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细菌生物膜对天然及工程纳米颗粒的响应机制

摘要第8-10页
Abstract第10-12页
第一章 前言第13-26页
    1.1 土壤微生物第13-14页
        1.1.1 土壤微生物功能第14页
    1.2 土壤生物膜第14-17页
        1.2.1 生物膜定义及组成第15-16页
        1.2.2 生物膜形成过程第16-17页
    1.3 纳米颗粒的起源、定义及分类第17-19页
        1.3.1 纳米颗粒起源及定义第17-18页
        1.3.2 纳米颗粒分类第18-19页
    1.4 土壤中天然纳米颗粒的环境效应第19-20页
        1.4.1 天然纳米颗粒的产生第19页
        1.4.2 天然纳米颗粒在环境中的作用第19-20页
    1.5 工程纳米颗粒的环境行为及归宿第20-21页
    1.6 纳米颗粒的微生物效应第21-24页
        1.6.1 光照对纳米颗粒细胞毒性的影响第22页
        1.6.2 纳米颗粒类型、离子强度及pH对纳米颗粒细胞毒性的影响第22-23页
        1.6.3 环境因素介导的纳米颗粒环境效应第23-24页
        1.6.4 纳米颗粒对细菌胞外电子传递影响第24页
        1.6.5 纳米颗粒对细胞分子水平影响第24页
    1.7 本文研究目的和意义第24-26页
第二章 表面结合态腐殖酸介导下恶臭假单胞菌代谢、存活和基因表达对赤铁矿纳米颗粒的响应第26-60页
    2.1 引言第26-28页
    2.2 材料与方法第28-37页
        2.2.1 赤铁矿(hematite)纳米颗粒的制备和腐殖酸(HA)的纯化第28-30页
        2.2.2 赤铁矿-腐殖酸复合体(hematite-HA)的制备第30页
        2.2.3 纳米颗粒表征第30-31页
        2.2.4 模式细菌的选择和菌悬液的制备第31页
        2.2.5 Hematite和hematite-HA的细胞暴露实验第31-32页
        2.2.6 等温微量热技术第32-33页
        2.2.7 Hematite和hematite-HA与恶臭假单胞菌的异质团聚和共沉淀实验第33页
        2.2.8 暴露于纳米颗粒的细菌细胞的显微观察第33-34页
        2.2.9 胞内活性氧(ROS)和丙二醛(MDA)的定量第34-35页
        2.2.10 恶臭假单胞菌生物膜形成相关基因的转录机制研究第35-37页
        2.2.11 统计分析第37页
    2.3 结果与讨论第37-59页
        2.3.1 Hematite和hematite-HA复合体纳米颗粒的表征第37-39页
        2.3.2 表面结合态HA对纳米颗粒细胞毒性的影响第39-44页
        2.3.3 表面结合态HA与纳米颗粒间互作及其对纳米毒性影响的机制第44-59页
            2.3.3.1 显微镜观察第44-46页
            2.3.3.2 表面结合态HA对胞内ROS和MDA生产的影响第46-50页
            2.3.3.3 HA对hematite纳米颗粒与细菌细胞异质团聚和共沉淀的影响第50-53页
            2.3.3.4 纳米颗粒与细胞膜间界面相互作用能的计算第53-56页
            2.3.3.5 细胞对hematite或hematite-HA纳米颗粒暴露的响应第56-59页
    2.4 结论第59-60页
第三章 氧化锌纳米颗粒在恶臭假单胞菌生物膜发育过程中的剂量刺激效应第60-82页
    3.1 引言第60-62页
    3.2 材料与方法第62-70页
        3.2.1 ZnO纳米颗粒第62页
        3.2.2 细菌菌株的选择和培养第62-63页
        3.2.3 ZnO纳米颗粒悬浮液中细菌细胞的生长和生物膜的形成第63-64页
        3.2.4 死细胞对细菌生物膜形成的影响第64-65页
        3.2.5 有/无可溶性EPS的成熟生物膜中的ZnO纳米颗粒暴露第65-66页
        3.2.6 生物膜在ZnO纳米颗粒表面的定殖及激光共聚焦显微分析第66-67页
        3.2.7 恶臭假单胞菌生物膜基质中碳水化合物和蛋白质的定量第67页
        3.2.8 ROS和MDA的定量第67页
        3.2.9 纳米颗粒暴露对恶臭假单胞菌生物膜相关基因表达的影响第67-70页
        3.2.10 统计分析第70页
    3.3 结果与讨论第70-81页
        3.3.1 ZnO纳米颗粒悬浮液对细胞生长和生物膜形成的影响第70-72页
        3.3.2 生物膜在ZnO纳米颗粒表面的定殖:生物量和基质组分的定量第72-75页
        3.3.3 低浓度ZnO纳米颗粒促进生物膜形成的机理第75-81页
            3.3.3.1 死细胞促进细胞生长和生物膜发育第75-76页
            3.3.3.2 EPS在生物膜对ZnO纳米颗粒耐受性中的作用第76-79页
            3.3.3.3 ZnO纳米颗粒对生物膜相关基因表达的影响第79-81页
    3.4 结论第81-82页
第四章 QCM-D及二维红外技术研究纳米颗粒与生物膜间互作:生物膜的结构响应第82-98页
    4.1 引言第82-84页
    4.2 材料与方法第84-86页
        4.2.1 细菌种类和接种物制备第84页
        4.2.2 QCM-D装置清洁、细菌接种和生物膜培养第84页
        4.2.3 QCM-D装置中ZnO纳米颗粒的暴露实验第84-85页
        4.2.4 QCM-D数据分析第85页
        4.2.5 石英晶体表面生物膜的CLSM、SIM和SEM成像第85-86页
        4.2.6 ATR-FTIR测定ZnO纳米颗粒与细菌生物膜界面互作第86页
        4.2.7 二维红外(2D-COS)相关数据分析第86页
    4.3 结果与讨论第86-97页
        4.3.1 QCM-D监测的生物膜生长第86-89页
        4.3.2 成熟生物膜对纳米颗粒的响应第89-90页
        4.3.3 CLSM成像:石英晶体或纳米颗粒表面的生物膜发育情况第90-91页
        4.3.4 ATR-FTIR及二维红外光谱分析第91-94页
        4.3.5 ZnO纳米颗粒暴露对生物膜结构(细胞排列)的影响第94-96页
        4.3.6 生物膜形成过程中的模型推理第96-97页
    4.4 结论第97-98页
第五章 研究结论、创新点和展望第98-101页
    5.1 主要结论第98-99页
    5.2 创新点第99页
    5.3 研究展望第99-101页
参考文献第101-126页
攻读博士学位期间撰写的论文第126-127页
致谢第127-129页

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