| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 高频词对照表 | 第9-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-26页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-14页 |
| 1.2 细胞内脂滴研究进展 | 第14-19页 |
| 1.2.1 脂滴的起源 | 第14-15页 |
| 1.2.2 脂滴的形成过程 | 第15-17页 |
| 1.2.3 脂滴的动态过程 | 第17页 |
| 1.2.4 脂滴的生物学功能 | 第17-18页 |
| 1.2.5 脂滴对卵母细胞的影响 | 第18-19页 |
| 1.3 WGCNA研究进展 | 第19-25页 |
| 1.3.1 共表达网络分析基本思想 | 第19页 |
| 1.3.2 WGCNA算法基础 | 第19-20页 |
| 1.3.3 WGCNA构建网络步骤 | 第20-25页 |
| 1.3.3.1 定义相似矩阵 | 第20-21页 |
| 1.3.3.2 定义邻接矩阵 | 第21-22页 |
| 1.3.3.3 确定基因之间相异度 | 第22页 |
| 1.3.3.4 识别基因模块 | 第22-23页 |
| 1.3.3.5 模块与表型性状相关联 | 第23页 |
| 1.3.3.6 寻找枢纽基因 | 第23-24页 |
| 1.3.3.6 WGCNA应用实例介绍 | 第24页 |
| 1.3.3.7 WGCNA相关术语解释 | 第24-25页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第25-26页 |
| 2 实验材料与方法 | 第26-31页 |
| 2.1 实验材料 | 第26-28页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第26页 |
| 2.1.2 实验仪器与主要试剂 | 第26-27页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第27-28页 |
| 2.1.4 常用实验试剂配制 | 第28页 |
| 2.2 实验方法 | 第28-31页 |
| 2.2.1 样本采集 | 第28页 |
| 2.2.2 卵母细胞形态学观察 | 第28-29页 |
| 2.2.3 猪皮下白色脂肪及小鼠棕色脂肪形态学观察 | 第29-30页 |
| 2.2.4 总RNA提取 | 第30页 |
| 2.2.5 总RNA质检 | 第30页 |
| 2.2.6 芯片杂交与处理 | 第30-31页 |
| 2.2.7 差异基因及聚类分析 | 第31页 |
| 2.2.8 模块内基因功能聚类分析 | 第31页 |
| 3 实验结果 | 第31-42页 |
| 3.1 猪卵母细胞脂滴表型分析 | 第31-32页 |
| 3.2 表达谱芯片数据预处理与重注释 | 第32-33页 |
| 3.3 不同组织的表达谱芯片数据层次聚类分析 | 第33页 |
| 3.4 猪卵母细胞与脂肪细胞共同特异表达基因 | 第33-35页 |
| 3.5 基因共表达网络分析 | 第35-42页 |
| 3.5.1 去除离群样本 | 第35页 |
| 3.5.2 确定软阈值 | 第35-37页 |
| 3.5.3 识别基因共表达模块 | 第37页 |
| 3.5.4 模块与性状之间的关系 | 第37-39页 |
| 3.5.5 相关模块功能聚类分析 | 第39-40页 |
| 3.5.6 脂滴沉积相关模块枢纽基因 | 第40-42页 |
| 4 讨论 | 第42-47页 |
| 4.1 芯片的重注释与数据预处理 | 第42-43页 |
| 4.2 卵母细胞与脂肪组织共同特异表达基因 | 第43-44页 |
| 4.3 脂滴表型相关模块 | 第44-46页 |
| 4.4 猪卵母细胞与脂肪组织脂滴的异同 | 第46-47页 |
| 5 结论 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-62页 |
| 致谢 | 第62-64页 |
| 附录 | 第64-69页 |