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半胱氨酸甲基化阻断NF-κB信号通路中对泛素链的识别

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
引言第9-11页
1 研究背景第11-36页
   ·NF-κB信号通路概述第11-19页
   ·NF-κB转录因子第19-21页
   ·IκB第21-22页
   ·IKK复合物第22-24页
   ·TAK1复合物第24-25页
   ·泛素链在NF-κB信号通路中的作用第25-27页
   ·NF-κB的负反馈调节第27-28页
   ·肠致病性大肠杆菌感染的病理特征第28页
   ·EPEC造成的A/E lesions与LEE效应蛋白的关系第28-31页
   ·肠致病大肠杆菌的non-LEE效应蛋白第31-33页
   ·肠致病性大肠杆菌感染时对宿主免疫反应的抑制第33-36页
2 实验材料和方法第36-67页
   ·实验材料第36-44页
     ·基因和质粒第36页
     ·抗体第36-37页
     ·细胞培养第37页
     ·菌株第37页
     ·siRNA,shRNA及引物第37-38页
     ·试剂第38页
     ·实验相关溶液配制第38-44页
   ·实验方法第44-67页
     ·常规载体构建第44-45页
     ·构建基因突变体第45-46页
     ·shRNA载体构建第46-48页
     ·线性泛素链(Tetra-Ub)原核表达载体构建第48页
     ·质粒大提第48-49页
     ·细胞转染第49-50页
     ·RNA提取及逆转录第50-52页
     ·利用SDS-PAGE和western blot检测细胞中的蛋白的表达第52-53页
     ·双荧光素酶实验第53-54页
     ·免疫沉淀第54-55页
     ·在细胞提取物中重组TRAF6引起的NF-κB激活第55-56页
     ·在大肠杆菌中重组表达并纯化蛋白第56-58页
     ·Native ESI样品的准备第58-59页
     ·酵母双杂交第59-60页
     ·体外重组泛素链的生成及ubiquitin chain pulldown第60-61页
     ·GST pulldown第61-62页
     ·体外甲基化实验第62-63页
     ·体内甲基化检测第63-64页
     ·EPEC感染第64-65页
     ·p65免疫荧光第65页
     ·活细胞成像第65-67页
3 实验结果第67-104页
   ·NleE可以特异地抑制NF-κB信号通路的激活第67-68页
   ·NleE抑制TAK1激活第68-72页
   ·NleE作用于TAB2/3并抑制其同泛素链的结合第72-76页
   ·NIeE甲基化修饰TAB2/3-NZF上的半胱氨酸第76-81页
   ·TAB2/3的半胱氨酸甲基化导致TAB2/3不能同泛素链结合的机制第81-84页
   ·NleE对TAB2/3-NZF的修饰依赖于完整的NZF结构第84-87页
   ·NleE对TAB2/3的半胱氨酸甲基化修饰是NleE抑制宿主细胞NF-κB信号通路的主要机制第87-90页
   ·EPEC效应蛋白NleE在感染时抑制宿主NF-κB信号通路的激活第90-92页
   ·不同NZF对NleE的敏感性不同第92-95页
   ·NleE作用于ZRANB3第95-99页
   ·NleE的晶体结构显示NleE属于一类非常新颖的甲基转移酶第99-102页
   ·对NleE-SAM-TAB2-NZF复合物的分子模拟显示TAB2的第673位半胱氨酸最适合作为甲基的受体第102-104页
4 讨论第104-107页
参考文献第107-115页
致谢第115页

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