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基于代谢组学的NWMN0037调控金黄色葡萄球菌持留形成及毒力的机制研究

摘要第3-6页
Abstract第6-8页
第一章 研究背景第13-18页
    1.1 前言第13页
    1.2 持留菌及其与疾病的关系第13-14页
    1.3 持留菌形成可能的机制第14-15页
        1.3.1 毒素/抗毒素(toxin/antitoxin,TA)系统第14页
        1.3.2 细胞代谢和能量产生的影响第14-15页
        1.3.3 生物被膜促进持留菌形成第15页
        1.3.4 氧化应激诱导第15页
        1.3.5 其他机制如化学信号机制、反式翻译机制等第15页
    1.4 金黄色葡萄球菌的主要毒力因素第15-16页
    1.5 代谢组学概述及主要应用第16页
    1.6 本研究的目的和意义第16-18页
第二章 实验材料与方法第18-32页
    2.1 实验菌株第18页
    2.2 主要试剂和材料第18-19页
    2.3 主要仪器第19页
    2.4 主要实验方法第19-30页
        2.4.1 抗生素的配制第19-20页
        2.4.2 主要的培养基配制第20页
        2.4.3 主要试剂的配制第20-21页
        2.4.4 抗菌药物暴露下金黄色葡萄球菌野生株、突变株及回补株的生长比较第21页
        2.4.5 金黄色葡萄球菌野生株、突变株代谢组学样品准备第21-22页
        2.4.6 代谢组学样品预处理第22页
        2.4.7 质控样本(QC)的制备第22页
        2.4.8 色谱-质谱分析第22-23页
        2.4.9 金黄色葡萄球菌野生株、突变株及回补株总RNA的提取第23-24页
        2.4.10 实时荧光定量PCR检验金黄色葡萄球菌碳水化合物代谢通路基因表达变化第24-28页
        2.4.11 金黄色葡萄球菌野生株、突变株及回补株总蛋白的提取第28-29页
        2.4.12 金黄色葡萄球菌野生株、突变株及回补株乳酸脱氢酶(LDH)检测第29页
        2.4.13 实时荧光定量PCR检验金黄色葡萄球菌毒力相关基因表达变化第29-30页
        2.4.14 金黄色葡萄球菌野生株、突变株及回补株血浆凝固酶试验对比第30页
    2.5 数据处理分析第30-32页
        2.5.1 qPCR结果数据分析第30-31页
        2.5.2 细菌LDH浓度测定结果数据分析第31-32页
第三章 结果第32-95页
    3.1 金黄色葡萄球菌野生株、突变株和回补株不同培养时间点对药物的敏感性第32-33页
    3.2 代谢组检测结果第33-88页
        3.2.1 实验质量控制第33-35页
        3.2.2 各组样本的代谢谱图第35-39页
        3.2.3 数据分析第39-49页
        3.2.4 显著差异代谢物第49-61页
        3.2.5 差异代谢物生物信息学分析第61-88页
    3.3 金黄色葡萄球菌总RNA提取后凝胶电泳结果第88页
    3.4 金黄色葡萄球菌野生株、突变株及回补株参与糖代谢主要基因表达水平qPCR检测结果第88-92页
    3.5 金黄色葡萄球菌野生株、突变株及回补株LDH检测结果第92-93页
    3.6 金黄色葡萄球菌野生株、突变株及回补株主要毒力基因表达水平qPCR检测结果第93-94页
    3.7 金黄色葡萄球菌野生株、突变株及回补株血浆凝固酶试验结果第94-95页
第四章 讨论第95-102页
    4.1 NWMN_0037对金黄色葡萄球菌代谢的整体影响第95-96页
    4.2 NWMN_0037对金黄色葡萄球菌糖酵解/糖异生和TCA途径的影响第96-98页
    4.3 NWMN_0037对金黄色葡萄球菌甘油磷脂代谢的影响第98-99页
    4.4 NWMN_0037对金黄色葡萄球菌核苷酸代谢的影响第99-100页
    4.5 NWMN_0037对金黄色葡萄球菌毒力的调控第100-102页
第五章 结论第102-103页
参考文献第103-109页
在学期间的研究成果第109-110页
中英文对照缩略词表第110-111页
致谢第111页

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