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西北地区马铃薯主栽品种的抗晚疫病性评价及致病疫霉菌候选核心RXLR效应基因的鉴定

摘要第6-8页
abstract第8-9页
第一章 文献综述第13-48页
    1.1 马铃薯和晚疫病概述第13-14页
    1.2 致病疫霉菌研究概述第14-31页
        1.2.1 致病疫霉菌分类学研究第14-16页
        1.2.2 致病疫霉菌形态学研究第16-18页
        1.2.3 致病疫霉菌生物学研究第18-20页
        1.2.4 致病疫霉菌病理学研究第20-23页
        1.2.5 致病疫霉菌防控研究第23-24页
        1.2.6 致病疫霉菌群体研究第24-28页
        1.2.7 致病疫霉菌起源和迁徙研究第28-31页
    1.3 致病疫霉菌RXLR效应因子研究第31-46页
        1.3.1 致病疫霉菌RXLR效应因子与植物病原互作第31-35页
        1.3.2 致病疫霉菌RXLR效应因子生物学功能研究第35-40页
        1.3.3 致病疫霉菌RXLR效应因子基因组学研究第40-42页
        1.3.4 致病疫霉菌RXLR效应因子转录组学研究第42-43页
        1.3.5 致病疫霉菌RXLR效应因子进化研究第43-44页
        1.3.6 致病疫霉菌RXLR效应因子变异与抗病性丧失研究第44-45页
        1.3.7 致病疫霉菌RXLR效应因子辅助抗病育种研究第45-46页
    1.4 本研究的目的和意义第46-48页
第二章 西北地区马铃薯主栽品种抗晚疫病性评价第48-63页
    2.1 试验材料、试剂与仪器第49-51页
        2.1.1 试验材料第49-50页
        2.1.2 试剂第50-51页
        2.1.3 仪器第51页
    2.2 试验方法第51-54页
        2.2.1 马铃薯田间抗病性试验第51-53页
        2.2.2 马铃薯抗病基因分析第53-54页
    2.3 结果与分析第54-60页
        2.3.1 抗病性评估结果第54-55页
        2.3.2 瞬时表达系统稳定性测试第55-57页
        2.3.3 抗病基因组成分析第57-58页
        2.3.4 抗病基因数量与抗病性水平间关系第58-60页
    2.4 讨论第60-63页
第三章 致病疫霉菌侵染早期高表达核心RXLR效应基因鉴定第63-96页
    3.1 试验材料、试剂与仪器第65-67页
        3.1.1 试验材料第65页
        3.1.2 试剂第65-67页
        3.1.3 仪器第67页
    3.2 试验方法第67-72页
        3.2.1 致病疫霉菌培养和游动孢子制备第67页
        3.2.2 马铃薯培养第67页
        3.2.3 离体叶片接种第67-68页
        3.2.4 染色和观察第68页
        3.2.5 侵染材料制备和RNA提取第68-69页
        3.2.6 转录组测序第69页
        3.2.7 比对和拼接第69-70页
        3.2.8 RXLR效应基因拼接和预测第70页
        3.2.9 RXLR效应基因SNPs提取和多态性分析第70页
        3.2.10 候选RXLR效应基因筛选和初步功能分析第70页
        3.2.11 RXLR效应基因表达水平定量PCR验证第70-71页
        3.2.12 引物设计与合成第71-72页
        3.2.13 实时荧光定量PCR(Real-timePCR)第72页
    3.3 结果与分析第72-91页
        3.3.1 致病疫霉菌多样性菌株选择第72-75页
        3.3.2 致病疫霉菌早期侵染关键时间点确认第75-76页
        3.3.3 致病疫霉菌测序数据比对和拼接第76-77页
        3.3.4 菌株特有RXLR效应基因的确认第77-78页
        3.3.5 RXLR效应基因表达水平确认第78页
        3.3.6 菌株RXLR效应基因表达特征分析第78-80页
        3.3.7 部分RXLR效应基因表达检测第80-81页
        3.3.8 已知RXLR无毒基因序列变异分析第81-82页
        3.3.9 无毒性RXLR效应基因的表达影响毒性第82页
        3.3.10 菌株RXLR效应基因SNPs和dN/dS分析第82-84页
        3.3.11 RXLR效应基因SNPs、dN/dS和表达水平关联分析第84-85页
        3.3.12 侵染早期高表达序列保守RXLR效应基因候选第85-87页
        3.3.13 候选核心RXLR效应基因促进致病疫霉菌的侵染和扩展第87页
        3.3.14 候选RXLR效应基因功能初步分析第87-91页
    3.4 讨论第91-96页
第四章 结论和创新点第96-98页
    4.1 结论第96页
    4.2 创新点第96-98页
参考文献第98-111页
致谢第111-113页
作者简介第113页

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