| 本研究由 | 第3页 |
| 提供资助 | 第3-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 目录 | 第10-12页 |
| 文献综述 | 第12-21页 |
| 第一章 甲型H1N1流感与miRNA研究进展 | 第12-21页 |
| 1.1 甲型H1N1流感病毒研究进展 | 第12-14页 |
| 1.2 miRNA研究进展 | 第14-18页 |
| 1.2.1 miRNA的发现 | 第14页 |
| 1.2.2 miRNA的产生及作用机制 | 第14-15页 |
| 1.2.3 miRNA的功能和相关疾病研究 | 第15-16页 |
| 1.2.4 miRNA的主要研究手段 | 第16-17页 |
| 1.2.5 miRNA相关数据库 | 第17-18页 |
| 1.3 生物复杂网络研究进展 | 第18-19页 |
| 1.3.1 miRNA-mRNA靶标调控网络 | 第18-19页 |
| 1.3.2 miRNA介导的蛋白质相互作用网络 | 第19页 |
| 1.3.3 TF-miRNA调控网络 | 第19页 |
| 1.4 研究目的及意义 | 第19-21页 |
| 实验研究 | 第21-62页 |
| 第二章 甲型H1N1感染仔猪肺泡巨噬细胞的深度测序数据处理 | 第21-35页 |
| 2.1 材料 | 第21页 |
| 2.2 方法 | 第21-22页 |
| 2.2.1 小RNA深度测序数据初步处理 | 第21页 |
| 2.2.2 与已知miRNA的比对 | 第21页 |
| 2.2.3 已知miRNA的差异分析 | 第21-22页 |
| 2.2.4 差异表达miRNA的聚类分析 | 第22页 |
| 2.3 实验结果 | 第22-34页 |
| 2.3.1 小RNA深度测序数据初步处理 | 第22-25页 |
| 2.3.2 与已知miRNA的比对 | 第25-26页 |
| 2.3.3 已知miRNA的差异分析 | 第26-32页 |
| 2.3.4 差异表达miRNA的聚类分析 | 第32-34页 |
| 2.4 讨论 | 第34页 |
| 2.5 小结 | 第34-35页 |
| 第三章 甲型H1N1病毒感染仔猪肺泡巨噬细胞差异表达miRNA的系统生物学分析 | 第35-62页 |
| 3.1 材料 | 第35页 |
| 3.2 方法 | 第35-38页 |
| 3.2.1 差异miRNA相关的转录因子 | 第35-36页 |
| 3.2.2 差异miRNA靶标预测 | 第36页 |
| 3.2.3 差异miRNA靶标的GO功能富集分析 | 第36-37页 |
| 3.2.4 差异miRNA靶标的通路分析 | 第37页 |
| 3.2.5 差异miRNA介导的蛋白质相互作用网络网络 | 第37页 |
| 3.2.6 差异miRNA介导的蛋白质互作网络的拓扑属性 | 第37-38页 |
| 3.3 实验结果 | 第38-58页 |
| 3.3.1 差异miRNA相关的转录因子 | 第38-39页 |
| 3.3.2 差异miRNA靶标预测 | 第39-41页 |
| 3.3.3 差异miRNA靶标GO功能富集 | 第41-49页 |
| 3.3.4 差异miRNA靶标通路富集分析 | 第49-53页 |
| 3.3.5 差异miRNA调控的蛋白质网络 | 第53-56页 |
| 3.3.6 差异miRNA介导的蛋白质互作网络的拓扑属性分析 | 第56-58页 |
| 3.4 讨论 | 第58-61页 |
| 3.5 小结 | 第61-62页 |
| 结论 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 作者简介 | 第69页 |
