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CRISPR/Cas9系统介导的七鳃鳗和斑马鱼基因组编辑方法的建立与优化

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
第一章 引言第11-20页
   ·CRISPR/Cas系统简介第11-12页
   ·CRISPR/Cas的分类第12-13页
   ·CRISPR/Cas系统的发展历程第13-14页
   ·CRISPR/Cas在基因编辑领域的应用第14页
   ·七鳃鳗简介第14-15页
   ·七鳃鳗功能基因的研究进展第15-16页
   ·斑马鱼介绍第16页
   ·Hox基因简介第16-18页
   ·大片段敲除方面的研究进展第18页
   ·科学问题假设及本研究所取得的一些成果第18-20页
第二章 实验材料与方法第20-30页
   ·七鳃鳗和斑马鱼的来源与养殖条件第20页
   ·所需实验仪器第20-21页
   ·实验所需试剂第21页
   ·实验方法第21-30页
     ·菌株和质粒第21-22页
     ·设计gRNA及两侧引物第22-23页
     ·合成cas9 mRNA第23-25页
     ·合成gRNA第25-27页
     ·显微注射第27页
     ·检测敲除是否成功及敲除效率第27-29页
     ·单克隆测序分析第29页
     ·成像第29-30页
第三章 CRISPR/Cas9系统介导的七鳃鳗双等位基因敲除方法的建立与优化第30-42页
   ·实验结果第30-38页
     ·CRISPR/Cas9系统成功地在七鳃鳗上实现了对wee1,soxe2,kctd10,wnt7b,golden的定点敲除第30-32页
     ·注射了cas9和gol gRNA的亲本在早期胚胎产生了缺失表型第32-36页
     ·单克隆测序检测对应注射胚胎中gol及kctd10的敲除效率第36-38页
     ·单克隆检测发现wee1,soxe2,wnt7b敲除效率非常高但未观察到明显突变表型第38页
   ·讨论第38-42页
     ·CRISPR/Cas9系统对七鳃鳗基因组实现了高效的编辑效率第38-39页
     ·T7E1酶切效率和单克隆测序突变效率的比较第39页
     ·注射CRISPR/Cas9系统的七鳃鳗胚胎的表型分析第39-40页
     ·gol的敲除效率比kctd10高,而突变后产生的表型率反而低第40-41页
     ·CRISPR/Cas9作用于斑马鱼和七鳃鳗早期胚胎的差异比较第41页
     ·本研究和已有研究对比第41-42页
第四章 CRISPR/Cas9系统介导的斑马鱼Hox基因(簇)突变体的制备第42-51页
   ·实验结果第42-48页
     ·成功敲除HoxC1a、HoxC3a、HoxA2b、HoxB2a及HoxB7a五个基因第42-44页
     ·成功敲除HoxB10a整个基因第44-45页
     ·成功敲除HoxBa和HoxBb基因簇第45-48页
   ·讨论第48-51页
     ·单位点的敲除效率要远高于片段敲除效率第48-50页
     ·片段敲除效率和片段大小之间的关系第50页
     ·T7E1酶切效率和测序封图乱峰程度的比较第50-51页
第五章 总结第51-52页
参考文献第52-56页
附录第56-78页
致谢第78-79页

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