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基于结构认知和分子模拟探究β-琼胶酶的热稳定性机制

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 引言第9-23页
    1.1 琼胶酶第9-11页
        1.1.1 琼胶酶简介第9页
        1.1.2 琼胶酶的应用第9-10页
        1.1.3 琼胶酶的研究现状第10-11页
    1.2 酶及其耐热性第11-14页
        1.2.1 酶的热稳定性第11页
        1.2.2 热稳定性分类第11-12页
        1.2.3 热稳定性的影响因素第12-14页
    1.3 结构认知的模式识别算法第14-15页
        1.3.1 均匀设计第14页
        1.3.2 数据集的划分方案第14页
        1.3.3 支持向量机回归第14-15页
    1.4 分子动力学模拟第15-19页
        1.4.1 常用分子动力学模拟及结果分析软件第16页
        1.4.2 NAMD 的分子模拟第16-19页
        1.4.3 NAMD的模拟过程第19页
    1.5 本课题的立题依据、研究意义及论文创新点第19-23页
        1.5.1 立题依据第19-20页
        1.5.2 研究意义第20页
        1.5.3 论文创新点第20-23页
第2章 β -琼胶酶最适温度的预测及实验验证第23-47页
    2.1 引言第23-24页
    2.2 实验材料第24-29页
        2.2.1 数据集第24-26页
        2.2.2 β-琼胶酶结构参数的计算与提取第26-27页
        2.2.3 数学建模的方法第27-28页
        2.2.4 重组β-琼胶酶最适温度的测定第28-29页
    2.3 结果与讨论第29-45页
        2.3.1 重组β-琼胶酶的酶学性质测定第29-31页
        2.3.2 基于分段氨基酸组成预测β-琼胶酶的最适温度第31-38页
        2.3.3 基于相对溶液可及性预测β-琼胶酶的最适温度第38-45页
    2.4 本章小结第45-47页
第3章 基于分子动力学模拟探究β -琼胶酶的热稳定性第47-63页
    3.1 引言第47页
    3.2 材料与方法第47-49页
        3.2.1 初始结构第47-48页
        3.2.2 分子动力学模拟第48-49页
    3.3 结果与分析第49-62页
        3.3.1 序列和结构的比对第49-50页
        3.3.2 β-琼胶酶在不同模拟温度下的热稳定性第50-52页
        3.3.3 二级结构第52-55页
        3.3.4 结构的灵活性分析第55-58页
        3.3.5 氢键分析第58-59页
        3.3.6 1URX和 3WZ1中的盐桥分析第59-62页
    3.4 本章小结第62-63页
第4章 总结与展望第63-65页
    4.1 本章小结第63-64页
    4.2 展望第64-65页
参考文献第65-75页
致谢第75-77页
个人简历、在校期间发表的论文与成果第77页

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