摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第1章 引言 | 第9-23页 |
1.1 琼胶酶 | 第9-11页 |
1.1.1 琼胶酶简介 | 第9页 |
1.1.2 琼胶酶的应用 | 第9-10页 |
1.1.3 琼胶酶的研究现状 | 第10-11页 |
1.2 酶及其耐热性 | 第11-14页 |
1.2.1 酶的热稳定性 | 第11页 |
1.2.2 热稳定性分类 | 第11-12页 |
1.2.3 热稳定性的影响因素 | 第12-14页 |
1.3 结构认知的模式识别算法 | 第14-15页 |
1.3.1 均匀设计 | 第14页 |
1.3.2 数据集的划分方案 | 第14页 |
1.3.3 支持向量机回归 | 第14-15页 |
1.4 分子动力学模拟 | 第15-19页 |
1.4.1 常用分子动力学模拟及结果分析软件 | 第16页 |
1.4.2 NAMD 的分子模拟 | 第16-19页 |
1.4.3 NAMD的模拟过程 | 第19页 |
1.5 本课题的立题依据、研究意义及论文创新点 | 第19-23页 |
1.5.1 立题依据 | 第19-20页 |
1.5.2 研究意义 | 第20页 |
1.5.3 论文创新点 | 第20-23页 |
第2章 β -琼胶酶最适温度的预测及实验验证 | 第23-47页 |
2.1 引言 | 第23-24页 |
2.2 实验材料 | 第24-29页 |
2.2.1 数据集 | 第24-26页 |
2.2.2 β-琼胶酶结构参数的计算与提取 | 第26-27页 |
2.2.3 数学建模的方法 | 第27-28页 |
2.2.4 重组β-琼胶酶最适温度的测定 | 第28-29页 |
2.3 结果与讨论 | 第29-45页 |
2.3.1 重组β-琼胶酶的酶学性质测定 | 第29-31页 |
2.3.2 基于分段氨基酸组成预测β-琼胶酶的最适温度 | 第31-38页 |
2.3.3 基于相对溶液可及性预测β-琼胶酶的最适温度 | 第38-45页 |
2.4 本章小结 | 第45-47页 |
第3章 基于分子动力学模拟探究β -琼胶酶的热稳定性 | 第47-63页 |
3.1 引言 | 第47页 |
3.2 材料与方法 | 第47-49页 |
3.2.1 初始结构 | 第47-48页 |
3.2.2 分子动力学模拟 | 第48-49页 |
3.3 结果与分析 | 第49-62页 |
3.3.1 序列和结构的比对 | 第49-50页 |
3.3.2 β-琼胶酶在不同模拟温度下的热稳定性 | 第50-52页 |
3.3.3 二级结构 | 第52-55页 |
3.3.4 结构的灵活性分析 | 第55-58页 |
3.3.5 氢键分析 | 第58-59页 |
3.3.6 1URX和 3WZ1中的盐桥分析 | 第59-62页 |
3.4 本章小结 | 第62-63页 |
第4章 总结与展望 | 第63-65页 |
4.1 本章小结 | 第63-64页 |
4.2 展望 | 第64-65页 |
参考文献 | 第65-75页 |
致谢 | 第75-77页 |
个人简历、在校期间发表的论文与成果 | 第77页 |