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宫内发育迟缓(IUGR)猪脐带动静脉血Exosome中microRNA转录组的鉴定和表达谱分析

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-10页
符号说明第14-15页
1 文献综述第15-25页
    1.1 宫内发育迟缓(IUGR)猪现状第15-17页
    1.2 脐带和脐带血的利用第17-19页
        1.2.1 脐带的形成第17页
        1.2.2 脐带血的功能以及动静脉血差异第17-18页
        1.2.3 脐带血的利用与研究进展第18-19页
    1.3 EXOSOME的研究进展第19-22页
        1.3.1 Exosome的发现第19-21页
        1.3.2 Exosome的分离与研究第21页
        1.3.3 Exosome的功能第21-22页
    1.4 细胞外MIRNA第22-23页
        1.4.1 miRNA概况第22页
        1.4.2 细胞外miRNA的发现第22页
        1.4.3 血液细胞外miRNA的生物学功能第22-23页
    1.5 本研究的目的与主要内容第23-25页
        1.5.1 研究目的第23-24页
        1.5.2 主要研究内容第24-25页
2 材料与方法第25-33页
    2.1 实验猪只和脐带血收集第25-26页
        2.1.1 实验样本的选择第25页
        2.1.2 脐带血的收集第25-26页
    2.2 脐带血EXOSOME的AFM检测第26-27页
        2.2.1 脐带血exosome的制备第26-27页
        2.2.2 脐带血exosome的AFM检测第27页
    2.3 脐带血EXOSOME中RNA的抽提和分析第27-28页
        2.3.1 脐带血exosome中RNA的抽提第27页
        2.3.2 脐带血exosome中RNA的质量分析第27-28页
    2.4 SMALL RNA测序及其功能与表达谱分析第28-33页
        2.4.1 脐带血样品的分组和small RNA文库的构建第28-29页
        2.4.2 Small RNA测序第29页
        2.4.3 测序数据处理第29-31页
        2.4.4 靶基因的预测和功能分析第31页
        2.4.5 miRNA表达水平的q-PCR定量检测第31-33页
3 结果与分析第33-65页
    3.1 脐带血EXOSOME的形态和尺寸检测第33-34页
    3.2 MIRNA-SEQ测序质量评估第34-35页
    3.3 猪脐带血EXOSOME中MIRNAs的鉴定和分析第35-38页
        3.3.1 猪脐带血exosome中small RNA测序高通量数据结果第35-37页
        3.3.2 猪脐带血exosome中miRNA的鉴定和预测第37-38页
    3.4 猪脐带血EXOSOME中高表达MIRNAS的主要功能第38-43页
        3.4.1 猪脐带血exosome中高表达miRNAs的鉴定和分析第38-41页
        3.4.2 脐带动静脉血中高表达miRNAs的靶基因预测及其功能第41-43页
    3.5 脐静脉血和脐动脉血的功能差异分析第43-46页
        3.5.1 脐静脉血和脐动脉血exosome中miRNAs的表达差异第43-44页
        3.5.2 脐带动静脉血中差异表达miRNAs的功能富集分析第44-46页
    3.6 IUGR猪与正常猪脐静脉血与动脉血EXOSOME中MIRNAs的差异表达第46-47页
    3.7 脐带血EXOSOME中MIRNAs对IUGR猪形成的表观遗传调控第47-57页
        3.7.1 脐带血exosome中miRNAs对IUGR猪形成的作用第47-48页
        3.7.2 IUGR猪和正常猪脐动静脉血exosome中差异表达miRNAs功能富集分析第48-51页
        3.7.3 IUGR猪脐静脉血中与氧气运输和调控相关miRNAs异常表达第51-52页
        3.7.4 IUGR猪胚胎发育过程中血管生成受阻第52-54页
        3.7.5 IUGR猪胚胎免疫系统发育不全第54-55页
        3.7.6 IUGR猪胚胎能量代谢异常第55-57页
    3.8 MIRNA簇第57-62页
    3.9 MIRNA种子序列分析第62-64页
    3.10 测序结果的可靠性验证第64-65页
4 分析与讨论第65-77页
    4.1 猪具有作为人类动物模型的优势第65页
    4.2 减少IUGR猪的形成有利于养殖经济效益的提高第65-66页
    4.3 关于猪脐带血EXOSOME第66页
    4.4 关于MIRNA和猪脐带血EXOSOME MIRNAS第66-67页
    4.5 脐带血EXOSOME中高表达MIRNAs对胚胎发育具有重要作用第67-68页
    4.6 脐动脉血和脐静脉血功能差异第68-69页
    4.7 脐带血EXOSOME中MIRNAs对IUGR猪的形成具有调控作用第69-70页
    4.8 脐带血EXOSOME中MIRNAs对IUGR猪形成的表观遗传调控第70-75页
        4.8.1 正常猪和IUGR猪脐带动静脉血exosome中差异miRNA的功能分析第70-71页
        4.8.2 与氧气运输和调控相关的miRNAs第71-73页
        4.8.3 与血管生成相关的miRNAs第73-74页
        4.8.4 与免疫系统发育相关的差异表达miRNAs第74-75页
        4.8.5 与能量代谢相关的差异表达miRNAs第75页
    4.9 将脐带血EXOSOME中特异MIRNAs作为早期核酸诊断和治疗第75-77页
5 结论第77-79页
参考文献第79-97页
致谢第97-98页
攻读学位期间发表的学术论文第98页

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