| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 目录 | 第10-13页 |
| 略语表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-26页 |
| 1 耐辐射奇球菌概述 | 第14-20页 |
| ·耐辐射奇球菌的基本特征 | 第14页 |
| ·耐辐射奇球菌的全基因组序列 | 第14-15页 |
| ·耐辐射奇球菌的抗辐射机制研究进展 | 第15-20页 |
| ·菌体结构对辐射抗性的作用 | 第15-16页 |
| ·修复蛋白的保护机制 | 第16页 |
| ·DNA 损伤修复机制是辐射抗性的关键 | 第16-19页 |
| ·同源重组 | 第17页 |
| ·特殊的与DNA 修复相关的蛋白 | 第17-18页 |
| ·ESDSA 途径 | 第18-19页 |
| ·其他相关因素 | 第19-20页 |
| ·耐辐射奇球菌研究的应用前景 | 第20页 |
| 2 原核生物非编码RNA(sRNA)研究进展 | 第20-24页 |
| ·原核生物ncRNA 种类 | 第20-23页 |
| ·持家sRNA | 第20-21页 |
| ·调控性sRNA | 第21-23页 |
| ·MicF RNA | 第21-22页 |
| ·RNAⅢ | 第22页 |
| ·OxyS RNA | 第22-23页 |
| ·DicF RNA | 第23页 |
| ·核糖核开关(Riboswitch) | 第23页 |
| ·原核生物ncRNA 的调控机制 | 第23页 |
| ·原核生物ncRNA 研究方法 | 第23-24页 |
| ·原核生物ncRNA 的研究方向 | 第24页 |
| 3 小结 | 第24-26页 |
| 第二章 实验方案设计 | 第26-28页 |
| 1 研究目的和意义 | 第26页 |
| 2 研究的主要内容 | 第26-27页 |
| 3 实验流程图 | 第27-28页 |
| 第三章 材料与方法 | 第28-37页 |
| 1 材料 | 第28-30页 |
| ·数据来源 | 第28页 |
| ·菌种 | 第28页 |
| ·引物 | 第28-29页 |
| ·其他材料 | 第29页 |
| ·主要试剂 | 第29-30页 |
| 2 方法 | 第30-37页 |
| ·ncRNA 筛选 | 第30页 |
| ·耐辐射奇球菌培养 | 第30页 |
| ·总RNA 提取方法优化 | 第30-31页 |
| ·DNase I 处理总RNA | 第31页 |
| ·逆转录反应 | 第31-32页 |
| ·PCR 反应 | 第32-33页 |
| ·TA 克隆 | 第33-34页 |
| ·菌液样本辐照处理 | 第34页 |
| ·辐照菌液总RNA 样品抽提 | 第34页 |
| ·Northern blot 检测DicF | 第34-36页 |
| ·RNA 电泳及转膜 | 第34-35页 |
| ·生物素标记探针制备 | 第35页 |
| ·杂交 | 第35-36页 |
| ·荧光定量PCR 检测ncRNA 表达差异 | 第36-37页 |
| 第四章 结果与分析 | 第37-48页 |
| 1 ncRNA 筛选结果 | 第37页 |
| 2 总提取方法的优化 | 第37-39页 |
| 3 各ncRNA RT-PCR 检测结果 | 第39-41页 |
| 4 四条ncRNA 的TA 克隆测序 | 第41页 |
| 5 DicF Northern blot 结果分析 | 第41页 |
| 6 辐照处理菌液总RNA 样品抽提 | 第41-43页 |
| 7 荧光定量PCR 检测ncRNA 表达差异分析 | 第43-48页 |
| ·扩增产物特异性分析 | 第43-44页 |
| ·内参标准曲线制作 | 第44页 |
| ·三条riboswitch 在不同处理样品之间的表达差异分析 | 第44-46页 |
| ·DicF 在不同处理样品之间的表达差异分析 | 第46-48页 |
| 第五章 讨论 | 第48-52页 |
| 1 总RNA 样品抽提方法选择的考虑因素 | 第48-49页 |
| 2 ncRNA 表达量与耐辐射奇球菌DNA 修复的关系 | 第49页 |
| 3 ncRNA 的功能分析 | 第49-52页 |
| ·Riboswitch 功能分析 | 第49-51页 |
| ·DicF RNA 功能分析 | 第51-52页 |
| 第六章 总结与展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-60页 |
| 附录一 重要试剂的配制 | 第60-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
