| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-33页 |
| 1.1 贝类变态研究进展 | 第17-23页 |
| 1.1.1 贝类幼虫的变态 | 第17-19页 |
| 1.1.2 贝类附着变态的诱导物及启动变态的信号转导模型 | 第19-21页 |
| 1.1.3 贝类变态过程的关键基因/蛋白 | 第21-23页 |
| 1.2 脉红螺变态发育的研究进展 | 第23-25页 |
| 1.2.1 脉红螺附着变态过程的形态学变化 | 第23-24页 |
| 1.2.2 脉红螺附着变态过程的化学诱导因子 | 第24-25页 |
| 1.3 组学技术及其在贝类发育研究中的应用 | 第25-30页 |
| 1.3.1 组学的研究内容与核心技术 | 第26-28页 |
| 1.3.2 组学的在贝类变态研究中的应用 | 第28-30页 |
| 1.4 本研究的目的、意义与研究思路 | 第30-32页 |
| 1.4.1 目的与意义 | 第30-31页 |
| 1.4.2 科学问题 | 第31页 |
| 1.4.3 研究内容与技术路线 | 第31-32页 |
| 1.4.4 预期成果 | 第32页 |
| 1.5 本章小结 | 第32-33页 |
| 第二章 脉红螺早期发育阶段的转录组建库 | 第33-49页 |
| 2.1 前言 | 第33-34页 |
| 2.2 材料与方法 | 第34-37页 |
| 2.2.1 样品采集 | 第34页 |
| 2.2.2 RNA提取 | 第34页 |
| 2.2.3 文库构建及测序 | 第34-35页 |
| 2.2.4 生物信息学分析 | 第35-36页 |
| 2.2.5 荧光定量PCR验证 | 第36-37页 |
| 2.3 实验结果与讨论 | 第37-47页 |
| 2.3.1 测序及组装 | 第37-39页 |
| 2.3.2 基因注释与功能分类 | 第39-43页 |
| 2.3.3 高表达量基因分析 | 第43-44页 |
| 2.3.4 与神经内分泌相关的基因表达分析 | 第44-47页 |
| 2.4 本章小结 | 第47-49页 |
| 第三章 脉红螺变态过程的基因表达谱特征 | 第49-69页 |
| 3.1 前言 | 第49页 |
| 3.2 材料与方法 | 第49-53页 |
| 3.2.1 样品采集 | 第49-50页 |
| 3.2.2 RNA提取、文库准备和上机测序 | 第50-51页 |
| 3.2.3 序列比对与分析 | 第51页 |
| 3.2.4 荧光定量PCR验证 | 第51-53页 |
| 3.3 实验结果 | 第53-61页 |
| 3.3.1 表达谱文库构建 | 第53-55页 |
| 3.3.2 变态发育过程表达谱变化特征 | 第55-61页 |
| 3.3.3 qPCR验证 | 第61页 |
| 3.4 讨论 | 第61-67页 |
| 3.4.1 与生长相关的差异基因 | 第61-64页 |
| 3.4.2 与神经系统相关的差异基因 | 第64页 |
| 3.4.3 消化系统相关基因 | 第64-65页 |
| 3.4.4 免疫系统相关基因 | 第65-66页 |
| 3.4.5 细胞凋亡相关基因 | 第66页 |
| 3.4.6 其他基因 | 第66-67页 |
| 3.5 本章小结 | 第67-69页 |
| 第四章 脉红螺变态过程中蛋白组响应特征 | 第69-87页 |
| 4.1 前言 | 第69-70页 |
| 4.2 材料与方法 | 第70-73页 |
| 4.2.1 幼虫培育与样品采集 | 第70页 |
| 4.2.2 蛋白提取及浓度测定 | 第70-71页 |
| 4.2.3 蛋白消化及iTRAQ标记 | 第71页 |
| 4.2.4 SCX分离和LC-MS/MS分析 | 第71-72页 |
| 4.2.5 蛋白质鉴定和定量 | 第72页 |
| 4.2.6 GO和KEGG通路富集分析 | 第72页 |
| 4.2.7 转录组和蛋白质组的关联分析 | 第72-73页 |
| 4.3 实验结果 | 第73-81页 |
| 4.3.1 蛋白质数据统计分析 | 第73-74页 |
| 4.3.2 差异蛋白分析 | 第74-79页 |
| 4.3.3 差异蛋白的GO注释和KEGG富集分析 | 第79-80页 |
| 4.3.4 蛋白质组与转录组的关联分析 | 第80-81页 |
| 4.4 讨论 | 第81-85页 |
| 4.4.1 细胞骨架和细胞粘附 | 第82-83页 |
| 4.4.2 摄食和消化 | 第83-84页 |
| 4.4.3 应激和免疫 | 第84-85页 |
| 4.4.4 特定组织发育 | 第85页 |
| 4.5 本章小结 | 第85-87页 |
| 第五章 脉红螺变态过程中代谢组响应特征 | 第87-99页 |
| 5.1 前言 | 第87页 |
| 5.2 材料与方法 | 第87-90页 |
| 5.2.1 幼虫培育与样品采集 | 第87-88页 |
| 5.2.2 样本前处理 | 第88页 |
| 5.2.3 GC/MS分析 | 第88-89页 |
| 5.2.4 质控样本 | 第89页 |
| 5.2.5 数据分析 | 第89页 |
| 5.2.6 代谢物的鉴定 | 第89-90页 |
| 5.2.7 代谢通路分析 | 第90页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第90-97页 |
| 5.3.1 色谱图 | 第90-91页 |
| 5.3.2 代谢物鉴定与PCA分析 | 第91-92页 |
| 5.3.3 变态后上调的差异代谢物 | 第92-95页 |
| 5.3.4 变态后下调的差异代谢物 | 第95-96页 |
| 5.3.5 差异代谢物的KEGG通路富集分析 | 第96-97页 |
| 5.4 本章小结 | 第97-99页 |
| 第六章 脉红螺变态过程中microRNA响应特征 | 第99-117页 |
| 6.1 前言 | 第99-100页 |
| 6.2 材料与方法 | 第100-104页 |
| 6.2.1 幼虫培育与样品采集 | 第100-101页 |
| 6.2.2 microRNA文库的构建 | 第101页 |
| 6.2.3 序列分析 | 第101-102页 |
| 6.2.4 靶基因预测及miRNA和mRNA关联分析 | 第102页 |
| 6.2.5 荧光定量PCR验证 | 第102-104页 |
| 6.3 实验结果 | 第104-112页 |
| 6.3.1 microRNA文库构建 | 第104-106页 |
| 6.3.2 microRNA差异表达分析 | 第106-108页 |
| 6.3.3 microRNA靶基因的GO和KEGGpathway富集分析 | 第108-110页 |
| 6.3.4 miRNA与其靶基因的qPCR验证 | 第110-112页 |
| 6.4 讨论 | 第112-116页 |
| 6.5 本章小结 | 第116-117页 |
| 第七章 荧光实时定量PCR内参基因的筛选 | 第117-143页 |
| 7.1 前言 | 第117-118页 |
| 7.2 材料与方法 | 第118-122页 |
| 7.2.1 幼虫培育与样品采集 | 第118页 |
| 7.2.2 总RNA提取和cDNA合成 | 第118-119页 |
| 7.2.3 确定候选的内参基因 | 第119页 |
| 7.2.4 引物设计和荧光定量PCR | 第119-120页 |
| 7.2.5 基因表达稳定性的分析 | 第120-122页 |
| 7.3 实验结果 | 第122-138页 |
| 7.3.1 候选内参基因的确定 | 第122-123页 |
| 7.3.2 实时荧光定量PCR | 第123-126页 |
| 7.3.3 不同组织基因表达稳定性分析 | 第126-132页 |
| 7.3.4 不同发育阶段基因表达稳定性分析 | 第132-137页 |
| 7.3.5 确定用于标准化的内参基因的最佳数目 | 第137-138页 |
| 7.4 讨论 | 第138-142页 |
| 7.5 本章小结 | 第142-143页 |
| 第八章 脉红螺变态过程中关键基因的克隆和表达 | 第143-167页 |
| 8.1 前言 | 第143-144页 |
| 8.2 材料与方法 | 第144-148页 |
| 8.2.1 样品采集 | 第144页 |
| 8.2.2 mRNA提取 | 第144页 |
| 8.2.3 cDNA全长的克隆 | 第144-146页 |
| 8.2.4 序列分析和进化树的构建 | 第146-147页 |
| 8.2.5 RealtimePCR | 第147页 |
| 8.2.6 免疫组化 | 第147-148页 |
| 8.3 实验结果 | 第148-162页 |
| 8.3.1 5-HTreceptor和NOS的cDNA全长和序列特征 | 第148-153页 |
| 8.3.2 5-HTreceptor和NOS物种间多重序列比对 | 第153-157页 |
| 8.3.3 5-HTreceptor和NOS系统进化树的构建 | 第157-159页 |
| 8.3.4 不同发育阶段5-HTreceptor和NOSmRNA水平的表达变化 | 第159-161页 |
| 8.3.5 5-HTreceptor的早期发生和在变态前幼虫中的免疫组化定位 | 第161-162页 |
| 8.4 讨论 | 第162-165页 |
| 8.5 本章小结 | 第165-167页 |
| 第九章 总结与展望 | 第167-173页 |
| 9.1 总结 | 第167-168页 |
| 9.2 创新性 | 第168-169页 |
| 9.3 存在问题 | 第169页 |
| 9.4 研究展望 | 第169-173页 |
| 参考文献 | 第173-189页 |
| 致谢 | 第189-191页 |
| 作者简历 | 第191-192页 |
| 攻读学位期间的学术成果 | 第192-194页 |
