摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5-6页 |
第一章 前言 | 第10页 |
1 piRNA的研究进展 | 第10-29页 |
1.1 piRNA的生物合成 | 第10-17页 |
1.1.1 piRNA的产生 | 第10-12页 |
1.1.2 piRNA相关蛋白 | 第12-13页 |
1.1.3 piRNA功能 | 第13-14页 |
1.1.4 piRNA与疾病 | 第14-16页 |
1.1.5 piRNA与DNA甲基化 | 第16-17页 |
1.1.6 神经相关piRNA | 第17页 |
1.2转座子 | 第17-21页 |
1.2.1转座子介绍 | 第17-18页 |
1.2.2转座子分类 | 第18-20页 |
1.2.3转座子的作用 | 第20-21页 |
1.3 piRNA数据库 | 第21-29页 |
1.3.1 IsopiRBank | 第21-22页 |
1.3.2 piRNA cluster database | 第22页 |
1.3.3 piRNAQuest | 第22-23页 |
1.3.4 RNAdb | 第23页 |
1.3.5 NONCONDE | 第23-24页 |
1.3.6 piRNABank | 第24-25页 |
1.3.7 piRTarBase | 第25-26页 |
1.3.8 piRNA研究工具 | 第26-29页 |
第二章材料与方法 | 第29-32页 |
2数据收集和整理 | 第29-32页 |
2.1 软件、平台及语言 | 第29页 |
2.2 数据整理 | 第29-32页 |
第三章 结果与分析 | 第32-51页 |
3. 数据库更新结果展示 | 第32-51页 |
3.1 数据更新和对比 | 第32-35页 |
3.1.1 数据集以及数据量对比 | 第32-33页 |
3.1.2 基因组版本替换以及更新 | 第33-34页 |
3.1.3 piRBase与其他数据库比较 | 第34-35页 |
3.2 数据库展示 | 第35-51页 |
3.2.1 基础页面 | 第35-42页 |
3.2.2 piRNA相关功能辅助页面 | 第42-45页 |
3.2.3 下载页面 | 第45-46页 |
3.2.4 数据可视化展示页面 | 第46-47页 |
3.2.5 数据库辅助研究工具 | 第47-51页 |
3.2.6 其他页面 | 第51页 |
第四章 | 第51-57页 |
4 讨论和意义 | 第51-57页 |
4.1 意义 | 第51-52页 |
4.1.1 piRbase为其他数据库提供了数据基础 | 第51页 |
4.1.2 piRbase为开发方法提供基础 | 第51-52页 |
4.2 在研究中存在的不足和问题 | 第52-57页 |
4.2.1 物种容量方面略显不足 | 第52-53页 |
4.2.2 开发工具还有待提高 | 第53页 |
4.2.3 转座子注释需进一步完善 | 第53-54页 |
4.2.4 互作蛋白和疾病相关piRNA数据收集有待加强 | 第54-55页 |
4.2.5 piRNA研究模型收集还需加强 | 第55-57页 |
参考文献 | 第57-67页 |
致谢 | 第67-69页 |
个人简历及硕士期间发表的学术论文 | 第69页 |