3 讨论第111-113页
    4 本章小结第113页
    5 参考文献第113-115页
全文结论与创新第115-117页
    全文结论第115页
    全文创新点第115-117页
致谢第117-119页
附录第119-121页
研究生期间发表的论文第121-123页

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