| 中文摘要 | 第6-9页 |
| 英文摘要 | 第9-11页 |
| 第一章 背景知识 | 第13-27页 |
| 1.1 转录组学的生物背景 | 第13-17页 |
| 1.2 RNA-seq测序技术 | 第17-22页 |
| 1.3 二代测序数据的拼接 | 第22-23页 |
| 1.4 基于RNA-seq的转录组拼接 | 第23-27页 |
| 第二章 拼接算法的研究现状 | 第27-40页 |
| 2.1 基于参考基因组的转录组拼接算法 | 第27-29页 |
| 2.2 从头转录组拼接算法 | 第29-31页 |
| 2.3 改进转录组拼接算法的必要性 | 第31-36页 |
| 2.4 分析与总结 | 第36-40页 |
| 第三章 TransComb:基于参考基因组的转录组拼接新算法 | 第40-57页 |
| 3.1 TransComb模型简介 | 第40-42页 |
| 3.2 TransComb算法 | 第42-48页 |
| 3.3 算法细节的补充 | 第48-52页 |
| 3.4 TransComb模型的创新点 | 第52-57页 |
| 第四章 TransComb效果测评 | 第57-74页 |
| 4.1 测试软件、数据和评价标准 | 第57-60页 |
| 4.2 TransComb与其他拼接算法的效果比较 | 第60-67页 |
| 4.3 TransComb与各算法在其他方面的比较补充 | 第67-71页 |
| 4.4 TransComb的优缺点 | 第71-74页 |
| 第五章 BinPacker简介:新的转录组从头拼接算法 | 第74-86页 |
| 5.1 BinPacker算法概述 | 第74-77页 |
| 5.2 BinPacker的创新点 | 第77-78页 |
| 5.3 BinPacker效果测评 | 第78-84页 |
| 5.4 BinPacker的优缺点 | 第84-86页 |
| 第六章 全文总结及展望 | 第86-90页 |
| 6.1 全文总结 | 第86页 |
| 6.2 目前的研究课题及今后的研究方充 | 第86-90页 |
| 参考文献 | 第90-96页 |
| 致谢 | 第96-99页 |
| 攻读博士学位期间完成论文情况 | 第99-100页 |
| 作者简介 | 第100-101页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第101页 |
