| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 引言 | 第9-10页 |
| 1 绪论 | 第10-14页 |
| ·背景 | 第10-12页 |
| ·人类基因组计划 | 第10页 |
| ·生物信息学 | 第10-12页 |
| ·生物进化研究的意义 | 第12页 |
| ·本文的主要工作 | 第12-14页 |
| 2 生物进化的基本知识 | 第14-18页 |
| ·生物进化的基本概念 | 第14页 |
| ·进化论历史发展过程 | 第14-16页 |
| ·早期进化论 | 第14-15页 |
| ·达尔文进化论 | 第15页 |
| ·综合进化论 | 第15-16页 |
| ·中性进化学说 | 第16页 |
| ·分子进化的基本概念 | 第16-18页 |
| 3 分子系统学和分子进化树 | 第18-25页 |
| ·原理和概念 | 第18-19页 |
| ·构建分子进化树的方法 | 第19-23页 |
| ·大分子特征数据的获得 | 第20页 |
| ·排序 | 第20-21页 |
| ·比较特征：相似性和距离数据 | 第21-22页 |
| ·进化树的构建 | 第22-23页 |
| ·进化树评估 | 第23页 |
| ·分子进化与系统发育分析软件 | 第23-25页 |
| 4 信息离散性度量方法 | 第25-32页 |
| ·信息离散性度量方法的提出 | 第25-26页 |
| ·信息离散性度量方法 | 第26-30页 |
| ·完全信息集 | 第26页 |
| ·FDOD函数 | 第26-28页 |
| ·FDOD函数与申农熵和K-L熵的比较 | 第28-30页 |
| ·生物进化中FDOD方法的应用 | 第30-32页 |
| 5 信息离散性度量方法在SARS病毒研究中的应用 | 第32-40页 |
| ·研究SARS病毒的意义 | 第32页 |
| ·冠状病毒概述 | 第32-33页 |
| ·冠状病毒科的分类 | 第32-33页 |
| ·人类的冠状病毒感染 | 第33页 |
| ·SARS数据及分析的基本思路 | 第33-34页 |
| ·结果与讨论 | 第34-38页 |
| ·复制酶(Replicase 1A)的系统发育树 | 第34-35页 |
| ·M蛋白(Membrane Glycoprotein)的系统发育树 | 第35-36页 |
| ·N蛋白(Nucleocapsid)的系统发育树 | 第36-37页 |
| ·S蛋白(Spike Glycoprotein)的系统发育树 | 第37-38页 |
| ·结论 | 第38-40页 |
| 6 基于信息离散性度量方法的微生物全蛋白质组的系统发育分析 | 第40-48页 |
| ·微生物在生物界中的地位及研究的意义 | 第40-41页 |
| ·微生物的分类及存在的问题 | 第41-42页 |
| ·数据及分析的基本思路 | 第42-45页 |
| ·结果与讨论 | 第45-48页 |
| 7 基于线粒体全基因组的几种非比对方法比较 | 第48-56页 |
| ·研究的意义 | 第48页 |
| ·方法和数据 | 第48-52页 |
| ·基本概念和符号定义 | 第48-49页 |
| ·非比对方法介绍 | 第49-50页 |
| ·数据 | 第50-52页 |
| ·研究思路 | 第52-53页 |
| ·结果和分析 | 第53-56页 |
| 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 大连理工大学学位论文版权使用授权书 | 第64页 |
