| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-25页 |
| 1 概述 | 第11页 |
| 2 病原学 | 第11-13页 |
| ·分类地位 | 第11-12页 |
| ·RA的形态和染色特性 | 第12页 |
| ·培养基和理化特性 | 第12页 |
| ·血清型 | 第12-13页 |
| 3 流行病学 | 第13-14页 |
| ·易感动物 | 第13-14页 |
| ·传染源和传播途径 | 第14页 |
| ·发病季节和诱病因素 | 第14页 |
| ·发病日龄 | 第14页 |
| 4 临床症状与病理变化 | 第14-15页 |
| ·临床症状 | 第14页 |
| ·病理变化 | 第14-15页 |
| 5 诊断方法 | 第15-17页 |
| ·细菌的分离鉴定 | 第15页 |
| ·凝集试验 | 第15页 |
| ·酶联接免疫吸附剂测定 | 第15-16页 |
| ·荧光抗体技术 | 第16页 |
| ·PCR | 第16-17页 |
| 6 免疫原性研究 | 第17-18页 |
| 7 致病因子研究 | 第18-19页 |
| 8 细菌体内基因差异表达技术 | 第19-25页 |
| ·体内表达技术(IVET) | 第19-20页 |
| ·代表性差别分析技术(RDA) | 第20页 |
| ·信号标签技术(STM) | 第20页 |
| ·选择性捕获转录序列(SCOTS) | 第20-25页 |
| ·SCOTS技术的原理 | 第21-22页 |
| ·SCOTS技术路线 | 第22页 |
| ·SCOTS技术的优缺点 | 第22-25页 |
| 第二章 鸭疫里氏杆菌基因组的提取、生物素标记以及16S rDNA和23S rDNA的克隆 | 第25-38页 |
| 1 研究的目的及意义 | 第25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-32页 |
| ·实验材料 | 第25-27页 |
| ·菌株和工具酶 | 第25页 |
| ·试剂 | 第25页 |
| ·主要试剂及溶液的配制 | 第25-26页 |
| ·本试验所采用的PCR引物 | 第26-27页 |
| ·主要仪器 | 第27页 |
| ·试验方法 | 第27-32页 |
| ·RA-YM基因组的提取及标记 | 第27-28页 |
| ·16S rDNA的PCR扩增 | 第28-29页 |
| ·23S rDNA的PCR扩增 | 第29页 |
| ·PCR产物回收与测序 | 第29-30页 |
| ·PCR产物的克隆 | 第30页 |
| ·感受态细胞制备(氯化钙法) | 第30-31页 |
| ·质粒的转化 | 第31页 |
| ·质粒的小量制备(碱裂解法提取质粒) | 第31页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第31-32页 |
| ·16S rDNA和23S rDNA的PCR扩增结果分析 | 第32页 |
| ·含16S、23S rDNA质粒的RA基因组随机标记片段的制备 | 第32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-37页 |
| ·RA-YM基因组 | 第32页 |
| ·16S rDNA的PCR扩增及酶切鉴定 | 第32-34页 |
| ·16S rDNA的PCR扩增 | 第32-33页 |
| ·16S rDNA的酶切鉴定 | 第33-34页 |
| ·23S rDNA的PCR扩增(分三段扩增)及酶切鉴定 | 第34-36页 |
| ·23S rDNA的PCR扩增 | 第34-35页 |
| ·23S rDNA的酶切鉴定 | 第35-36页 |
| ·RA基因组及rDNA质粒的破碎 | 第36-37页 |
| 4 讨论 | 第37页 |
| ·RA基因组的提取及标记 | 第37页 |
| ·PCR扩增 | 第37页 |
| ·质粒的酶切鉴定 | 第37页 |
| 5 小结 | 第37-38页 |
| 第三章 选择性捕获转录序列 | 第38-58页 |
| 1 研究的目的和意义 | 第38页 |
| 2 材料与方法 | 第38-46页 |
| ·实验材料 | 第38-39页 |
| ·实验仪器 | 第38页 |
| ·主要试剂 | 第38-39页 |
| ·试验菌株和试验动物 | 第39页 |
| ·本实验所使用的引物 | 第39页 |
| ·实验方法 | 第39-46页 |
| ·RA-YM的复苏 | 第39页 |
| ·RA-YM的感染试验及样品采集 | 第39-40页 |
| ·组织总RNA的提取 | 第40页 |
| ·细菌总RNA的提取 | 第40页 |
| ·cDNA合成 | 第40-42页 |
| ·cDNAs的纯化回收 | 第42页 |
| ·预杂交 | 第42页 |
| ·转录序列捕获(SCOTS) | 第42-43页 |
| ·RA感染过程中特异性转录cDNAs的富集 | 第43-44页 |
| ·RA感染过程中特异性转录cDNAs的克隆 | 第44页 |
| ·细菌转化 | 第44-45页 |
| ·cDNA克隆筛选 | 第45页 |
| ·斑点杂交 | 第45-46页 |
| ·阳性克隆cDNA片段测序及序列分析 | 第46页 |
| 3 结果与分析 | 第46-53页 |
| ·肝脏总RNA的提取及cDNA的合成 | 第46-47页 |
| ·RA总RNA的提取及cDNA合成 | 第47-48页 |
| ·选择性捕获转录序列(Selective capture of transcribed sequences) | 第48-50页 |
| ·RA在感染过程中特异性转录序列的富集 | 第50页 |
| ·SCOTS所捕获的差异cDNA克隆 | 第50页 |
| ·斑点杂交结果 | 第50页 |
| ·阳性克隆cDNA片段测序及序列预测分析 | 第50-53页 |
| 4 讨论 | 第53-56页 |
| ·SCOTS | 第53-54页 |
| ·RA体内感染差异表达的基因 | 第54-56页 |
| ·与代谢相关的基因 | 第54-55页 |
| ·适应性反应相关的基因 | 第55-56页 |
| ·蛋白酶类基因 | 第56页 |
| ·下一步工作计划 | 第56页 |
| 5 小结 | 第56-58页 |
| 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 附录 | 第65-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
