| 摘要 | 第4-8页 |
| Abstract | 第8-12页 |
| 第一章 绪论 | 第19-43页 |
| 1.1 内禀无序蛋白质研究现状及问题提出 | 第19-26页 |
| 1.1.1 内禀无序蛋白质 | 第19-21页 |
| 1.1.2 内禀无序蛋白质的组成和结构特征 | 第21-23页 |
| 1.1.3 内禀无序蛋白质的研究方法和研究历程 | 第23-26页 |
| 1.2 淀粉样蛋白质与外源分子相互作用研究进展以及研究目的 | 第26-29页 |
| 1.3 钙调蛋白与二氧化硫分子相互作用机制选题背景 | 第29-32页 |
| 1.4 分子模拟方法简介 | 第32-41页 |
| 1.4.1 蒙特卡洛方法和CAMPARI软件简介 | 第32-36页 |
| 1.4.2 分子动力学方法 | 第36-41页 |
| 1.5 本章小结 | 第41-43页 |
| 第二章 内禀无序蛋白质序列与结构关系的研究 | 第43-61页 |
| 2.1 引言 | 第43-44页 |
| 2.2 模型与方法 | 第44-47页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第47-60页 |
| 2.3.1 多肽结构从扩展到紧密转变的主要驱动力来源于经典的疏水相互作用 | 第47-48页 |
| 2.3.2 E_mA_nK_m系统构象特性不仅受到平均疏水性H影响也受到模式参数κ调制 | 第48-50页 |
| 2.3.3 系统结构从扩展到紧密转变的进一步验证 | 第50-55页 |
| 2.3.4 NCPR-H相图 | 第55-57页 |
| 2.3.5 互补离子凝聚模型在IDPs结构上的一些应用 | 第57-60页 |
| 2.4 本章小结 | 第60-61页 |
| 第三章 淀粉样蛋白与客体分子相互作用的分子动力学模拟 | 第61-95页 |
| 3.1 背景介绍 | 第61-63页 |
| 3.2 石墨烯与人类胰岛淀粉样多肽相互作用分子动力学模拟研究 | 第63-78页 |
| 3.2.1 模型与方法 | 第64页 |
| 3.2.2 人类胰岛淀粉样多肽单体与石墨烯相互作用模型 | 第64-65页 |
| 3.2.3 结果与讨论 | 第65-71页 |
| 3.2.4 人类胰岛淀粉样多肽二聚体与石墨烯相互作用模型 | 第71-72页 |
| 3.2.5 结果与讨论 | 第72-78页 |
| 3.3 二氧化硫分子通过增强二次成核促进Aβ_(17-42)纤维的生长 | 第78-93页 |
| 3.3.1 模型与方法 | 第78-82页 |
| 3.3.2 结果与讨论 | 第82-93页 |
| 3.4 本章小结 | 第93-95页 |
| 第四章 二氧化硫与钙调蛋白相互作用的分子动力学模拟 | 第95-107页 |
| 4.1 引言 | 第95-96页 |
| 4.2 模型与方法 | 第96-97页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第97-106页 |
| 4.3.1 钙调蛋白整体结构的稳定性分析 | 第97-98页 |
| 4.3.2 二氧化硫分子对钙调蛋白天然构象变构的影响 | 第98-100页 |
| 4.3.3 二氧化硫分子对钙调蛋白二级结构的影响 | 第100页 |
| 4.3.4 二氧化硫分子对钙调蛋白EF-hand螺旋夹角的影响 | 第100-103页 |
| 4.3.5 二氧化硫分子对钙调蛋白与钙离子配位的影响 | 第103-106页 |
| 4.4 本章小结 | 第106-107页 |
| 第五章 总结与展望 | 第107-109页 |
| 附录 | 第109-115页 |
| 参考文献 | 第115-135页 |
| 科研情况 | 第135-137页 |
| 致谢 | 第137-138页 |
