| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-32页 |
| 1.1 盐霉素的研究现状 | 第12-20页 |
| 1.1.1 盐霉素的生物合成研究进展 | 第13-16页 |
| 1.1.2 盐霉素的发酵工程研究进展 | 第16-18页 |
| 1.1.3 盐霉素产生菌的代谢工程改造 | 第18-20页 |
| 1.2 基因组指导下代谢工程改造概述 | 第20-25页 |
| 1.2.1 阿维菌素产生菌代谢工程改造 | 第20-21页 |
| 1.2.2 克拉维酸产生菌代谢工程改造 | 第21-22页 |
| 1.2.3 井冈霉素产生菌代谢工程改造 | 第22-23页 |
| 1.2.4 达托霉素产生菌代谢工程改造 | 第23-25页 |
| 1.3 比较基因组研究进展 | 第25-29页 |
| 1.3.1 红霉素产生菌比较基因组研究 | 第25-28页 |
| 1.3.2 普那霉素产生菌比较基因组研究 | 第28-29页 |
| 1.4 比较功能基因组研究进展 | 第29-30页 |
| 1.4.1 利福霉素产生菌的比较功能基因组研究 | 第29-30页 |
| 1.5 研究内容和目的 | 第30-32页 |
| 1.5.1 研究内容 | 第30-31页 |
| 1.5.2 研究目的 | 第31-32页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第32-53页 |
| 2.1 研究中所用菌株 | 第32-34页 |
| 2.2 研究中所用质粒 | 第34-38页 |
| 2.3 研究中所用引物 | 第38-45页 |
| 2.4 研究中所用培养基 | 第45-46页 |
| 2.5 研究中所用培养基 | 第46-47页 |
| 2.6 实验方法 | 第47-53页 |
| 第三章 比较功能基因组对盐霉素高产机理的解析 | 第53-68页 |
| 3.1 前言 | 第53页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第53-66页 |
| 3.2.1 高产菌株S.albus BK3-25 与野生型DSM41398 表型比较 | 第53-54页 |
| 3.2.2 S.albus BK3-25 全基因组图谱构建和基本特征 | 第54-57页 |
| 3.2.3 S.albus BK3-25与S.albus DSM41398 基因组比较 | 第57-59页 |
| 3.2.4 Det-I和 PKS-6 缺失显著提高盐霉素产量 | 第59-60页 |
| 3.2.5 转录调控因子突变提高盐霉素合成基因簇转录水平 | 第60-63页 |
| 3.2.6 关键转录调控因子回补使盐霉素合成基因簇转录恢复到接近野生型水平 | 第63-64页 |
| 3.2.7 组合缺失关键转录调控因子进一步提高盐霉素合成基因簇转录和产量 | 第64-65页 |
| 3.2.8 组合缺失大片段和关键转录调控因子提高盐霉素产量和转录水平 | 第65-66页 |
| 3.3 小结 | 第66-68页 |
| 第四章 盐霉素高产菌株的定向高产改造 | 第68-77页 |
| 4.1 前言 | 第68-69页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第69-76页 |
| 4.2.1 BK3-25中PKS生物合成基因簇的转录量分析 | 第69-70页 |
| 4.2.2 竞争基因簇中断促进产量提高 | 第70-72页 |
| 4.2.3 胞内前体浓度的定量确定盐霉素生物合成前体供应的限速步骤 | 第72-73页 |
| 4.2.4 乙基丙二酰辅酶A合成途径强化对盐霉素产量的贡献 | 第73-74页 |
| 4.2.5 串联表达关键基因进一步提高盐霉素产量 | 第74-76页 |
| 4.3 小结 | 第76-77页 |
| 第五章 豆油促进盐霉素产量提高的分子机理 | 第77-87页 |
| 5.1 前言 | 第77-78页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第78-87页 |
| 5.2.1 S.albus的豆油偏好性研究 | 第78页 |
| 5.2.2 不同豆油添加量下的盐霉素产量 | 第78-79页 |
| 5.2.3 不同豆油添加量下的转录组分析 | 第79-81页 |
| 5.2.4 不同豆油添加下生物量研究 | 第81-83页 |
| 5.2.5 初级代谢途径的弱化 | 第83-87页 |
| 第六章 总结与展望 | 第87-89页 |
| 6.1 总结 | 第87页 |
| 6.2 研究创新点 | 第87页 |
| 6.3 展望 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-93页 |
| 致谢 | 第93-95页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第95页 |
