| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 非核糖体肽合成酶(NRPS)：结构、功能、基因及基因的分析方法 | 第13-43页 |
| 1 肽类次生代谢物 | 第13-15页 |
| 2 非核糖体肽合成酶NRPS | 第15-24页 |
| 2.1 NRPS基因结构 | 第17-20页 |
| 2.2 NRPS的功能多样性 | 第20-22页 |
| 2.3 NRPS基因的特征 | 第22-24页 |
| 3 Epichloae内生真菌的NRPS基因及其和生物碱合成的关系 | 第24-32页 |
| 3.1 Epichloae内生真菌中的NRPS基因 | 第24-27页 |
| 3.2 Epichloae内生真菌中的生物碱 | 第27-32页 |
| 3.2.1 麦角类生物碱(ergot alkaloids)的合成 | 第27-29页 |
| 3.2.2 吡咯并吡嗪类生物碱 | 第29-32页 |
| 3.3 E.festucae E2368中NRPS基因的分布 | 第32页 |
| 4 如何分析NRPS基因? | 第32-34页 |
| 5 数据库 | 第34-35页 |
| 6 新NRPS基因的研究 | 第35-36页 |
| 6.1 如何确定新的NRPS基因 | 第35-36页 |
| 6.2 新NRPS基因的生物合成 | 第36页 |
| 7 本研究的主要内容和意义 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-43页 |
| 第一章 Epichloe yangzii内生真菌的检测、分离、培养及鉴定 | 第43-53页 |
| 摘要 | 第43页 |
| 前言 | 第43-45页 |
| 1 材料和方法 | 第45-46页 |
| 1.1 植物样品的采集、保存和鉴定 | 第45页 |
| 1.2 内生真菌的镜检 | 第45页 |
| 1.3 内生真菌的分离、纯化和保藏 | 第45页 |
| 1.4 内生真菌的培养以及培养物的特征调查 | 第45-46页 |
| 2 结果与分析 | 第46-49页 |
| 2.1 带子座样品的采集及鉴定 | 第46页 |
| 2.2 菌株的分离、培养和保藏 | 第46-47页 |
| 2.3 菌株的形态学特征 | 第47-49页 |
| 3 讨论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-53页 |
| 第二章 禾本科植物内生真菌基因组DNA的快速提取 | 第53-63页 |
| 摘要 | 第53页 |
| 前言 | 第53-54页 |
| 1 材料与方法 | 第54-56页 |
| 1.1 材料 | 第54-55页 |
| 1.2 禾本科植物内生真菌样品的采集、检测、分离、培养和保藏 | 第55页 |
| 1.3 禾本科植物内生真菌基因组DNA的提取 | 第55页 |
| 1.4 NRPS基因片段的扩增、检测、测序 | 第55页 |
| 1.5 NRPS基因的序列分析 | 第55-56页 |
| 2 结果 | 第56-58页 |
| 2.1 内生真菌基因组DNA的提取和检测 | 第56-57页 |
| 2.2 NRPS基因的检测及序列比对 | 第57-58页 |
| 3. 讨论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-63页 |
| 第三章 NRPS基因探索——CODEHOP的利用 | 第63-73页 |
| 摘要 | 第63页 |
| 前言 | 第63-64页 |
| 1 材料与方法 | 第64-69页 |
| 1.1 供试菌株与培养基 | 第64-65页 |
| 1.2 试剂 | 第65页 |
| 1.3 禾本科植物内生真菌基因组DNA的提取 | 第65页 |
| 1.4 新NRPS基因的扩增 | 第65-69页 |
| 2 结果与分析 | 第69-70页 |
| 2.1 简并引物的筛选 | 第69页 |
| 2.2 目的片段的扩增 | 第69-70页 |
| 2.3 序列比对分析 | 第70页 |
| 3 讨论 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-73页 |
| 第四章 Epichloe yangzii中NRPS基因分布检测及特征分析 | 第73-91页 |
| 摘要 | 第73页 |
| 前言 | 第73-74页 |
| 1 材料与方法 | 第74-79页 |
| 1.1 材料 | 第74-75页 |
| 1.2 方法 | 第75-79页 |
| 2 结果与分析 | 第79-85页 |
| 2.1 内生真菌Epichloe yangzii基因组DNA的提取 | 第79-80页 |
| 2.2 NRPS基因的扩增结果及序列分析 | 第80-82页 |
| 2.3 我国Epichloe yangzii中NRPS基因的分布 | 第82-83页 |
| 2.4 NRPS基因的系统发育学研究 | 第83-85页 |
| 3 讨论 | 第85-88页 |
| 参考文献 | 第88-91页 |
| 第五章 我国E. yangzii菌株中perA基因的克隆及检测 | 第91-109页 |
| 摘要 | 第91页 |
| 前言 | 第91-92页 |
| 1 材料与方法 | 第92-102页 |
| 1.1 供试菌株与培养基 | 第92-93页 |
| 1.2 试剂 | 第93页 |
| 1.3 禾本科植物内生真菌基因组DNA的提取 | 第93页 |
| 1.4 perA基因的克隆 | 第93-95页 |
| 1.5 perA全长的拼接 | 第95页 |
| 1.6 目的片段的DNA序列分析 | 第95-99页 |
| 1.7 perA基因分布检测 | 第99-102页 |
| 2 结果与分析 | 第102-105页 |
| 2.1 perA基因片段的克隆 | 第102-103页 |
| 2.2 perA基因氨基酸同源性分析 | 第103页 |
| 2.3 perA基因结构域分析 | 第103-104页 |
| 2.4 perA基因的分布检测 | 第104-105页 |
| 3 讨论 | 第105-107页 |
| 参考文献 | 第107-109页 |
| 第六章 基于宏基因组的禾本科植物内生真菌宿主依赖性研究 | 第109-121页 |
| 摘要 | 第109页 |
| 前言 | 第109-111页 |
| 1 材料与方法 | 第111-112页 |
| 1.1 材料 | 第111页 |
| 1.2 方法 | 第111-112页 |
| 2 结果与分析 | 第112-116页 |
| 2.1 宏基因组的提取结果 | 第113页 |
| 2.2 NRPS8基因片段特异性扩增 | 第113-114页 |
| 2.3 内生真菌的宿主依赖特性的验证 | 第114-116页 |
| 3 讨论 | 第116-118页 |
| 参考文献 | 第118-121页 |
| 综合讨论 | 第121-125页 |
| 参考文献 | 第124-125页 |
| 全文结论 | 第125-127页 |
| 附录 | 第127-137页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文 | 第137-139页 |
| 致谢 | 第139页 |
