摘要 | 第1-13页 |
Abstract | 第13-17页 |
第一章 文献综述 | 第17-29页 |
1. 环棱螺的研究现状 | 第17-18页 |
2 遗传多样性的研究 | 第18-19页 |
3 遗传多样性的研究方法 | 第19-23页 |
4 微卫星标记技术在淡水腹足类种群遗传学研究的应用 | 第23-26页 |
5 线粒体基因在软体动物种群遗传学研究中的应用 | 第26-28页 |
·物种亲缘关系 | 第26-27页 |
·种群起源、分化与扩散 | 第27-28页 |
6 本研究的目的和意义 | 第28-29页 |
第二章 环棱螺分子系统发育的研究 | 第29-61页 |
1 材料和方法 | 第30-48页 |
·样品采集 | 第30-31页 |
·DNA提取 | 第31-32页 |
·目的基因引物设计 | 第32页 |
·目的片段的扩增及确认 | 第32-33页 |
·序列比对 | 第33页 |
·序列的核苷酸组成分析 | 第33页 |
·系统发育分析 | 第33-48页 |
2 结果与分析 | 第48-56页 |
·四种基因片段序列特征分析 | 第48-49页 |
·遗传分化 | 第49-50页 |
·系统发育分析 | 第50-56页 |
·线粒体COI基因系统发育分析 | 第50-53页 |
·线粒体16S rRNA基因系统发育分析 | 第53-54页 |
·核基因H3系统发育分析 | 第54-55页 |
·核基因28S rRNA系统发育分析 | 第55页 |
·COI、16S rRNA、H3和28S rRNA序列联合的系统发育分析 | 第55-56页 |
3 讨论 | 第56-61页 |
·四种基因序列变异比较研究 | 第56-57页 |
·环棱螺的分子系统发育分析 | 第57-61页 |
第三章 我国环棱螺微卫星文库的构建 | 第61-79页 |
1 实验材料及来源 | 第61-67页 |
·样品采集 | 第61页 |
·主要仪器设备 | 第61-62页 |
·主要试剂 | 第62页 |
·实验方法及步骤 | 第62-67页 |
·基因组DNA的提取与检测 | 第62-63页 |
·酶切环棱螺基因组DNA | 第63页 |
·连接反应 | 第63页 |
·PCR预扩增 | 第63页 |
·PCR预扩增产物与生物素探针杂交 | 第63-64页 |
·磁珠杂交 | 第64页 |
·目的片段的洗脱和回收 | 第64页 |
·目的DNA片段的扩增 | 第64页 |
·扩增产物与pGEM-T easy载体连接 | 第64页 |
·转化,克隆目的基因 | 第64-65页 |
·含微卫星DNA序列的重组子的筛选 | 第65页 |
·测序结果分析 | 第65-66页 |
·微卫星引物设计 | 第66页 |
·多态性微卫星位点的筛选 | 第66页 |
·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第66页 |
·银染 | 第66页 |
·数据统计及分析 | 第66-67页 |
2 结果与分析 | 第67-76页 |
·基因组DNA的质量检测结果 | 第67页 |
·基因组DNA的酶切 | 第67-68页 |
·PCR预扩增与目的片段的收集 | 第68页 |
·微卫星阳性克隆的检测及筛选 | 第68-70页 |
·微卫星引物的设计及PCR扩增 | 第70-71页 |
·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第71页 |
·微卫星位点的多态性分析 | 第71-76页 |
3 讨论 | 第76-79页 |
第四章 环棱螺微卫星标记的遗传结构分析 | 第79-124页 |
1. 材料和方法 | 第80-83页 |
·样品采集 | 第80页 |
·主要试剂和仪器 | 第80页 |
·基因组DNA的提取 | 第80页 |
·微卫星DNA的扩增 | 第80-81页 |
·微卫星DNA的电泳扫描检测及基因分型 | 第81页 |
·数据分析 | 第81-83页 |
·遗传多样性 | 第81-82页 |
·种群遗传结构分析 | 第82页 |
·地理隔离和基因流 | 第82-83页 |
2 结果与分析 | 第83-119页 |
·铜锈环棱螺种群遗结构分析 | 第83-92页 |
·遗传变异和遗传多样性 | 第83-85页 |
·种群间遗传分化 | 第85-86页 |
·地理隔离和基因流 | 第86-89页 |
·种群遗传结构 | 第89-92页 |
·梨形环棱螺种群遗结构分析 | 第92-100页 |
·遗传变异和遗传多样性 | 第92-95页 |
·种群间遗传分化 | 第95页 |
·地理隔离和基因流 | 第95-97页 |
·种群遗传结构 | 第97-100页 |
·方形环棱螺种群遗结构分析 | 第100-108页 |
·遗传变异和遗传多样性 | 第100-102页 |
·种群间遗传分化 | 第102-103页 |
·地理隔离和基因流 | 第103-105页 |
·种群遗传结构 | 第105-108页 |
·双旋环棱螺种群遗传结构分析 | 第108-112页 |
·遗传变异和遗传多样性 | 第108-111页 |
·种群间遗传分化和基因流 | 第111-112页 |
·角形环棱螺种群遗结构分析 | 第112-116页 |
·遗传变异和遗传多样性 | 第112-115页 |
·种群间遗传分化和基因流 | 第115-116页 |
·五种环棱螺共34个种群的遗传结构分析 | 第116-119页 |
·环棱螺的种间遗传变异分析 | 第116-117页 |
·34个种群的主成分判别分析和聚类分析 | 第117-119页 |
3 讨论 | 第119-124页 |
·遗传多样性分析 | 第119-121页 |
·种群遗传结构分析 | 第121-124页 |
第五章 环棱螺COI基因的遗传结构分析 | 第124-144页 |
1. 材料和方法 | 第124-126页 |
·样本采集 | 第124页 |
·基因组DNA提取 | 第124页 |
·线粒体基因COI的扩增 | 第124-125页 |
·线粒体COI基因的测序 | 第125页 |
·数据分析 | 第125-126页 |
·遗传结构和遗传多样性 | 第125页 |
·谱系生物地理学(phylogeography)分析 | 第125页 |
·群体演化历史分析(Demographic history) | 第125-126页 |
2 结果与分析 | 第126-140页 |
·铜锈环棱螺种群遗传结构分析 | 第126-131页 |
·遗传变异和多样性 | 第126-127页 |
·群体历史动态分析 | 第127-128页 |
·COI基因单倍型的网状图 | 第128-129页 |
·种群遗传结构 | 第129-131页 |
·梨形环棱螺种群遗传结构分析 | 第131-135页 |
·遗传变异和多样性 | 第131-132页 |
·群体历史动态分析 | 第132-133页 |
·COI基因单倍型的网状图 | 第133-134页 |
·种群遗传结构 | 第134-135页 |
·方形环棱螺种群遗传结构分析 | 第135-139页 |
·遗传变异和多样性 | 第135-137页 |
·群体历史动态分析 | 第137-138页 |
·COI基因单倍型的网状图 | 第138页 |
·种群遗传结构 | 第138-139页 |
·三种环棱螺遗传分化分析 | 第139-140页 |
3 讨论 | 第140-144页 |
·三种环棱螺的遗传多样性分析 | 第140-141页 |
·群体的历史动态分析 | 第141-142页 |
·三种环棱螺的遗传分化与遗传结构 | 第142-144页 |
第六章 中国环棱螺形态和齿舌超显微结构的比较 | 第144-175页 |
第一节 环棱螺螺壳形态度量的比较研究 | 第145-169页 |
1 材料方法 | 第145-147页 |
·材料 | 第145-147页 |
·统计分析 | 第147页 |
2 结果与分析 | 第147-167页 |
·铜锈环棱螺10个种群的形态度量学分析 | 第147-152页 |
·主成分分析 | 第147-150页 |
·聚类分析 | 第150页 |
·判别分析 | 第150-152页 |
·梨形环棱螺7个种群的形态度量学分析 | 第152-155页 |
·主成分分析 | 第152-153页 |
·聚类分析 | 第153-154页 |
·判别分析 | 第154-155页 |
·方形环棱螺7个种群的形态度量学分析 | 第155-158页 |
·主成分分析 | 第155-157页 |
·聚类分析 | 第157页 |
·判别分析 | 第157-158页 |
·角形环棱4个种群的形态度量学分析 | 第158-161页 |
·主成分分析 | 第158-159页 |
·聚类分析 | 第159-160页 |
·判别分析 | 第160-161页 |
·双旋环棱螺4个种群的形态度量学分析 | 第161-164页 |
·主成分分析 | 第161-163页 |
·聚类分析 | 第163页 |
·判别分析 | 第163-164页 |
·五种环棱螺32个种群的形态比较研究 | 第164-167页 |
·聚类分析 | 第164-165页 |
·主成分分析 | 第165-167页 |
3 讨论 | 第167-169页 |
第二节 环棱螺齿舌超显微结构异同 | 第169-175页 |
1 材料与方法 | 第169-170页 |
·样本采集 | 第169-170页 |
·齿舌的提取 | 第170页 |
2 结果与分析 | 第170-173页 |
·六种环棱螺齿舌的形态描述 | 第170-173页 |
·五种环棱螺齿舌的比较 | 第173页 |
3 讨论 | 第173-175页 |
第七章 中国环棱螺分类阶元的探讨 | 第175-182页 |
1 环棱螺的世界分布 | 第175页 |
2 环棱螺在中国分布 | 第175页 |
3 中国环棱螺分类阶元的探讨 | 第175-182页 |
·从形态度量学探讨5种环棱螺的分类 | 第177-178页 |
·从分子系统发育探讨中国环棱螺的分类 | 第178-179页 |
·种群遗传结构的研究探讨中国环棱螺的分类 | 第179-182页 |
参考文献 | 第182-196页 |
附录 | 第196-197页 |
致谢 | 第197-198页 |