| 摘要 | 第9-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-30页 |
| 1.1 概述 | 第16-17页 |
| 1.2 桑椹菌核病 | 第17-19页 |
| 1.2.1 桑椹肥大性菌核病 | 第17-18页 |
| 1.2.2 桑椹小粒性菌核病 | 第18-19页 |
| 1.2.3 桑椹缩小性菌核病 | 第19页 |
| 1.3 真菌黑色素 | 第19-21页 |
| 1.3.1 黑色素性质和作用 | 第19-20页 |
| 1.3.2 黑色素的分类 | 第20页 |
| 1.3.3 黑色素与病原菌的致病性相关 | 第20-21页 |
| 1.3.4 DHN黑色素生物合成 | 第21页 |
| 1.4 桑椹菌核病的发生和防治 | 第21-23页 |
| 1.4.1 桑椹菌核病的发生 | 第21-22页 |
| 1.4.2 桑椹菌核病的防控 | 第22-23页 |
| 1.5 菌核类病原菌的致病因子—草酸 | 第23页 |
| 1.6 植物先天免疫反应 | 第23-29页 |
| 1.6.1 PTI反应 | 第25-26页 |
| 1.6.2 PRRs识别信号的传递 | 第26-28页 |
| 1.6.3 ETI反应 | 第28-29页 |
| 1.7 结语 | 第29-30页 |
| 第二章 引言 | 第30-32页 |
| 2.1 研究目的和意义 | 第30页 |
| 2.2 主要研究内容 | 第30页 |
| 2.3 研究路线 | 第30-32页 |
| 第三章 核地杖菌黑色素生物合成相关基因ShLAC1的功能研究 | 第32-56页 |
| 3.1 材料,试剂和仪器 | 第32-34页 |
| 3.1.1 菌株 | 第32页 |
| 3.1.2 质粒载体 | 第32页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第32-33页 |
| 3.1.4 主要的培养基和溶剂配制 | 第33-34页 |
| 3.1.5 主要仪器 | 第34页 |
| 3.2 实验方法 | 第34-42页 |
| 3.2.1 丝状真菌基因组DNA的提取(CTAB提取法) | 第34-35页 |
| 3.2.2 丝状真菌总RNA的提取 | 第35-36页 |
| 3.2.3 cDNA第一链的合成 | 第36页 |
| 3.2.4 基因克隆 | 第36-38页 |
| 3.2.5 黑色素提取 | 第38-39页 |
| 3.2.6 黑色素产量(滤液中)的测定 | 第39页 |
| 3.2.7 GC-MS鉴定核地杖菌黑色素类型 | 第39页 |
| 3.2.8 农杆菌感受态细胞的制备 | 第39-40页 |
| 3.2.9 农杆菌感受态细胞的转化步骤如下 | 第40页 |
| 3.2.10 农杆菌介导的核地杖菌转化 | 第40页 |
| 3.2.11 草酸色谱分析 | 第40页 |
| 3.2.12 ShLAC1基因沉默载体构建 | 第40-41页 |
| 3.2.13 本部分内容所用到的引物 | 第41-42页 |
| 3.2.14 基因的生物信息学分析 | 第42页 |
| 3.3 结果与分析 | 第42-54页 |
| 3.3.1 核地杖菌的形态特征 | 第42-45页 |
| 3.3.2 核地杖菌的黑色素的鉴定 | 第45页 |
| 3.3.3 核地杖菌ShLAC1的克隆 | 第45-47页 |
| 3.3.4 ShLAC1沉默转化子的分析 | 第47-51页 |
| 3.3.5 ShLAC1沉默转化子对致病性的影响 | 第51-54页 |
| 3.4 总结与讨论 | 第54-56页 |
| 第四章 感染桑椹菌核病桑椹的转录组分析 | 第56-72页 |
| 4.1 实验材料和试剂 | 第56页 |
| 4.1.1 桑树材料 | 第56页 |
| 4.1.2 菌种 | 第56页 |
| 4.2 实验方法 | 第56-57页 |
| 4.2.1 接种和取材 | 第56-57页 |
| 4.2.2 RNA提取 | 第57页 |
| 4.2.3 测序分析 | 第57页 |
| 4.3 结果与分析 | 第57-69页 |
| 4.3.1 转录组的测序和组装 | 第57-58页 |
| 4.3.2 转录组的功能注释与基因本体(GeneOntology,GO)分类 | 第58-60页 |
| 4.3.3 差异表达基因(DEGs)的分析 | 第60-63页 |
| 4.3.4 防御相关KEGG代谢途径中DEGs分析 | 第63-65页 |
| 4.3.5 植物—病原物互作相关基因的表达 | 第65-69页 |
| 4.4 总结与讨论 | 第69-72页 |
| 第五章 桑树几丁质识别受体的功能研究 | 第72-100页 |
| 5.1 材料 | 第72-76页 |
| 5.1.1 植物 | 第72页 |
| 5.1.2 菌株 | 第72页 |
| 5.1.3 载体 | 第72页 |
| 5.1.4 主要试剂 | 第72-73页 |
| 5.1.5 主要培养基和溶剂配制 | 第73-76页 |
| 5.1.6 主要仪器 | 第76页 |
| 5.2 实验方法 | 第76-84页 |
| 5.2.1 红果二号幼苗处理 | 第76页 |
| 5.2.2 植物总RNA提取 | 第76-77页 |
| 5.2.3 cDNA第一链的合成 | 第77页 |
| 5.2.4 酵母双杂交(Y2H)检测 | 第77-78页 |
| 5.2.5 亚细胞定位 | 第78页 |
| 5.2.6 双分子荧光互作(BiFC) | 第78页 |
| 5.2.7 MmLYP1和MmLYK2多克隆抗体制备 | 第78-80页 |
| 5.2.8 植物蛋白提取 | 第80-81页 |
| 5.2.9 Westernblotting | 第81页 |
| 5.2.10 多糖亲和沉淀分析 | 第81-82页 |
| 5.2.11 免疫共沉淀(Co-IP) | 第82-83页 |
| 5.2.12 本部分内容所用到的引物 | 第83-84页 |
| 5.2.13 生物信息学分析 | 第84页 |
| 5.3 结果与分析 | 第84-98页 |
| 5.3.1 LysM受体蛋白的鉴定 | 第84-85页 |
| 5.3.2 MmLYP1是几丁质识别受体 | 第85-87页 |
| 5.3.3 MmLYK2可能是MmLYP1识别的几丁质信号的下游蛋白 | 第87-91页 |
| 5.3.4 MmLYP1和MmLYK2亚细胞定位 | 第91-93页 |
| 5.3.5 MmLYP1和MmLYK2的相互作用 | 第93-95页 |
| 5.3.6 MmLYK2的LysM1是MmLYP1和MmLYK2互作的关键基序 | 第95-98页 |
| 5.4 总结与讨论 | 第98-100页 |
| 第六章 综合与结论 | 第100-103页 |
| 论文创新点 | 第103-105页 |
| 参考文献 | 第105-117页 |
| 缩略词表 | 第117-119页 |
| 附录 | 第119-123页 |
| 在读期间发表文章及参研课题 | 第123-125页 |
| 致谢 | 第125页 |
