| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 第一章 文献综述和研究内容 | 第15-36页 |
| 1.1 植物抗寒性研究进展 | 第15-25页 |
| 1.1.1 低温胁迫对植物膜系统稳定性的影响 | 第15-16页 |
| 1.1.2 低温胁迫对植物保护酶活性的影响 | 第16-18页 |
| 1.1.3 低温胁迫对植物光合作用的影响 | 第18-19页 |
| 1.1.4 低温胁迫对植物渗透调节物质的影响 | 第19-22页 |
| 1.1.4.1 低温胁迫对植物可溶性蛋白质含量的影响 | 第19-20页 |
| 1.1.4.2 低温胁迫对植物体内可溶性糖变化的影响 | 第20-21页 |
| 1.1.4.3 低温胁迫对植物体内脯氨酸含量的影响 | 第21-22页 |
| 1.1.4.4 低温胁迫对植物体内丙二醛含量的影响 | 第22页 |
| 1.1.5 低温胁迫对植物分子反应机制的影响 | 第22-25页 |
| 1.2 植物转录组学研究进展 | 第25-29页 |
| 1.2.1 转录组学发展史 | 第26-28页 |
| 1.2.1.1 第一代测序技术-Sanger链终止法 | 第26页 |
| 1.2.1.2 第二代测序技术-大规模平行测序 | 第26-27页 |
| 1.2.1.3 第三代测序技术-高通量、单分子测序 | 第27-28页 |
| 1.2.2 植物转录组学研究方法 | 第28页 |
| 1.2.3 RNA-Seq | 第28页 |
| 1.2.4 高通量测序技术在植物转录组研究中的应用 | 第28-29页 |
| 1.3 低温胁迫对植物蛋白质组的影响 | 第29-34页 |
| 1.3.1 蛋白质组学 | 第29-30页 |
| 1.3.2 蛋白质组学研究技术 | 第30页 |
| 1.3.3 低温胁迫对植物蛋白质组的影响 | 第30-34页 |
| 1.4 研究背景和目的意义 | 第34-35页 |
| 1.5 主要研究内容 | 第35页 |
| 1.6 研究技术路线 | 第35-36页 |
| 第二章 低温胁迫对木薯叶片代谢生理特性的影响 | 第36-54页 |
| 2.1 材料与方法 | 第36页 |
| 2.1.1 试剂材料 | 第36页 |
| 2.1.2 主要实验仪器 | 第36页 |
| 2.1.3 试剂耗材 | 第36页 |
| 2.2 实验方法 | 第36-39页 |
| 2.2.1 可溶性蛋白质含量的测定 | 第36-37页 |
| 2.2.2 细胞膜伤害度的测定 | 第37页 |
| 2.2.3 可溶性糖含量的测定 | 第37-38页 |
| 2.2.4 游离脯氨酸含量测定 | 第38页 |
| 2.2.5 丙二醛(MDA)含量的测定 | 第38页 |
| 2.2.6 超氧化物歧化酶(SOD)活性的测定 | 第38页 |
| 2.2.7 过氧化物酶(POD)活性的测定 | 第38-39页 |
| 2.2.8 统计分析 | 第39页 |
| 2.3 结果分析 | 第39-46页 |
| 2.3.1 低温胁迫对木薯叶片相对电导率(REC)的影响 | 第39-40页 |
| 2.3.2 低温胁迫对木薯叶片可溶性蛋白(SP)含量的影响 | 第40页 |
| 2.3.3 低温胁迫对木薯叶片可溶性糖(SS)含量的影响 | 第40-41页 |
| 2.3.4 低温胁迫对木薯叶片游离脯氨酸(Pro)含量的影响 | 第41-42页 |
| 2.3.5 低温胁迫对木薯叶片丙二醛(MDA)含量的影响 | 第42-43页 |
| 2.3.6 低温胁迫对木薯叶片超氧化物歧化酶(SOD)活性的影响 | 第43页 |
| 2.3.7 低温胁迫对木薯叶片过氧化物酶(POD)活性的影响 | 第43-44页 |
| 2.3.8 低温胁迫对木薯叶片生理生化指标的相关性分析 | 第44-45页 |
| 2.3.9 低温胁迫对木薯叶片生理生化指标的主成分分析 | 第45-46页 |
| 2.4 讨论 | 第46-53页 |
| 2.4.1 低温胁迫对植物体内细胞膜透性的影响 | 第46-47页 |
| 2.4.2 低温胁迫对植物体内可溶性蛋白质含量的影响 | 第47-48页 |
| 2.4.3 低温胁迫对植物体内可溶性糖含量的影响 | 第48-49页 |
| 2.4.4 低温胁迫对植物体内脯氨酸含量的影响 | 第49-50页 |
| 2.4.5 低温胁迫对植物体内丙二醛含量的影响 | 第50-52页 |
| 2.4.6 低温胁迫对植物体内SOD和POD保护酶活性的影响 | 第52-53页 |
| 2.5 本章小结 | 第53-54页 |
| 第三章 低温胁迫对木薯叶片的转录组学分析 | 第54-88页 |
| 3.1 材料与设备 | 第54页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第54页 |
| 3.1.2 仪器设备 | 第54页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第54页 |
| 3.2 实验方法 | 第54-59页 |
| 3.2.1 实验流程 | 第54-55页 |
| 3.2.2 生物信息分析流程 | 第55-56页 |
| 3.2.3 木薯叶片总RNA提取 | 第56页 |
| 3.2.4 RNA质量检测 | 第56-57页 |
| 3.2.5 转录组文库构建方法 | 第57页 |
| 3.2.6 数据组装 | 第57页 |
| 3.2.7 数据分析 | 第57-59页 |
| 3.2.7.1 数据预处理 | 第57页 |
| 3.2.7.2 表达谱生成 | 第57-58页 |
| 3.2.7.2.1 Mapping | 第57-58页 |
| 3.2.7.2.2 注释和评估基因表达水平 | 第58页 |
| 3.2.7.3 基因表达模式分析 | 第58-59页 |
| 3.2.7.4 基因表达差异分析 | 第59页 |
| 3.2.7.5 GO功能富集分析 | 第59页 |
| 3.2.7.6 关键通路分析 | 第59页 |
| 3.2.7.7 使用到的数据库链接和版本号 | 第59页 |
| 3.3 实验结果 | 第59-85页 |
| 3.3.1 总RNA质量检测结果及测序质量评估 | 第59-65页 |
| 3.3.2 测序数据组装的结果 | 第65-68页 |
| 3.3.2.1 数据过滤统计结果 | 第65页 |
| 3.3.2.2 Mapping | 第65-68页 |
| 3.3.2.2.1 Mapping统计结果 | 第65页 |
| 3.3.2.2.2 Mapping结果统计Reads在基因组上的分布 | 第65-68页 |
| 3.3.3 组装数据的功能注释结果 | 第68-69页 |
| 3.3.4 基因表达谱聚类分析 | 第69-71页 |
| 3.3.5 基因差异表达分析 | 第71-72页 |
| 3.3.6 SC8叶片中低温胁迫前后转录组调控比较分析 | 第72-73页 |
| 3.3.7 MS5叶片中低温胁迫前后转录组调控比较分析 | 第73-74页 |
| 3.3.8 SC8与MS5叶片中低温胁迫下的转录组调控比较分析 | 第74-75页 |
| 3.3.9 SC8与MS5叶片低温胁迫后恢复常温的转录组调控比较分析 | 第75-76页 |
| 3.3.10 差异基因表达模式聚类分析 | 第76-77页 |
| 3.3.11 差异基因GO功能富集分析 | 第77页 |
| 3.3.12 差异基因KEGG代谢通路富集分析 | 第77-84页 |
| 3.3.13 自由基和活性氧 | 第84-85页 |
| 3.4 讨论 | 第85-86页 |
| 3.5 本章小结 | 第86-88页 |
| 第四章 低温胁迫对木薯叶片的蛋白质组学分析 | 第88-109页 |
| 4.1 实验耗材与材料 | 第88页 |
| 4.1.1 试剂与设备 | 第88页 |
| 4.1.2 实验材料与处理方法 | 第88页 |
| 4.2 实验方法 | 第88-91页 |
| 4.2.1 木薯叶片蛋白质提取 | 第88-89页 |
| 4.2.2 蛋白质溶解 | 第89页 |
| 4.2.3 Bradford蛋白质定量法 | 第89页 |
| 4.2.4 蛋白质分离 | 第89-91页 |
| 4.2.4.1 胶条水化 | 第89页 |
| 4.2.4.2 等电聚焦电泳 | 第89-90页 |
| 4.2.4.3 SDS-PAGE | 第90页 |
| 4.2.4.4 染色与扫描 | 第90页 |
| 4.2.4.5 差异蛋白质分析 | 第90-91页 |
| 4.2.4.6 差异蛋白质鉴定 | 第91页 |
| 4.3 结果与分析 | 第91-103页 |
| 4.3.1 SC8木薯叶片蛋白质的分离结果 | 第91页 |
| 4.3.2 低温诱导SC8叶片差异蛋白质的分布及鉴定 | 第91-94页 |
| 4.3.3 MS5木薯叶片蛋白质的分离结果 | 第94-95页 |
| 4.3.4 低温诱导MS5叶片差异蛋白质的分布及鉴定 | 第95-98页 |
| 4.3.5 低温诱导SC8与MS5叶片差异蛋白质的比较分析 | 第98-101页 |
| 4.3.5.1 低温诱导SC8与MS5叶片共同表达的差异蛋白质 | 第98-100页 |
| 4.3.5.2 低温诱导SC8与MS5叶片差异表达的差异蛋白质 | 第100-101页 |
| 4.3.5.3 低温诱导SC8和MS5叶片差异蛋白质比较 | 第101页 |
| 4.3.6 低温诱导SC8与MS5叶片差异蛋白质的调控网络 | 第101-103页 |
| 4.4 讨论 | 第103-107页 |
| 4.4.1 参与光合作用相关蛋白 | 第104-105页 |
| 4.4.2 参与碳与能量代谢相关蛋白 | 第105-106页 |
| 4.4.3 参与低温胁迫响应相关调控蛋白 | 第106-107页 |
| 4.4.4 参与氧自由基清除相关功能蛋白 | 第107页 |
| 4.5 本章小结 | 第107-109页 |
| 总结 | 第109-112页 |
| 参考文献 | 第112-124页 |
| 发表文章 | 第124页 |
| 申请专利 | 第124-125页 |
| 致谢 | 第125页 |
