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赖氨酸乙酰化调节大肠杆菌NhoA蛋白活性的研究

摘要第1-10页
Abstract第10-12页
縮略语表第12-13页
第一章 引言第13-41页
 1 蛋白质的乙酰化研究进展第13-29页
   ·N末端乙酰化修饰(N~α-乙酰化)第14-15页
   ·赖氨酸乙酰化修饰(N~ε-乙酰化)第15-27页
     ·真核生物中组蛋白的赖氨酸乙酰化第15-18页
     ·真核生物中非组蛋白的赖氨酸乙酰化第18-19页
     ·原核生物中的赖氨酸乙酰化第19-20页
     ·赖氨酸乙酰转移酶/组蛋白乙酰转移酶第20-22页
     ·赖氨酸去乙酰化酶/组蛋白去乙酰化酶第22-24页
     ·Sir2类蛋白质去乙酰化酶第24-27页
   ·蛋白质乙酰化修饰的检测第27-29页
 2 NATs蛋白家族研究进展第29-37页
   ·NATs蛋白家族的分布第30-32页
   ·NATs蛋白的结构第32-34页
   ·NATs蛋白的作用机制第34-36页
   ·NATs蛋白的抑制剂第36-37页
 3 蛋白质芯片研究进展第37-40页
   ·蛋白质芯片的特点第37-38页
   ·蛋白质芯片的种类第38页
   ·蛋白质芯片的检测和应用第38-39页
   ·结束语第39-40页
 4 本研究的主要目的和意义第40-41页
第二章 大肠杆菌CobB蛋白底物的筛选以及催化NhoA去乙酰化的研究第41-66页
 1 材料与方法第42-50页
   ·试验材料第42-45页
     ·菌株第42页
     ·培养基第42-43页
     ·试剂与材料第43页
     ·蛋白纯化缓冲液第43-44页
     ·SDS-PAGE凝胶溶液第44页
     ·Western Blot用缓冲液第44-45页
     ·实验仪器第45页
   ·实验方法第45-50页
     ·蛋白质芯片的构建和CobB底物的筛选第45-46页
     ·蛋白质的诱导表达第46-47页
     ·蛋白质的纯化第47页
     ·SDS-PAGE分析蛋白纯度及蛋白浓缩第47-48页
     ·蛋白质浓度的测定及保存第48页
     ·去乙酰化试验第48页
     ·蛋白质的免疫印迹(Western blot)检测第48-49页
     ·蛋白质的质谱鉴定第49-50页
     ·自乙酰化试验第50页
 2 结果与分析第50-64页
   ·基于大肠杆菌蛋白质芯片的CobB底物的筛选第50-53页
   ·大肠杆菌CobB蛋白与NhoA蛋白的表达与纯化第53-54页
   ·大肠杆菌CobB催化NhoA的去乙酰化第54-55页
   ·NhoA乙酰化与去乙酰化的质谱鉴定第55-62页
   ·NhoA蛋白的自乙酰化分析第62-64页
 3 讨论第64-66页
第三章 乙酰化赖氨酸残基的突变对大肠杆菌NhoA酶活性的影响第66-94页
 1 材料与方法第67-80页
   ·试验材料第67-70页
     ·菌株与质粒第67-68页
     ·培养基第68-69页
     ·试剂与材料第69页
     ·蛋白纯化缓冲液第69页
     ·SDS-PAGE凝胶溶液第69-70页
     ·Western Blot用缓冲液第70页
     ·ELISA用试剂第70页
     ·试验仪器第70页
   ·实验方法第70-80页
     ·大肠杆菌质粒的提取第70页
     ·大肠杆菌nhoA基因的定点突变及克隆第70-73页
     ·大肠杆菌CaCl_2法感受态细胞的的制备及转化第73页
     ·重组质粒的筛选、验证第73页
     ·菌种的保存第73-74页
     ·蛋白质的诱导表达及纯化第74页
     ·SDS-PAGE分析蛋白纯度及蛋白浓缩第74页
     ·蛋白质浓度的测定及保藏第74页
     ·NhoA抗体的制备第74-75页
     ·突变体蛋白的可溶性分析第75页
     ·蛋白的免疫印迹(Western blot)检测第75页
     ·NhoA的NAT活性测定第75页
     ·大肠杆菌单基因敲除菌株的构建第75-80页
     ·大肠杆菌基因组的提取第80页
     ·诱变性试验第80页
 2 结果与分析第80-90页
   ·大肠杆菌nhoA野生型及突变体基因表达载体的构建第80-81页
   ·重组质粒的筛选、验证第81-82页
   ·大肠杆菌NhoA野生型及突变体蛋白可溶性分析第82-84页
   ·大肠杆菌NhoA野生型及突变体蛋白乙酰化水平分析第84-85页
   ·大肠杆菌NhoA野生型及突变体蛋白NAT活性的对比第85-86页
   ·大肠杆菌NhoA野生型及突变体蛋白OAT活性的对比第86-90页
     ·大肠杆菌nhoA基因敲除菌株的构建第86-88页
     ·OAT活性的测定第88-90页
 3 讨论第90-94页
第四章 大肠杆菌CobB蛋白调节NhoA酶活性的研究第94-105页
 1 材料与方法第94-98页
   ·试验材料第94-96页
     ·菌株和质粒第94-95页
     ·培养基第95页
     ·试剂与材料第95-96页
     ·蛋白纯化缓冲液第96页
     ·SDS-PAGE凝胶溶液第96页
     ·Western Blot用缓冲液第96页
     ·试验仪器第96页
   ·实验方法第96-98页
     ·蛋白质的诱导表达及纯化第96页
     ·SDS-PAGE分析蛋白纯度及蛋白浓缩第96页
     ·蛋白质浓度的测定及保藏第96页
     ·蛋白的免疫印迹(Western blot)检测第96页
     ·去乙酰化NhoA的NAT活性测定第96-97页
     ·大肠杆菌单基因和双基因敲除菌株的构建第97页
     ·大肠杆菌基因组的提取第97页
     ·大肠杆菌体内NhoA乙酰化水平分析第97-98页
     ·诱变性试验第98页
 2 结果与分析第98-103页
   ·去乙酰化对NhoA的NAT活性的影响第98-100页
   ·大肠杆菌cobB敲除菌株及cobB与nhoA双敲除菌株的构建第100-101页
   ·大肠杆菌体内NhoA乙酰化水平分析第101-102页
   ·cobB基因敲除对NhoA的OAT活性的影响第102-103页
 3 讨论第103-105页
第五章 结论第105-106页
参考文献第106-119页
发表及待发表文章目录第119-120页
致谢第120-121页

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