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安徽烟区烟草蚜传病毒病的检测及病毒遗传多样性分析

致谢第5-6页
摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第12-19页
    1.1 我国烟草病毒病的发生状况第12页
    1.2 安徽烟草病毒病发生状况第12-13页
    1.3 安徽省烟草蚜传病毒病的研究第13-16页
        1.3.1 黄瓜花叶病毒第13-14页
        1.3.2 马铃薯Y病毒第14页
        1.3.3 烟草脉带花叶病毒第14-15页
        1.3.4 芸薹黄化病毒第15-16页
        1.3.5 辣椒脉斑驳病毒第16页
    1.4 烟草病毒病的主要检测方法第16-19页
        1.4.1 指示植物法第16页
        1.4.2 电镜检测第16页
        1.4.3 血清学检测第16-17页
        1.4.4 分子生物学检测第17页
        1.4.5 高通量测序第17-19页
第二章 引言第19-20页
第三章 安徽烟区毒源植物和烟草蚜传病毒检测第20-24页
    3.1 材料第20-21页
        3.1.1 样本的采集第20页
        3.1.2 主要试剂第20页
        3.1.3 主要仪器第20-21页
    3.2 方法第21页
    3.3 结果分析第21-23页
        3.3.1 安徽烟区毒源植物检测第21-22页
        3.3.2 安徽烟区烟草蚜传病毒检测第22-23页
    3.4 讨论第23-24页
第四章 安徽烟区常见烟草蚜传病毒遗传多样性分析第24-40页
    4.1 材料第24页
        4.1.1 样本的采集第24页
        4.1.2 主要试剂第24页
        4.1.3 主要仪器第24页
    4.2 方法第24-27页
        4.2.1 引物设计第24-25页
        4.2.2 烟草总RNA的提取第25页
        4.2.3 反转录(RT)第25-26页
        4.2.4 PCR扩增第26页
        4.2.5 PCR产物的纯化回收第26-27页
        4.2.6 测序第27页
    4.3 安徽省黄瓜花叶病毒病的遗传多样性分析第27-32页
        4.3.1 RNA电泳检测第27-28页
        4.3.2 CMV的CP基因的扩增第28页
        4.3.3 CMV的CP序列的同源性比较第28-29页
        4.3.4 CMV的CP序列的系统进化树的构建第29-32页
        4.3.5 CMV的CP序列系统进化树分析第32页
    4.4 安徽省马铃薯Y病毒的遗传多样性分析第32-35页
        4.4.1 PVYCP基因的扩增第32-33页
        4.4.2 PVY的CP序列的系统进化树的构建第33-35页
        4.4.3 PVY的CP序列系统进化树分析第35页
    4.5 安徽省烟草脉带花叶病毒的遗传多样性分析第35-38页
        4.5.1 TVBMV的CP基因的扩增第35-36页
        4.5.2 TVBMV的CP序列的系统进化树的构建第36-38页
        4.5.3 TVBMV的CP序列系统进化树分析第38页
    4.6 讨论第38-40页
第五章 利用siRNA高通量测序技术检测烟草病毒第40-49页
    5.1 材料与方法第40-41页
        5.1.1 试验材料第40页
        5.1.2 烟草总RNA的提取第40页
        5.1.3 建库及测序第40页
        5.1.4 样本病毒分析第40-41页
        5.1.5 RT-PCR和RACE第41页
        5.1.6 序列重组分析第41页
    5.2 结果与分析第41-48页
        5.2.1 烟草siRNA高通量测序结果第41-42页
        5.2.2 病毒检测结果第42-44页
        5.2.3 安徽烟区首次发现芸薹黄化病毒第44-48页
        5.2.4 安徽烟区辣椒脉斑驳病毒第48页
    5.3 讨论第48-49页
第六章 结论第49-51页
参考文献第51-58页
作者简介第58页

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