| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 1 绪论 | 第8-20页 |
| 1.1 生皮的概述 | 第8-15页 |
| 1.1.1 蛋白质的组成 | 第9-10页 |
| 1.1.2 蛋白质的结构及分类 | 第10-13页 |
| 1.1.3 蛋白质的性质与应用 | 第13-15页 |
| 1.2 皮革的热稳定性 | 第15-18页 |
| 1.2.1 皮革热稳定性的重要性 | 第15-16页 |
| 1.2.2 皮革热稳定性的研究现状 | 第16-18页 |
| 1.3 本课题的研究内容及意义 | 第18-20页 |
| 2 分子动力学 | 第20-24页 |
| 2.1 分子动力学模拟的基本原理 | 第20-21页 |
| 2.2 动力学方程的求解 | 第21页 |
| 2.3 势函数 | 第21-22页 |
| 2.4 重要术语 | 第22页 |
| 2.5 分子动力学的应用 | 第22-23页 |
| 2.6 本章小结 | 第23-24页 |
| 3 实验部分 | 第24-33页 |
| 3.1 实验所用软件 | 第24-26页 |
| 3.1.1 Amber软件介绍 | 第24页 |
| 3.1.2 Visual Molecular Dynamics软件介绍 | 第24-25页 |
| 3.1.3 MATLAB软件介绍 | 第25-26页 |
| 3.2 实验前期准备 | 第26-28页 |
| 3.2.1 PDB文件的准备 | 第26-27页 |
| 3.2.2 力场的选择 | 第27-28页 |
| 3.3 实验步骤 | 第28-30页 |
| 3.4 模拟运动轨迹的分析 | 第30-31页 |
| 3.4.1 运动轨迹的分析方法 | 第30-31页 |
| 3.4.2 运动轨迹的分析过程 | 第31页 |
| 3.5 本章小结 | 第31-33页 |
| 4 实验结果的分析与讨论 | 第33-43页 |
| 4.1 均方根偏差（RMSD)分析 | 第33-35页 |
| 4.2 轨迹取样分析 | 第35-38页 |
| 4.2.1 298K轨迹取样分析 | 第35-36页 |
| 4.2.2 338K轨迹取样分析 | 第36-37页 |
| 4.2.3 378K轨迹取样分析 | 第37页 |
| 4.2.4 418K轨迹取样分析 | 第37-38页 |
| 4.3 回转半径（Rg）分析 | 第38-40页 |
| 4.4 接触数（Cn）分析 | 第40-41页 |
| 4.5 本章小结 | 第41-43页 |
| 致谢 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-47页 |
| 附录 | 第47页 |