| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSRACT | 第5-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-26页 |
| 1.1.β-甲基氨基酸研究现状 | 第9-12页 |
| 1.2.甲基转移酶研究现状 | 第12-24页 |
| 1.2.1.概述 | 第12页 |
| 1.2.2.甲基转移酶分类 | 第12-15页 |
| 1.2.3.O-甲基转移酶研究发展和应用 | 第15-18页 |
| 1.2.4.N-甲基转移酶研究发展和应用 | 第18-21页 |
| 1.2.5.C-甲基转移酶研究发展和应用 | 第21-24页 |
| 1.3.本课题研究意义 | 第24-26页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第26-36页 |
| 2.1.实验材料 | 第26-30页 |
| 2.2.实验方法 | 第30-36页 |
| 2.2.1.分子克隆基本实验方法 | 第30-31页 |
| 2.2.2.蛋白质表达及纯化 | 第31-32页 |
| 2.2.3.蛋白质结晶及其晶体结构解析 | 第32-35页 |
| 2.2.4.QM/MM计算 | 第35页 |
| 2.2.5.目的蛋白生化活性验证 | 第35-36页 |
| 第三章 甲基转移酶MarI及其复合物结构解析 | 第36-53页 |
| 3.1.MarI蛋白纯化 | 第36-37页 |
| 3.2.金属离子Fe~(3+)的确定 | 第37-38页 |
| 3.3.MarI结晶条件优化 | 第38-39页 |
| 3.4.MarI-SAM-Inpy复合物晶体结构 | 第39-45页 |
| 3.4.1.数据收集与处理 | 第39-40页 |
| 3.4.2.复合物晶体结构解析 | 第40-42页 |
| 3.4.3.MarI-SAM-Inpy复合物晶体整体结构 | 第42-43页 |
| 3.4.4.MarI-SAM-Inpy活性中心分析 | 第43-45页 |
| 3.5.MarI-SAH-β-MeInpy复合物晶体结构 | 第45-49页 |
| 3.5.1.数据收集与处理 | 第45-46页 |
| 3.5.2.复合物晶体结构解析 | 第46-47页 |
| 3.5.3.MarI-SAH-β-MeInpy复合物整体结构 | 第47-48页 |
| 3.5.4.MarI-SAH-β-MeInpy复合物活性口袋分析 | 第48-49页 |
| 3.6.MarI复合物及同源蛋白活性口袋比对 | 第49-51页 |
| 3.6.1.MarI复合物晶体活性口袋比对 | 第49-50页 |
| 3.6.2.MarI与同源蛋白MppJ活性口袋比对 | 第50-51页 |
| 3.7.小结 | 第51-53页 |
| 第四章 基于QM/MM及突变体活性的催化机理推导及验证 | 第53-63页 |
| 4.1.MarI生物信息学分析 | 第53-54页 |
| 4.2.QM/MM计算MarI催化反应机制 | 第54-55页 |
| 4.3.突变体设计、纯化及其活性实验 | 第55-59页 |
| 4.4.SAM在 MarI蛋白中的双功能作用 | 第59-60页 |
| 4.5.MarI催化机理 | 第60-61页 |
| 4.6.小结 | 第61-63页 |
| 第五章 总结与展望 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-72页 |
| Abbreviations缩略表 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 攻读学位期间发表或者已录用的学术论文 | 第75-77页 |
