| 博士学位论文答辩委员会成员名单 | 第5-9页 |
| 摘要 | 第9-10页 |
| Abstract | 第10页 |
| 第一部分 前言 | 第11-31页 |
| 一 表观遗传学 | 第11页 |
| 二 基因的存在状态—染色质 | 第11-13页 |
| 三 染色质的重要组分—组蛋白 | 第13-16页 |
| 1.3.1 核心组蛋白 | 第13-15页 |
| 1.3.2 组蛋白变异体 | 第15-16页 |
| 四 组蛋白修饰 | 第16-31页 |
| 1.4.1 组蛋白修饰的种类 | 第16-17页 |
| 1.4.2 组蛋白修饰作用途径 | 第17-19页 |
| 1.4.3 组蛋白修饰的作用 | 第19-21页 |
| 1.4.3.1 组蛋白修饰与基因转录 | 第19页 |
| 1.4.3.2 组蛋白修饰与细胞分化 | 第19-20页 |
| 1.4.3.3 组蛋白修饰与DNA损伤修复 | 第20页 |
| 1.4.3.4 组蛋白修饰与细胞程序性死亡 | 第20页 |
| 1.4.3.5 组蛋白修饰与衰老 | 第20-21页 |
| 1.4.3.6 组蛋白修饰与肿瘤 | 第21页 |
| 1.4.4 组蛋白甲基化修饰 | 第21-25页 |
| 1.4.4.1 组蛋白甲基化概述 | 第21-22页 |
| 1.4.4.2 组蛋白甲基化与活跃转录 | 第22-23页 |
| 1.4.4.3 组蛋白甲基化与转录沉默 | 第23-24页 |
| 1.4.4.4 组蛋白甲基转移酶 | 第24页 |
| 1.4.4.5 组蛋白去甲基化酶 | 第24-25页 |
| 1.4.5 组蛋白修饰信息的解读 | 第25-31页 |
| 1.4.5.1 组蛋白修饰识别蛋白的鉴定 | 第25-27页 |
| 1.4.5.2 组蛋白修饰识别蛋白的功能 | 第27-28页 |
| 1.4.5.3 识别组蛋白修饰的保守结构域 | 第28页 |
| 1.4.5.4 识别组蛋白赖氨酸甲基化的结构基础 | 第28-31页 |
| 第二部分 MTA家族蛋白对组蛋白H3的特异结合 | 第31-50页 |
| 一 中英文摘要 | 第31-33页 |
| 摘要 | 第31-32页 |
| Abstract | 第32-33页 |
| 二 引言 | 第33-35页 |
| 三 实验结果 | 第35-47页 |
| 2.3.1 NuRD复合体结合组蛋白H3 N端多肽 | 第35-37页 |
| 2.3.2 NuRD复合体中MTA家组蛋白与组蛋白H3 N端多肽直接结合 | 第37-40页 |
| 2.3.3 MTA1的H3结合区域(H3BD)位于其C端 | 第40-42页 |
| 2.3.4 MTA2的C端同样含有H3BD | 第42-44页 |
| 2.3.5 MTA1的H3BD介导了HDAC1/2核心复合体对H3多肽的结合 | 第44-46页 |
| 2.3.6 在细胞内MTA1的H3BD本身足以与染色质结合 | 第46-47页 |
| 四 讨论与分析 | 第47-50页 |
| 2.4.1 在第一类HDAC复合体中唯有NuRD高亲和力结合H3多肽 | 第47-48页 |
| 2.4.2 MTA家组蛋白是一组新的H3结合蛋白 | 第48页 |
| 2.4.3 或许多个亚基协同介导了NuRD对H3多肽的高效结合 | 第48-50页 |
| 第三部分 富含酸性氨基酸的蛋白基序是一种新的组蛋白甲基化识别原件 | 第50-80页 |
| 一 中英文摘要 | 第50-53页 |
| 摘要 | 第50-51页 |
| Abstract | 第51-53页 |
| 二 引言 | 第53-56页 |
| 三 实验结果 | 第56-77页 |
| 3.3.1 H3K4me2特异结合蛋白的鉴定 | 第56-58页 |
| 3.3.2 NPM1、NCL、INHAT复合体直接与H3K4me2发生特异的相互作用 | 第58-61页 |
| 3.3.3 NPM1、NCL、INHAT复合体直接与H3K4me2发生特异的相互作用 | 第61-62页 |
| 3.3.4 我们鉴定到的H3K4me2的结合蛋白都含有酸性区域 | 第62-65页 |
| 3.3.5 酸性区域负责H3K4me2的选择性结合 | 第65-67页 |
| 3.3.6 酸性区域结合组蛋白的能力只与其长度有关而与其序列无关 | 第67-69页 |
| 3.3.7 酸性区域蛋白对H3K4不同甲基化的差异结合具有高度选择性 | 第69-70页 |
| 3.3.8 酸性区域本身在细胞中足以定位在染色质上H3K4me2富集的区域 | 第70-71页 |
| 3.3.9 酸性区域介导NPM1、UBF和NCL的rDNA定位及转录调控 | 第71-73页 |
| 3.3.10 人类基因组中1502个酸性区域蛋白绝大多数参与染色质相关功能 | 第73-77页 |
| 四 讨论与分析 | 第77-80页 |
| 3.4.1 成功鉴定到一组新的H3K4me2结合蛋白 | 第77页 |
| 3.4.2 酸性区域介导组蛋白甲基化差异结合 | 第77-78页 |
| 3.4.3 H3K4me2和H3K4me3蕴含不同的生物学信息 | 第78页 |
| 3.4.4 酸性区域蛋白的功能与酸性区域有关 | 第78-79页 |
| 3.4.5 人类基因组中大量的含酸性区域蛋白大多是一些染色质相关蛋白 | 第79-80页 |
| 第四部分 实验材料与方法 | 第80-88页 |
| 一 抗体 | 第80页 |
| 二 质粒 | 第80-84页 |
| 三 组蛋白N端多肽 | 第84页 |
| 四 试剂 | 第84-85页 |
| 五 组蛋白多肽体外结合实验 | 第85页 |
| 六 染色质免疫共沉淀（PCR检测） | 第85-87页 |
| 七 染色质免疫共沉淀（免疫印迹检测） | 第87页 |
| 八 紫外诱导的BPa “0距离”蛋白交联实验 | 第87-88页 |
| 附表1： 人类基因组中含酸性区域的蛋白 | 第88-123页 |
| 参考文献 | 第123-134页 |
| 在读期间发表(或待发表)论文 | 第134-135页 |
| 致谢 | 第135页 |
