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克氏梭菌链延伸生理机制的初步研究

摘要第8-12页
ABSTRACT第12-15页
第一章 前言第16-24页
    1 背景介绍第16-17页
    2 研究进展第17-21页
    3 本论文的主要研究内容第21-24页
第二章 克氏梭菌发酵产中链脂肪酸的研究第24-34页
    1 实验材料与方法第24-27页
        1.1 主要材料和试剂第24-25页
        1.2 主要仪器第25页
        1.3 菌株第25页
        1.4 培养基第25页
        1.5 GC-MS鉴定脂肪酸产物第25-26页
        1.6 HPLC检测脂肪酸产物的产量第26-27页
    2 结果与讨论第27-33页
        2.1 克氏梭菌发酵产生脂肪酸的GC-MS鉴定第27-30页
        2.2 克氏梭菌发酵产生脂肪酸的HPLC测定第30-33页
    3 本章小结第33-34页
第三章 克氏梭菌中氧化还原感应转录阻遏蛋白Rex的研究第34-50页
    1 实验材料与方法第34-41页
        1.1 主要材料和试剂第34-35页
        1.2 主要仪器第35页
        1.3 菌株和质粒第35页
        1.4 培养基及缓冲液第35-36页
        1.5 调控蛋白Rex的生物信息学分析第36页
        1.6 调控蛋白Rex的异源表达和纯化第36-38页
        1.7 凝胶阻滞实验(EMSA)第38-40页
        1.8 等温滴定量热实验(ITC)第40-41页
    2 结果和讨论第41-49页
        2.1 调控蛋白Rex的生物信息学分析第41-44页
        2.2 Rex蛋白表达菌株的构建第44页
        2.3 Rex蛋白纯化第44-45页
        2.4 凝胶阻滞实验(EMSA)检验Rex和核酸的相互作用第45-47页
        2.5 等温滴定量热实验(ITC)测定结合常数第47-49页
    3 本章小结第49-50页
第四章 克氏梭菌不同生长时期和不同底物的转录组分析第50-62页
    1 实验材料与方法第50-53页
        1.1 主要材料和试剂第50-51页
        1.2 主要仪器第51页
        1.3 菌株第51页
        1.4 培养基第51页
        1.5 生长曲线测定第51页
        1.6 克氏梭菌不同生长时期和底物下转录组测序第51-52页
        1.7 克氏梭菌胞内NAD~+/NADH测定第52-53页
    2 结果与讨论第53-61页
        2.1 克氏梭菌生长曲线测定第53-54页
        2.2 克氏梭菌的转录差异分析第54-59页
        2.3 克氏梭菌胞内NAD~+/NADH的测量第59页
        2.4 转录组分析受Rex调控的基因第59-61页
    3 本章小结第61-62页
第五章 克氏梭菌产中链脂肪酸关键酶的研究第62-80页
    1 实验材料与方法第62-70页
        1.1 主要材料和试剂第62-63页
        1.2 主要仪器第63-64页
        1.3 菌株和质粒第64页
        1.4 培养基及缓冲液第64页
        1.5 3-羟基丁酰-CoA脱氢酶Hbd1和Hbd2的异源表达和纯化第64-66页
        1.6 Hbd1和Hbd2酶学性质测定第66-67页
        1.7 铁氧化还原蛋白的高效异源表达和纯化第67-69页
        1.8 不同生长时期和底物克氏梭菌粗酶液关键酶酶活测定第69-70页
    2 结果与讨论第70-79页
        2.1 Hbd1和Hbd2异源表达菌株的构建第70-71页
        2.2 Hbd1和Hbd2的纯化第71-72页
        2.3 Hbd1和Hbd2酶学性质测定第72-74页
        2.4 铁氧还蛋白表达菌株的构建第74-75页
        2.5 铁氧还蛋白的纯化第75-76页
        2.6 铁氧还蛋白的高效表达第76-78页
        2.7 克氏梭菌粗酶液中关键酶酶活测定第78-79页
    3 本章小结第79-80页
第六章 克氏梭菌产醇的初步研究第80-102页
    1 实验材料与方法第80-87页
        1.1 主要材料和试剂第80-81页
        1.2 主要仪器第81页
        1.3 菌株和质粒第81页
        1.4 培养基及缓冲液第81-82页
        1.5 克氏梭菌乙酸底物发酵产物的GC-MS分析第82-83页
        1.6 产丁醇途径中关键酶的异源表达和性质检验第83-87页
    2 结果与讨论第87-101页
        2.1 克氏梭菌乙酸底物发酵产物的GC-MS分析鉴定第87-89页
        2.2 发酵产物的GC定量检测第89-92页
        2.3 克氏梭菌产丁醇途径的假设第92-93页
        2.4 双功能酶Aad的功能验证第93-96页
        2.5 丁醇脱氢酶Bdh2的功能验证第96-98页
        2.6 醛脱氢酶Ald1的功能验证第98-101页
    3 本章小结第101-102页
总结与展望第102-104页
参考文献第104-110页
致谢第110-111页
在读期间发表论文第111-112页
学位论文评阅及答辩情况表第112页

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