| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| 1.1 生物信息学概述 | 第8-10页 |
| 1.1.1 生物信息学的研究背景及概念 | 第8页 |
| 1.1.2 生物信息学的发展过程 | 第8页 |
| 1.1.3 生物信息学研究的内容与基本方法 | 第8-9页 |
| 1.1.4 生物信息学的现状及应用领域 | 第9-10页 |
| 1.2 血凝素基因的简介 | 第10页 |
| 1.3 p53基因的简介 | 第10页 |
| 1.4 密码子偏好性 | 第10-11页 |
| 1.5 本文的主要研究内容 | 第11-12页 |
| 第二章 拟密码子适应指数方法的设计及应用 | 第12-18页 |
| 2.1 材料与方法 | 第12-14页 |
| 2.1.1 材料来源 | 第12页 |
| 2.1.2 密码子适应指数 | 第12-13页 |
| 2.1.3 拟密码子适应指数 | 第13-14页 |
| 2.2 计算分析 | 第14-17页 |
| 2.2.1 6个物种的碱基分析 | 第14-16页 |
| 2.2.2 基因CAI的偏好性分析 | 第16-17页 |
| 2.2.3 基因Q-CAI的偏好性分析 | 第17页 |
| 2.3 本章小结 | 第17-18页 |
| 第三章 基于拟氨基酸编码方法的血凝素基因的偏好性研究 | 第18-28页 |
| 3.1 材料与方法 | 第18-19页 |
| 3.1.1 材料来源 | 第18页 |
| 3.1.2 有效密码子数 | 第18-19页 |
| 3.2 结果与分析 | 第19-27页 |
| 3.2.1 碱基组成分析 | 第19-21页 |
| 3.2.2 RUCU和QRSCU值分析 | 第21-23页 |
| 3.2.3 密码子适应指数(CAI)与有效密码子数(ENC)分析 | 第23-24页 |
| 3.2.4 基于血凝素基因的RSCU值和QRSCU值的聚类分析 | 第24-27页 |
| 3.3 本章小结 | 第27-28页 |
| 第四章 转移概率矩阵下p53家族的偏好性分析 | 第28-34页 |
| 4.1 材料与方法 | 第28-29页 |
| 4.1.1 材料来源 | 第28页 |
| 4.1.2 基于Markov模型的转移概率矩阵 | 第28-29页 |
| 4.2 结果分析及讨论 | 第29-32页 |
| 4.2.1 基因及氨基酸的偏好性分析 | 第29-31页 |
| 4.2.2 密码子第三位碱基的偏好性分析 | 第31-32页 |
| 4.3 本章小结 | 第32-34页 |
| 第五章 总结与展望 | 第34-36页 |
| 5.1 工作总结 | 第34页 |
| 5.2 工作展望 | 第34-36页 |
| 致谢 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-40页 |
| 附录：作者在攻读硕士学位期间发表的论文及参加的学术活动 | 第40页 |
