| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-12页 |
| 第一部分 肺炎链球菌Ap_n水解酶SapH的结构酶学研究 | 第12-62页 |
| 第一章 SapH研究背景 | 第12-22页 |
| ·引言 | 第12-14页 |
| ·肺炎链球菌概述 | 第12-13页 |
| ·Ap_nA(diadenosine polyphosphate)在生物体中的功能和代谢 | 第13-14页 |
| ·Ap_nA水解酶 | 第14-16页 |
| ·Ap_nA水解酶概述 | 第14-15页 |
| ·Nudix超家族水解酶的结构特点和催化机理 | 第15-16页 |
| ·磷酸酯酶 | 第16-22页 |
| ·磷酸酯酶概述 | 第16-19页 |
| ·双金属磷酸二酯酶(MPP)结构特点和催化机理 | 第19-22页 |
| 第二章 实验材料、设备与方法 | 第22-30页 |
| ·实验材料与仪器设备 | 第22-23页 |
| ·质粒、菌株 | 第22页 |
| ·酶类及其它试剂 | 第22页 |
| ·仪器设备 | 第22-23页 |
| ·实验方法 | 第23-30页 |
| ·重组质粒的构建 | 第23页 |
| ·蛋白的超量表达与纯化 | 第23-24页 |
| ·蛋白质结晶、晶体优化及衍射数据收集 | 第24-26页 |
| ·晶体结构解析、模型构建及结构修正 | 第26-28页 |
| ·双金属鉴定 | 第28页 |
| ·酶活测定 | 第28-30页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第30-52页 |
| ·SapH的结晶、数据收集、结构解析及修正 | 第30-35页 |
| ·SapH的晶体生长和优化 | 第30-31页 |
| ·SapH的数据收集和结构解析 | 第31-32页 |
| ·SapH的结构质量评估 | 第32-35页 |
| ·SapH的整体结构及活性位点 | 第35-39页 |
| ·SapH的整体结构 | 第35-37页 |
| ·SapH的双金属活性位点 | 第37-39页 |
| ·结构比较 | 第39页 |
| ·活性鉴定 | 第39-44页 |
| ·磷酸二酯酶活性 | 第39-42页 |
| ·核苷酸/衍生物水解酶活性 | 第42-44页 |
| ·底物结合口袋 | 第44-47页 |
| ·PO_4和AMP结合口袋 | 第44-45页 |
| ·Ap_3A的docking模型 | 第45-47页 |
| ·SapH结构和功能总结 | 第47-52页 |
| ·SapH是MPP超家族中的一个新成员 | 第47-48页 |
| ·SapH是仅在链球菌中特有的一个双功能酶 | 第48-52页 |
| 小结 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 第二部分 酿酒酵母Ap_4A磷酸化酶Apa2的结构酶学研究 | 第62-94页 |
| 第四章 Ap_4A磷酸化酶研究背景 | 第62-68页 |
| ·引言 | 第62-63页 |
| ·HIT(histidine triad)超家族蛋白概述 | 第63-68页 |
| ·HIT超家族蛋白分类 | 第63-64页 |
| ·HIT超家族蛋白结构特点 | 第64-65页 |
| ·HIT超家族蛋白催化机理 | 第65-68页 |
| 第五章 材料与方法 | 第68-74页 |
| ·重组质粒的构建 | 第68页 |
| ·蛋白的表达与纯化 | 第68-69页 |
| ·蛋白质结晶,晶体优化与数据收集 | 第69-70页 |
| ·结构解析,模型构建及结构修正 | 第70-72页 |
| ·活性测定 | 第72-74页 |
| 第六章 结果与讨论 | 第74-88页 |
| ·Apa2的结晶、数据收集、结构解析及修正 | 第74-75页 |
| ·Apa2的整体结构及结构比较 | 第75-77页 |
| ·Apa2的整体结构 | 第75-76页 |
| ·Apa2与同源结构比较 | 第76-77页 |
| ·Apa2的活性位点分析 | 第77-84页 |
| ·Apa2活性测定 | 第77-79页 |
| ·Ap_4A结合位点 | 第79-81页 |
| ·Apa2催化机制分析 | 第81-83页 |
| ·Apa2的底物特异性 | 第83-84页 |
| ·Apa2结构与功能分析总结 | 第84-88页 |
| 小结 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-94页 |
| 第三部分 合作项目 | 第94-104页 |
| 第七章 其他工作 | 第94-102页 |
| ·肺炎链球菌Endo-β-D-己糖苷酶Spr0440的晶体生长和结构解析 | 第94-96页 |
| ·肺炎链球菌糖基水解酶StrH的结构解析,功能分析和文章撰写工作 | 第96-97页 |
| ·肺炎链球菌糖基转移酶GtfA的结构解析和功能分析 | 第97-98页 |
| ·调控鱼腥蓝细菌异型胞分化的转录因子及相关蛋白的结构解析 | 第98-102页 |
| 参考文献 | 第102-104页 |
| 附录 | 第104-110页 |
| 致谢 | 第110-112页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文与参加的学术会议 | 第112-113页 |
