| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 红球菌及类胡萝卜素代谢（综述） | 第11-23页 |
| ·红球菌的基本特性及应用前景 | 第11-12页 |
| ·类胡萝卜素概述及基因工程方法提高类胡萝卜素产量研究现状 | 第12-23页 |
| ·类胡萝卜素基本性质与分子应用 | 第12-14页 |
| ·类胡萝卜素的生物合成途径及相关的基因 | 第14-17页 |
| ·基因工程方法生产提高类胡萝卜素产量 | 第17-19页 |
| ·基因工程方法提高类胡萝卜素产量过程中值得注意问题 | 第19-21页 |
| ·基因工程手段提高类胡萝卜素的产量的总结与展望 | 第21-23页 |
| 第二章 红球菌Rhodococcus sp. B7740全基因组分析 | 第23-45页 |
| ·COG和GO分析 | 第26-30页 |
| ·KEGG功能注释分析 | 第30-31页 |
| ·基因组进化中的特殊原件 | 第31-38页 |
| ·串联重复序列（Tandem Repeat ,TR） | 第31-32页 |
| ·CRISPR序列 | 第32-33页 |
| ·基因岛Genome islands | 第33-34页 |
| ·基因组比较与同源性分析 | 第34-38页 |
| ·红球菌B7740产类胡萝卜素相关基因的分析 | 第38-45页 |
| 第三章 红球菌B7740 Crt E，Crt B，Crt I基因共表达的探究 | 第45-80页 |
| ·红球菌Crt E，Crt B，Crt I基因的克隆 | 第46-55页 |
| ·实验材料 | 第46-48页 |
| ·实验方法 | 第48-53页 |
| ·试验结果 | 第53-55页 |
| ·Crt E，Crt B，Crt I基因共表达的探究 | 第55-76页 |
| ·实验材料 | 第55-56页 |
| ·实验方法 | 第56-68页 |
| ·实验结果 | 第68-76页 |
| ·本章小结与讨论 | 第76-80页 |
| ·实验小结 | 第76-77页 |
| ·讨论 | 第77-80页 |
| 第四章 4株红球菌基本特性及产类胡萝卜素基因的分析 | 第80-114页 |
| ·红球菌Rhodococcus sp. EPR-134，Rhodococcus sp. EPR-147，Rhodococcussp. EPR-157和Rhodococcus sp. EPR-279的基本特性 | 第80-93页 |
| ·实验材料 | 第80-81页 |
| ·实验方法 | 第81-83页 |
| ·实验结果 | 第83-93页 |
| ·红球菌Rhodococcus sp. EPR-134，Rhodococcus sp. EPR-147，Rhodococcussp. EPR-157和Rhodococcus sp. EPR-279基因组基本特性 | 第93-96页 |
| ·红球菌Rhodococcus sp. EPR-134，Rhodococcus sp. EPR-147，Rhodococcussp. EPR-157和Rhodococcus sp. EPR-279产类胡萝卜素基因分析 | 第96-114页 |
| 结论 | 第114-116页 |
| 参考文献 | 第116-122页 |
| 攻读硕士学位期间获得的学术成果 | 第122-123页 |
| 致谢 | 第123页 |
